转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 50 / 143 下载 TSV

上一页 50 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr07G000144 Chr07 NC_080393.1:873755-873766promoter 内 1271-1282 bp + 2719 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 864747-871036(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCGA
SmilChr06G002035 Chr06 NC_080392.1:26616614-26616625promoter 内 1250-1261 bp - 2740 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 26611775-26613874(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTCCAGCTGTG
SmilChr05G001656 Chr05 NC_080391.1:15653511-15653522promoter 内 1175-1186 bp + 2815 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 15656337-15656442(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTCTT
SmilChr02G003295 Chr02 NC_080388.1:54230245-54230256promoter 内 1172-1183 bp + 2818 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 54225546-54227427(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCCA
SmilChr05G003283 Chr05 NC_080391.1:42826856-42826867promoter 内 1141-1152 bp - 2849 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 42829716-42832894(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCGT
SmilChr03G003977 Chr03 NC_080389.1:58793065-58793076promoter 内 1055-1066 bp - 2935 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 58788338-58790130(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTGAG
SmilChr04G003208 Chr04 NC_080390.1:48933326-48933337promoter 内 999-1010 bp - 2991 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 48936328-48941246(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTCTA
SmilChr02G003296 Chr02 NC_080388.1:54230245-54230256promoter 内 799-810 bp + 3191 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 54233447-54235258(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTGAA
SmilChr01G005510 Chr01 NC_080387.1:71947379-71947390promoter 内 672-683 bp - 3318 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 71950708-71954175(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGAGC
SmilChr02G001849 Chr02 NC_080388.1:33706924-33706935promoter 内 667-678 bp - 3323 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 33710258-33717314(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAGCTGTCAC
SmilChr02G005155 Chr02 NC_080388.1:72922414-72922425promoter 内 487-498 bp - 3503 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 72916532-72918911(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTGAA
SmilChr07G000160 Chr07 NC_080393.1:961620-961631promoter 内 79-90 bp + 3911 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 955673-957709(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCGA
SmilChr05G003999 Chr05 NC_080391.1:53873811-53873822promoter 内 3018-3029 bp - 972 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 4 53870814-53872839(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTGAG
SmilChr03G000558 Chr03 NC_080389.1:6054817-6054828promoter 内 2774-2785 bp - 1216 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 3 6056044-6087403(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCGT
SmilChr01G004343 Chr01 NC_080387.1:61595204-61595215promoter 内 732-743 bp - 3258 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 3 61598473-61602049(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTAAA
SmilChr06G002296 Chr06 NC_080392.1:33139471-33139482promoter 内 107-118 bp + 3883 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 3 33143365-33147033(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTCCAGCTGTG
SmilChr03G003591 Chr03 NC_080389.1:54564825-54564836promoter 内 3779-3790 bp + 211 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 54565047-54570287(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGACAGCTATC
SmilChr06G001961 Chr06 NC_080392.1:24457025-24457036promoter 内 3192-3203 bp + 798 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 24454882-24456227(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGAGA
SmilChr07G003691 Chr07 NC_080393.1:44437143-44437154promoter 内 3192-3203 bp - 798 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 44433640-44436345(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTCCAGCTGTG
SmilChr03G004478 Chr03 NC_080389.1:62890384-62890395promoter 内 3049-3060 bp + 941 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 62888347-62889443(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTAGCTGTCGT
SmilChr02G001587 Chr02 NC_080388.1:29614446-29614457promoter 内 2690-2701 bp - 1300 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 29615757-29616318(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAGCTGTCAA
SmilChr02G001575 Chr02 NC_080388.1:29254684-29254695promoter 内 2567-2578 bp + 1423 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 29251984-29253261(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCGT
SmilChr01G002140 Chr01 NC_080387.1:37390124-37390135promoter 内 2563-2574 bp + 1427 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 37385728-37388697(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGAGC
SmilChr01G002141 Chr01 NC_080387.1:37403206-37403217promoter 内 2554-2565 bp + 1436 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 37398801-37401770(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGAGC
SmilChr07G000858 Chr07 NC_080393.1:6107765-6107776promoter 内 2218-2229 bp + 1772 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 6109548-6110787(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTCCAGCTGTG
SmilChr05G003244 Chr05 NC_080391.1:41772673-41772684promoter 内 2204-2215 bp + 1786 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 41769709-41770887(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGAGA
SmilChr05G003292 Chr05 NC_080391.1:43051228-43051239promoter 内 2182-2193 bp + 1808 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 43046187-43049420(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGAGA
SmilChr04G001113 Chr04 NC_080390.1:15977967-15977978promoter 内 2156-2167 bp + 1834 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 15973468-15976133(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGAGC
SmilChr01G004569 Chr01 NC_080387.1:63737586-63737597promoter 内 2020-2031 bp + 1970 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 63739567-63742028(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTCCAGCTGTT
SmilChr04G002413 Chr04 NC_080390.1:38748453-38748464promoter 内 1956-1967 bp + 2034 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 38750498-38751793(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTACAGCTGAC
SmilChr06G001968 Chr06 NC_080392.1:24813377-24813388promoter 内 1922-1933 bp - 2068 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 24803099-24811309(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTCCAGCTGTG
SmilChr04G004006 Chr04 NC_080390.1:55402808-55402819promoter 内 1774-1785 bp + 2216 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 55405035-55406062(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTGAT
SmilChr01G003891 Chr01 NC_080387.1:57217238-57217249promoter 内 1606-1617 bp + 2384 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 57213067-57214854(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGAGC
SmilChr07G002502 Chr07 NC_080393.1:23743006-23743017promoter 内 1561-1572 bp - 2429 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 23733378-23740577(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCAT
SmilChr01G002142 Chr01 NC_080387.1:37403206-37403217promoter 内 1553-1564 bp + 2437 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 37405654-37407448(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTCCAGCTGTT
SmilChr08G002039 Chr08 NC_080394.1:18196025-18196036promoter 内 1476-1487 bp + 2514 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 18190188-18193511(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGAGA
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SmilChr01G001941 Chr01 NC_080387.1:34585302-34585313promoter 内 1226-1237 bp + 2764 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 34588077-34591403(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTAAC
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SmilChr02G000137 Chr02 NC_080388.1:1857233-1857244promoter 内 1032-1043 bp - 2958 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 1860202-1861492(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAGCTGTCAA
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SmilChr05G000859 Chr05 NC_080391.1:6791037-6791048promoter 内 809-820 bp - 3181 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 6794229-6794827(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAGCTGTCAA
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SmilChr01G005360 Chr01 NC_080387.1:70827130-70827141promoter 内 740-751 bp - 3250 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 70830391-70831054(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAGCTGTCAA
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SmilChr01G004309 Chr01 NC_080387.1:61270058-61270069promoter 内 371-382 bp + 3619 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 61265873-61266439(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAGCTGTCAA
SmilChr01G003183 Chr01 NC_080387.1:50604640-50604651promoter 内 260-271 bp + 3730 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 50600254-50600910(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAGCTGTCAA
SmilChr08G002945 Chr08 NC_080394.1:29454184-29454195promoter 内 168-179 bp - 3822 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 29458017-29462936(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGAGCTGTCAT
SmilChr03G004200 Chr03 NC_080389.1:60632672-60632683promoter 内 3959-3970 bp - 31 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 60630235-60632641(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTAAC