转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr03G001252; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00025976-RA_Salv SmilChr03G001252 bZIP XP_057802461.1 MP00291 AATGGTCACGTGGCA

可能结合的靶基因

9321 个结合位点 6894 个候选靶基因 第 42 / 138 下载 TSV

上一页 42 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G003398 Chr02 NC_080388.1:55120256-55120270promoter 内 3896-3910 bp + 91 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 55120361-55122165(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GCACGCCACGTGGCG
SmilChr06G003237 Chr06 NC_080392.1:45078380-45078394promoter 内 3740-3754 bp + 247 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 45078641-45080191(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 ACAGTACACGTGGCA
SmilChr07G000814 Chr07 NC_080393.1:5743416-5743430promoter 内 3654-3668 bp - 333 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 5741070-5743083(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CAATTCCACGTGGCA
SmilChr02G002380 Chr02 NC_080388.1:41709097-41709111promoter 内 2992-3006 bp + 995 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 41706311-41708102(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TTCCACGTGAGCACT
SmilChr01G003642 Chr01 NC_080387.1:54923407-54923421promoter 内 2358-2372 bp + 1629 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 54919370-54921778(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTGTTACAC
SmilChr01G003644 Chr01 NC_080387.1:54923407-54923421promoter 内 2287-2301 bp + 1700 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 54925121-54932996(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GTGTAACACGTGGCA
SmilChr04G004031 Chr04 NC_080390.1:55569346-55569360promoter 内 2018-2032 bp + 1969 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 55563115-55567377(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTGGAACAT
SmilChr07G004034 Chr07 NC_080393.1:51517989-51518003promoter 内 1715-1729 bp + 2272 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 51512828-51515717(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTGGAATCG
SmilChr02G002795 Chr02 NC_080388.1:48034912-48034926promoter 内 1680-1694 bp - 2307 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 48037233-48039898(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTGGAATTG
SmilChr06G003236 Chr06 NC_080392.1:45078380-45078394promoter 内 1629-1643 bp + 2358 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 45073365-45076022(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTGTACTGT
SmilChr04G003425 Chr04 NC_080390.1:50845531-50845545promoter 内 1522-1536 bp - 2465 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 50848010-50851163(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTGTGTCAC
SmilChr02G000049 Chr02 NC_080388.1:651225-651239promoter 内 1462-1476 bp - 2525 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 653764-653844(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGCCACGTGGCGTCG
SmilChr02G000174 Chr02 NC_080388.1:2217377-2217391promoter 内 1461-1475 bp + 2526 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 2214771-2214851(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGCCACGTGGCGTCG
SmilChr06G000698 Chr06 NC_080392.1:6209733-6209747promoter 内 1239-1253 bp + 2748 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 6212495-6216121(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 ATACGTCACGTGGCG
SmilChr01G003775 Chr01 NC_080387.1:56159969-56159983promoter 内 1157-1171 bp + 2830 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 56154167-56157139(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AGCCACGTCGCCTTT
SmilChr02G003335 Chr02 NC_080388.1:54590791-54590805promoter 内 807-821 bp - 3180 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 54593985-54596290(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTCAAAAAA
SmilChr01G001275 Chr01 NC_080387.1:25490388-25490402promoter 内 178-192 bp + 3809 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 25486495-25486579(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTGGAAAGT
SmilChr01G003643 Chr01 NC_080387.1:54923407-54923421promoter 内 3978-3992 bp + 9 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 54923430-54924421(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GTGTAACACGTGGCA
SmilChr07G001135 Chr07 NC_080393.1:8526856-8526870promoter 内 3831-3845 bp - 156 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 8524402-8526700(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GACGCTTACGTGGCA
SmilChr08G000447 Chr08 NC_080394.1:3187111-3187125promoter 内 3744-3758 bp + 243 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 3184483-3186868(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTGAAATAT
SmilChr08G000233 Chr08 NC_080394.1:1594724-1594738promoter 内 3630-3644 bp - 357 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 1590925-1594367(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CTTGAAGACGTGGCG
SmilChr05G000279 Chr05 NC_080391.1:2172432-2172446promoter 内 3551-3565 bp + 436 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 2169076-2171996(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGCCACGTGACGTAT
SmilChr07G000988 Chr07 NC_080393.1:7203972-7203986promoter 内 3475-3489 bp - 512 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 7204498-7207878(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTGGATACC
SmilChr08G003150 Chr08 NC_080394.1:31970974-31970988promoter 内 3446-3460 bp + 541 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 31971529-31972113(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CATGCTTACGTGGCA
SmilChr08G000422 Chr08 NC_080394.1:3013609-3013623promoter 内 3426-3440 bp + 561 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 3011809-3013048(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGCCACGTCTTCAAG
SmilChr05G002702 Chr05 NC_080391.1:31007277-31007291promoter 内 3418-3432 bp - 569 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 31004746-31006708(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GGCAGTGACGTGGCG
SmilChr02G004301 Chr02 NC_080388.1:65382078-65382092promoter 内 3330-3344 bp - 657 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 65382749-65386575(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGCCACGTGACGTAT
SmilChr01G003657 Chr01 NC_080387.1:55010644-55010658promoter 内 3312-3326 bp + 675 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 55011333-55013487(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TTAACTGACGTGGCA
SmilChr05G001478 Chr05 NC_080391.1:13555703-13555717promoter 内 3287-3301 bp + 700 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 13556417-13563119(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TTTTTTGACGTGGCA
SmilChr01G005529 Chr01 NC_080387.1:72153919-72153933promoter 内 3101-3115 bp - 886 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 72149820-72153033(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TAGGGACACGTGGCC
SmilChr02G002700 Chr02 NC_080388.1:46802684-46802698promoter 内 3040-3054 bp + 947 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 46797249-46801737(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TTCCACGTGACCAGC
SmilChr05G001359 Chr05 NC_080391.1:12094938-12094952promoter 内 3014-3028 bp - 973 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 12095925-12100864(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTGTCGCAT
SmilChr07G003444 Chr07 NC_080393.1:38230205-38230219promoter 内 2884-2898 bp - 1103 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 38225197-38229102(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 ATTACAGACGTGGCA
SmilChr08G002131 Chr08 NC_080394.1:19187844-19187858promoter 内 2876-2890 bp - 1111 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 19188969-19192358(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGCCACGTGACGTAT
SmilChr03G002895 Chr03 NC_080389.1:45678675-45678689promoter 内 2764-2778 bp - 1223 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 45672567-45677452(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TTAACTGACGTGGCA
SmilChr01G003627 Chr01 NC_080387.1:54806716-54806730promoter 内 2748-2762 bp + 1239 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 54807969-54815816(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GTGTAACACGTGGCA
SmilChr06G003148 Chr06 NC_080392.1:44506066-44506080promoter 内 2663-2677 bp - 1324 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 44502839-44504742(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GTTAGAGACGTGGCG
SmilChr02G001776 Chr02 NC_080388.1:32534804-32534818promoter 内 2633-2647 bp + 1354 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 32536172-32538199(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 ATGCGACACGTGGCA
SmilChr01G003625 Chr01 NC_080387.1:54806716-54806730promoter 内 2627-2641 bp + 1360 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 54802917-54805356(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTGTTACAC
SmilChr08G003628 Chr08 NC_080394.1:39539965-39539979promoter 内 2508-2522 bp + 1479 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 39541458-39542245(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TTGTGACACGTGGCG
SmilChr08G003151 Chr08 NC_080394.1:31970974-31970988promoter 内 2482-2496 bp + 1505 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 31972493-31973788(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CATGCTTACGTGGCA
SmilChr04G003154 Chr04 NC_080390.1:48153801-48153815promoter 内 2383-2397 bp - 1604 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 48148335-48152197(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AAAGCTTACGTGGCA
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SmilChr03G000174 Chr03 NC_080389.1:1903528-1903542promoter 内 2225-2239 bp - 1762 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 1901080-1901766(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GTGACACACGTGGCA
SmilChr08G001783 Chr08 NC_080394.1:15031135-15031149promoter 内 2159-2173 bp - 1828 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 15032977-15036647(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTGACGTGA
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SmilChr07G003898 Chr07 NC_080393.1:49021588-49021602promoter 内 2028-2042 bp - 1959 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 49023561-49026218(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTGTCGTGC
SmilChr08G004789 Chr08 NC_080394.1:57196047-57196061promoter 内 1885-1899 bp + 2102 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 57198163-57199713(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 ATACGTCACGTGGCG
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SmilChr07G004389 Chr07 NC_080393.1:56470498-56470512promoter 内 1635-1649 bp + 2352 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 56465482-56468146(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GGCCACGTCTCCTCG