转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G004447; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027346-RA_Salv SmilChr02G004447 HD-ZIP XP_057797242.1 MP00200 AAAAGTAATGATTAC

可能结合的靶基因

9930 个结合位点 6661 个候选靶基因 第 49 / 134 下载 TSV

上一页 49 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G000003 Chr01 NC_080387.1:83606-83620promoter 内 710-724 bp - 3277 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 77269-80329(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GACAATGATGATTAT
SmilChr01G002565 Chr01 NC_080387.1:43759093-43759107promoter 内 704-718 bp + 3283 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 43762390-43764524(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AGTTGCAATGATTGA
SmilChr01G003653 Chr01 NC_080387.1:54987869-54987883promoter 内 486-500 bp + 3501 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 54991384-54993922(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GGGCCTAATGATGAT
SmilChr02G001394 Chr02 NC_080388.1:26488027-26488041promoter 内 452-466 bp - 3535 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 26482916-26484492(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTGGACAATGATTGC
SmilChr01G004974 Chr01 NC_080387.1:67818874-67818888promoter 内 377-391 bp + 3610 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 67822498-67823169(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAGTTAATGATTAC
SmilChr02G000958 Chr02 NC_080388.1:16668011-16668025promoter 内 377-391 bp + 3610 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 16671635-16675520(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTTTATAATGATGAT
SmilChr02G004462 Chr02 NC_080388.1:67041469-67041483promoter 内 358-372 bp - 3629 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 67036686-67037840(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTGGACAATGATTGC
SmilChr01G001523 Chr01 NC_080387.1:29179575-29179589promoter 内 347-361 bp + 3640 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 29183229-29186252(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTGGACAATGATTGC
SmilChr01G003077 Chr01 NC_080387.1:49612919-49612933promoter 内 85-99 bp + 3902 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 49605095-49609017(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATCATGCTC
SmilChr02G005444 Chr02 NC_080388.1:74815566-74815580promoter 内 1645-1659 bp - 2342 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 6 74817922-74820746(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTCATTATTACTTTT
SmilChr01G005118 Chr01 NC_080387.1:68980333-68980347promoter 内 2019-2033 bp + 1968 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 4 68977183-68978365(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTAGTTAA
SmilChr01G005174 Chr01 NC_080387.1:69488289-69488303promoter 内 1725-1739 bp + 2262 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 4 69482550-69486027(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCAATCATTACGTCA
SmilChr03G000768 Chr03 NC_080389.1:8790215-8790229promoter 内 607-621 bp + 3380 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 4 8780555-8786835(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTAATATC
SmilChr01G002595 Chr01 NC_080387.1:44133104-44133118promoter 内 3323-3337 bp + 664 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 3 44133782-44137281(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATTAATGATGAC
SmilChr03G003019 Chr03 NC_080389.1:47103064-47103078promoter 内 3207-3221 bp - 780 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 3 47097084-47102284(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAATTTAATGATGAT
SmilChr01G004425 Chr01 NC_080387.1:62351216-62351230promoter 内 3141-3155 bp - 846 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 3 62352076-62356845(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTATCATTACATTT
SmilChr02G003282 Chr02 NC_080388.1:54135390-54135404promoter 内 2953-2967 bp - 1034 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 3 54133913-54134356(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAAAGTAATTATGAT
SmilChr01G005510 Chr01 NC_080387.1:71949524-71949538promoter 内 2817-2831 bp + 1170 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 3 71950708-71954175(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTGGGCAATGATTAG
SmilChr01G001082 Chr01 NC_080387.1:22236342-22236356promoter 内 2775-2789 bp + 1212 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 3 22237568-22244887(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTGGGCAATGATTAG
SmilChr02G003283 Chr02 NC_080388.1:54135390-54135404promoter 内 2474-2488 bp - 1513 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 3 54136917-54140515(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATAATTACTTTT
SmilChr01G002694 Chr01 NC_080387.1:45194578-45194592promoter 内 2122-2136 bp + 1865 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 3 45196457-45199085(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATGCATAATGATTAT
SmilChr03G000617 Chr03 NC_080389.1:6816941-6816955promoter 内 1082-1096 bp + 2905 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 3 6812419-6814036(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCCATCATTAGAATT
SmilChr01G004424 Chr01 NC_080387.1:62351216-62351230promoter 内 913-927 bp - 3074 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 3 62345826-62348142(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAATGTAATGATAAT
SmilChr02G000871 Chr02 NC_080388.1:14998091-14998105promoter 内 289-303 bp + 3698 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 3 15001803-15003549(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTGGGCAATGATTAG
SmilChr01G005175 Chr01 NC_080387.1:69488289-69488303promoter 内 254-268 bp + 3733 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 3 69492036-69501572(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TGACGTAATGATTGA
SmilChr01G005707 Chr01 NC_080387.1:73301494-73301508promoter 内 224-238 bp - 3763 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 3 73305271-73306354(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACAATCATTATCACA
SmilChr01G002523 Chr01 NC_080387.1:43196423-43196437promoter 内 3910-3924 bp - 77 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 43196514-43200220(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTAATATT
SmilChr03G002731 Chr03 NC_080389.1:43372970-43372984promoter 内 3910-3924 bp - 77 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 43368980-43372893(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CATGATAATGATGGA
SmilChr01G005296 Chr01 NC_080387.1:70274262-70274276promoter 内 3865-3879 bp - 122 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 70274398-70275173(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTAATTTT
SmilChr01G005594 Chr01 NC_080387.1:72573681-72573695promoter 内 3829-3843 bp + 158 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 72573853-72574621(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAAATTAATGATTAT
SmilChr01G003253 Chr01 NC_080387.1:51240711-51240725promoter 内 3773-3787 bp - 214 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 51240939-51243824(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTATCATTACATTT
SmilChr02G000271 Chr02 NC_080388.1:3497815-3497829promoter 内 3719-3733 bp - 268 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 3494559-3497547(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CAGTGTGATGATTAG
SmilChr02G002960 Chr02 NC_080388.1:50133429-50133443promoter 内 3693-3707 bp - 294 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 50133737-50134500(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATTATTGCC
SmilChr03G002628 Chr03 NC_080389.1:41710370-41710384promoter 内 3678-3692 bp + 309 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 41710693-41718773(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAATTTAATGATGAT
SmilChr02G001589 Chr02 NC_080388.1:29623783-29623797promoter 内 3542-3556 bp + 445 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 29620102-29623338(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTAATTTT
SmilChr02G001520 Chr02 NC_080388.1:28309407-28309421promoter 内 3458-3472 bp + 529 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 28309950-28310736(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GAAAGTAATTATTAT
SmilChr03G001268 Chr03 NC_080389.1:14717672-14717686promoter 内 3337-3351 bp - 650 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 14718336-14720534(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCCATCATTAGAATT
SmilChr03G000243 Chr03 NC_080389.1:2872366-2872380promoter 内 3301-3315 bp - 686 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 2873066-2879271(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATAATTACTTTT
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SmilChr02G004894 Chr02 NC_080388.1:70964644-70964658promoter 内 2895-2909 bp + 1092 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 70965750-70969187(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTGGTAATGATAAC
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SmilChr03G003255 Chr03 NC_080389.1:50447840-50447854promoter 内 2596-2610 bp + 1391 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 50441858-50446449(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTAATCATTGTCGCA
SmilChr02G001203 Chr02 NC_080388.1:22173592-22173606promoter 内 2424-2438 bp + 1563 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 22175169-22180780(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACATATAATGATTAA
SmilChr03G002925 Chr03 NC_080389.1:46004705-46004719promoter 内 2044-2058 bp + 1943 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 46006662-46009630(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACTTGTAATGATTGA
SmilChr01G006178 Chr01 NC_080387.1:77318573-77318587promoter 内 2042-2056 bp + 1945 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 77314198-77316628(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GACATCATTATCTTC