靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。
下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。
| 转录因子 ID | Family | Motifs | 候选靶基因 | 候选位点 | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|
| C2H2 | 1MP00592 |
8519 | 9901 | 查靶基因 | |
| C2H2 | 1MP00592 |
8519 | 9901 | 查靶基因 | |
| ARR-B | 1MP00010 |
8344 | 9778 | 查靶基因 | |
| NAC | 1MP00059 |
8333 | 9940 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00296 |
8304 | 9873 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00114 |
8151 | 9897 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00408 |
8149 | 9902 | 查靶基因 | |
| Nin-like | 1MP00449 |
8096 | 9453 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00209 |
8083 | 9910 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00627 |
8075 | 9835 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00450 |
8044 | 9901 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00558 |
8044 | 9762 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00096 |
8019 | 9914 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00476 |
7981 | 9904 | 查靶基因 | |
| NAC | 1MP00221 |
7965 | 9903 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00069 |
7882 | 9917 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00406 |
7839 | 9917 | 查靶基因 | |
| TALE | 1MP00670 |
7758 | 9906 | 查靶基因 | |
| SBP | 1MP00555 |
7648 | 9805 | 查靶基因 | |
| ARF | 1MP00021 |
7629 | 9812 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00132 |
7583 | 9926 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00609 |
7575 | 9941 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00529 |
7559 | 9247 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00510 |
7526 | 9799 | 查靶基因 | |
| NAC | 1MP00058 |
7440 | 9855 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00303 |
7416 | 9868 | 查靶基因 | |
| MYB_related | 1MP00565 |
7412 | 9785 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00026 |
7408 | 9854 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00071 |
7408 | 9764 | 查靶基因 | |
| ARF | 1MP00033 |
7406 | 9827 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00074 |
7396 | 9969 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00216 |
7342 | 9832 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00539 |
7338 | 9848 | 查靶基因 | |
| ARF | 1MP00574 |
7302 | 9846 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00464 |
7299 | 9864 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00315 |
7291 | 9567 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00525 |
7235 | 9838 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00171 |
7182 | 9833 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00506 |
7173 | 9818 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00272 |
7172 | 9889 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00184 |
7147 | 9840 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00647 |
7133 | 9953 | 查靶基因 | |
| C2H2 | 1MP00485 |
7130 | 8059 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00134 |
7078 | 8676 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00312 |
7006 | 8490 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00564 |
6984 | 9893 | 查靶基因 | |
| G2-like | 1MP00022 |
6959 | 9720 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00040 |
6920 | 9919 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00151 |
6907 | 9976 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00455 |
6900 | 9792 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00482 |
6899 | 8940 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00291 |
6894 | 9321 | 查靶基因 | |
| SBP | 1MP00307 |
6893 | 9755 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00195 |
6878 | 9832 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00388 |
6870 | 9774 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00318 |
6849 | 9413 | 查靶基因 | |
| SBP | 1MP00633 |
6833 | 8026 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00308 |
6805 | 9826 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00082 |
6784 | 9435 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00080 |
6766 | 9850 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00028 |
6764 | 9024 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00191 |
6736 | 9690 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00081 |
6729 | 9942 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00500 |
6697 | 9681 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00452 |
6671 | 7783 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00531 |
6663 | 9784 | 查靶基因 | |
| HD-ZIP | 1MP00200 |
6661 | 9930 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00034 |
6653 | 9929 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00660 |
6653 | 9929 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00055 |
6638 | 9685 | 查靶基因 | |
| SBP | 1MP00634 |
6619 | 7771 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00035 |
6618 | 9903 | 查靶基因 | |
| MYB_related | 1MP00568 |
6611 | 9696 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00039 |
6610 | 9936 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00284 |
6552 | 9774 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00422 |
6535 | 9791 | 查靶基因 | |
| ARF | 1MP00153 |
6534 | 9706 | 查靶基因 | |
| YABBY | 1MP00620 |
6504 | 9844 | 查靶基因 | |
| TCP | 1MP00169 |
6498 | 7295 | 查靶基因 | |
| G2-like | 1MP00252 |
6478 | 9780 | 查靶基因 | |
| NAC | 1MP00108 |
6458 | 9810 | 查靶基因 | |
| TCP | 1MP00062 |
6454 | 7249 | 查靶基因 | |
| RAV | 1MP00024 |
6450 | 9853 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00167 |
6439 | 9756 | 查靶基因 | |
| C2H2 | 1MP00416 |
6433 | 9716 | 查靶基因 | |
| C2H2 | 1MP00608 |
6398 | 9817 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00240 |
6368 | 9978 | 查靶基因 | |
| MYB_related | 1MP00607 |
6362 | 9718 | 查靶基因 | |
| Dof | 1MP00402 |
6278 | 9875 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00409 |
6252 | 8429 | 查靶基因 | |
| GRAS | 1MP00611 |
6232 | 9807 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00648 |
6170 | 9939 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00120 |
6144 | 7514 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00251 |
6140 | 9713 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00077 |
6125 | 9815 | 查靶基因 | |
| GATA | 1MP00130 |
6015 | 9821 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00508 |
5979 | 7481 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00260 |
5932 | 9706 | 查靶基因 | |
| HD-ZIP | 1MP00013 |
5927 | 9712 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00299 |
5919 | 9699 | 查靶基因 |
输入: SmilChr04G000040; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90
| TF ID | 新 Gene ID | 家族 | Protein | Motif | 共识序列 |
|---|---|---|---|---|---|
SMil_00000579-RA_Salv |
SmilChr04G000040 |
ERF | XP_057808382.1 |
MP00312 |
AATTGTCGGTGGAGT |
8490 个结合位点 7006 个候选靶基因 第 43 / 141 下载 TSV
| 靶基因 | 染色体 | 最佳结合位点 | 链方向 | 靶基因上游距离 | 结合可能性 | 启动子命中位点 | 基因区间 | TF | Motif | 匹配序列 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
SmilChr04G000169 |
Chr04 | NC_080390.1:1517369-1517383promoter 内 499-513 bp |
- | 3488 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.6/ 100 | 1 | 1506288-1513881(-) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
AAATGTCGGTGGAAC |
SmilChr02G002987 |
Chr02 | NC_080388.1:50499796-50499810promoter 内 469-483 bp |
- | 3518 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.6/ 100 | 1 | 50503328-50506990(+) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
ATCCCACCGACAAGA |
SmilChr04G002828 |
Chr04 | NC_080390.1:44368885-44368899promoter 内 420-434 bp |
- | 3567 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.6/ 100 | 1 | 44372466-44374581(+) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
CTTTCACCGACAGTA |
SmilChr04G004059 |
Chr04 | NC_080390.1:55744325-55744339promoter 内 406-420 bp |
- | 3581 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.6/ 100 | 1 | 55737166-55740744(-) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
GTCCGTCGGTGGACG |
SmilChr05G004146 |
Chr05 | NC_080391.1:55397683-55397697promoter 内 395-409 bp |
- | 3592 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.6/ 100 | 1 | 55401289-55402411(+) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
GCGGCGCCGACAAAC |
SmilChr08G004920 |
Chr08 | NC_080394.1:58142758-58142772promoter 内 390-404 bp |
+ | 3597 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.6/ 100 | 1 | 58136382-58139161(-) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
ACTGCACCGACGGAG |
SmilChr07G001126 |
Chr07 | NC_080393.1:8450112-8450126promoter 内 369-383 bp |
- | 3618 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.6/ 100 | 1 | 8442737-8446494(-) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
CGGTGACGGTGGAGA |
SmilChr04G003060 |
Chr04 | NC_080390.1:47181337-47181351promoter 内 248-262 bp |
+ | 3739 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.6/ 100 | 1 | 47175323-47177598(-) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
GCAGCGCCGACAACA |
SmilChr03G002612 |
Chr03 | NC_080389.1:41520326-41520340promoter 内 157-171 bp |
- | 3830 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.6/ 100 | 1 | 41524170-41524241(+) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
CCCGCGCCGACAAAC |
SmilChr03G002187 |
Chr03 | NC_080389.1:34165764-34165778promoter 内 145-159 bp |
- | 3842 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.6/ 100 | 1 | 34160780-34161922(-) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
GTTCGTCGGTGAAGG |
SmilChr05G002284 |
Chr05 | NC_080391.1:24584300-24584314promoter 内 123-137 bp |
- | 3864 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.6/ 100 | 1 | 24588178-24591246(+) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
CCAACACCGACGACG |
SmilChr03G004447 |
Chr03 | NC_080389.1:62605765-62605779promoter 内 55-69 bp |
- | 3932 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.6/ 100 | 1 | 62609711-62615303(+) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
CTATCACCGACAATA |
SmilChr04G000315 |
Chr04 | NC_080390.1:2889848-2889862promoter 内 36-50 bp |
+ | 3951 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.6/ 100 | 1 | 2893813-2896935(+) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
CGATGTCGGTGACTC |
SmilChr05G002344 |
Chr05 | NC_080391.1:25404725-25404739promoter 内 8-22 bp |
- | 3979 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.6/ 100 | 1 | 25399604-25400746(-) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
AGGCGTCGGTGCCAT |
SmilChr02G001258 |
Chr02 | NC_080388.1:23083279-23083293promoter 内 3346-3360 bp |
- | 641 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.5/ 100 | 4 | 23079644-23082638(-) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
AGATGTCGGTGATGA |
SmilChr02G001663 |
Chr02 | NC_080388.1:30853104-30853118promoter 内 3332-3346 bp |
+ | 655 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.5/ 100 | 2 | 30853773-30857355(+) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
AGATGTCGGTGATGA |
SmilChr01G003423 |
Chr01 | NC_080387.1:52884936-52884950promoter 内 3331-3345 bp |
- | 656 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.5/ 100 | 2 | 52885606-52887889(+) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
AAACCGCCGACAAAT |
SmilChr01G003492 |
Chr01 | NC_080387.1:53492092-53492106promoter 内 3323-3337 bp |
- | 664 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.5/ 100 | 2 | 53492770-53495252(+) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
AAACCGCCGACAAAT |
SmilChr07G001392 |
Chr07 | NC_080393.1:10787132-10787146promoter 内 3276-3290 bp |
+ | 711 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.5/ 100 | 2 | 10787857-10791542(+) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
CAGCGGCGGTGGAGG |
SmilChr06G002482 |
Chr06 | NC_080392.1:35672669-35672683promoter 内 3179-3193 bp |
- | 808 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.5/ 100 | 2 | 35670378-35671861(-) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
AGATGTCGGTGATGA |
SmilChr01G000357 |
Chr01 | NC_080387.1:7390630-7390644promoter 内 3162-3176 bp |
- | 825 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.5/ 100 | 2 | 7389110-7389805(-) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
AGATGTCGGTGATGA |
SmilChr01G001116 |
Chr01 | NC_080387.1:22802646-22802660promoter 内 3160-3174 bp |
- | 827 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.5/ 100 | 2 | 22800547-22801819(-) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
AGATGTCGGTGATGA |
SmilChr04G002774 |
Chr04 | NC_080390.1:43528460-43528474promoter 内 3160-3174 bp |
+ | 827 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.5/ 100 | 2 | 43529301-43530784(+) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
AGATGTCGGTGATGA |
SmilChr06G002978 |
Chr06 | NC_080392.1:42605755-42605769promoter 内 3156-3170 bp |
+ | 831 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.5/ 100 | 2 | 42606600-42607872(+) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
AGATGTCGGTGATGA |
SmilChr02G002813 |
Chr02 | NC_080388.1:48181631-48181645promoter 内 3154-3168 bp |
+ | 833 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.5/ 100 | 2 | 48182478-48183750(+) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
AGATGTCGGTGATGA |
SmilChr04G002319 |
Chr04 | NC_080390.1:37489245-37489259promoter 内 3110-3124 bp |
- | 877 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.5/ 100 | 2 | 37485007-37488368(-) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
AGATGTCGGTGATGA |
SmilChr08G004309 |
Chr08 | NC_080394.1:52811056-52811070promoter 内 2873-2887 bp |
+ | 1114 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.5/ 100 | 2 | 52812184-52815405(+) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
AACTGTCGGTGTTGG |
SmilChr05G004258 |
Chr05 | NC_080391.1:56388678-56388692promoter 内 1674-1688 bp |
+ | 2313 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.5/ 100 | 2 | 56382501-56386365(-) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
TTTTCACCGACACAT |
SmilChr02G000547 |
Chr02 | NC_080388.1:7589274-7589288promoter 内 1631-1645 bp |
- | 2356 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.5/ 100 | 2 | 7580826-7586918(-) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
CACCGTCGGTGGGCC |
SmilChr01G002453 |
Chr01 | NC_080387.1:42141962-42141976promoter 内 1094-1108 bp |
- | 2893 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.5/ 100 | 2 | 42133849-42139069(-) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
CGCTGTCGGTGAGCC |
SmilChr07G003648 |
Chr07 | NC_080393.1:43289290-43289304promoter 内 1069-1083 bp |
- | 2918 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.5/ 100 | 2 | 43283825-43286372(-) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
GCACGTCGGTGGTGG |
SmilChr04G003997 |
Chr04 | NC_080390.1:55339595-55339609promoter 内 727-741 bp |
+ | 3260 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.5/ 100 | 2 | 55342869-55345759(+) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
AGTTGTCGGCGCGGA |
SmilChr03G001971 |
Chr03 | NC_080389.1:28412659-28412673promoter 内 3792-3806 bp |
- | 195 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.5/ 100 | 1 | 28412868-28414304(+) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
ACTTCACCGACAGGT |
SmilChr02G000693 |
Chr02 | NC_080388.1:11028607-11028621promoter 内 3779-3793 bp |
- | 208 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.5/ 100 | 1 | 11028829-11030714(+) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
ACTTCACCGACGACA |
SmilChr03G002622 |
Chr03 | NC_080389.1:41609067-41609081promoter 内 3742-3756 bp |
+ | 245 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.5/ 100 | 1 | 41609326-41610194(+) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
ATGTGTCGGTGAATC |
SmilChr06G003176 |
Chr06 | NC_080392.1:44689107-44689121promoter 内 3529-3543 bp |
- | 458 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.5/ 100 | 1 | 44689579-44695390(+) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
CCTCCACCGCCGCTG |
SmilChr06G003174 |
Chr06 | NC_080392.1:44689107-44689121promoter 内 3464-3478 bp |
- | 523 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.5/ 100 | 1 | 44673883-44688584(-) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
CAGCGGCGGTGGAGG |
SmilChr08G004832 |
Chr08 | NC_080394.1:57583943-57583957promoter 内 3406-3420 bp |
- | 581 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.5/ 100 | 1 | 57584538-57586921(+) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
ATGGCACCGACAATT |
SmilChr01G003289 |
Chr01 | NC_080387.1:51592019-51592033promoter 内 3319-3333 bp |
- | 668 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.5/ 100 | 1 | 51592701-51596225(+) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
CCGACGCCGACAAAT |
SmilChr04G002151 |
Chr04 | NC_080390.1:34558385-34558399promoter 内 3280-3294 bp |
+ | 707 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.5/ 100 | 1 | 34555768-34557678(-) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
CCTCCACCGCCGCTG |
SmilChr08G002929 |
Chr08 | NC_080394.1:29338011-29338025promoter 内 3182-3196 bp |
- | 805 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.5/ 100 | 1 | 29338830-29340604(+) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
ACATCGCCGACAACC |
SmilChr03G000770 |
Chr03 | NC_080389.1:8803882-8803896promoter 内 3158-3172 bp |
+ | 829 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.5/ 100 | 1 | 8804725-8807551(+) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
GGATGTCGGTGGTTT |
SmilChr08G004593 |
Chr08 | NC_080394.1:55503656-55503670promoter 内 3132-3146 bp |
+ | 855 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.5/ 100 | 1 | 55500520-55502801(-) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
GCGACACCGACAGCC |
SmilChr01G002998 |
Chr01 | NC_080387.1:48930386-48930400promoter 内 3011-3025 bp |
+ | 976 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.5/ 100 | 1 | 48927161-48929410(-) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
CCTCCACCGCCGCTG |
SmilChr03G002621 |
Chr03 | NC_080389.1:41609067-41609081promoter 内 2981-2995 bp |
+ | 1006 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.5/ 100 | 1 | 41602122-41608061(-) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
GATTCACCGACACAT |
SmilChr06G000271 |
Chr06 | NC_080392.1:1829880-1829894promoter 内 2945-2959 bp |
- | 1042 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.5/ 100 | 1 | 1830936-1842636(+) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
GATCCACCGACGGCA |
SmilChr08G000264 |
Chr08 | NC_080394.1:1812144-1812158promoter 内 2579-2593 bp |
- | 1408 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.5/ 100 | 1 | 1813566-1815410(+) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
CCATCGCCGACAAGA |
SmilChr01G003235 |
Chr01 | NC_080387.1:51105660-51105674promoter 内 2568-2582 bp |
- | 1419 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.5/ 100 | 1 | 51101765-51104241(-) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
CCCTGTCGGTAGCGT |
SmilChr03G001441 |
Chr03 | NC_080389.1:17147082-17147096promoter 内 2507-2521 bp |
+ | 1480 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.5/ 100 | 1 | 17144939-17145602(-) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
CTCTCACCGACGACG |
SmilChr05G000683 |
Chr05 | NC_080391.1:5195685-5195699promoter 内 2491-2505 bp |
- | 1496 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 93.5/ 100 | 1 | 5191815-5194189(-) |
SMil_00000579-RA_Salv |
MP00312 |
ATGCGTCGGTGCTGA |