转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004199; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010571-RA_Salv SmilChr01G004199 bHLH XP_057782208.1 MP00074 AGAAGGTCACGTGG

可能结合的靶基因

9969 个结合位点 7396 个候选靶基因 第 51 / 148 下载 TSV

上一页 51 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G002583 Chr03 NC_080389.1:41092672-41092685promoter 内 3859-3872 bp - 129 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 41092814-41094075(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGGACTAC
SmilChr06G000003 Chr06 NC_080392.1:123699-123712promoter 内 3809-3822 bp + 179 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 123891-131701(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATCACCGCACGTGG
SmilChr07G001510 Chr07 NC_080393.1:12041584-12041597promoter 内 3803-3816 bp - 185 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 12041782-12053528(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGACGCGTA
SmilChr08G000838 Chr08 NC_080394.1:6205694-6205707promoter 内 3371-3384 bp + 617 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 6200734-6205077(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTTTCTCC
SmilChr05G004297 Chr05 NC_080391.1:56694103-56694116promoter 内 3172-3185 bp + 816 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 56691114-56693287(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGACTCACA
SmilChr07G001509 Chr07 NC_080393.1:12041584-12041597promoter 内 3079-3092 bp - 909 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 12038522-12040675(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TACGCGTCACGTGT
SmilChr07G001547 Chr07 NC_080393.1:12567731-12567744promoter 内 2550-2563 bp - 1438 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 12569182-12580651(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGACGCGTA
SmilChr05G000777 Chr05 NC_080391.1:6078510-6078523promoter 内 2511-2524 bp + 1477 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 6074624-6077033(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGACTCACA
SmilChr06G000507 Chr06 NC_080392.1:4187919-4187932promoter 内 2389-2402 bp - 1599 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 4189531-4199209(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTGCGCCG
SmilChr06G000995 Chr06 NC_080392.1:9824330-9824343promoter 内 2158-2171 bp + 1830 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 9821263-9822500(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGACTTATT
SmilChr02G004430 Chr02 NC_080388.1:66654169-66654182promoter 内 2082-2095 bp - 1906 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 66646396-66652263(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCACTGCACGTGG
SmilChr03G002285 Chr03 NC_080389.1:36033346-36033359promoter 内 1400-1413 bp + 2588 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 36027752-36030758(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGACCTATC
SmilChr08G000346 Chr08 NC_080394.1:2404303-2404316promoter 内 1353-1366 bp + 2635 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 2400007-2401668(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGACTGCG
SmilChr03G000966 Chr03 NC_080389.1:10883868-10883881promoter 内 1346-1359 bp - 2642 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 10886523-10889652(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAAGTTCA
SmilChr07G004487 Chr07 NC_080393.1:57413205-57413218promoter 内 1157-1170 bp - 2831 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 57406379-57410374(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CACATGCCACGTGG
SmilChr04G003549 Chr04 NC_080390.1:51826337-51826350promoter 内 1120-1133 bp + 2868 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 51829218-51840224(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGAAACTCACGTGG
SmilChr04G002692 Chr04 NC_080390.1:42326569-42326582promoter 内 898-911 bp + 3090 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 42322783-42323479(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGACACAAT
SmilChr07G003278 Chr07 NC_080393.1:34517753-34517766promoter 内 439-452 bp + 3549 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 34521315-34523091(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GAGCTGCCACGTGG
SmilChr04G003674 Chr04 NC_080390.1:53205511-53205524promoter 内 266-279 bp - 3722 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 53200836-53201789(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGATTGCCACGTGG
SmilChr01G004699 Chr01 NC_080387.1:65099648-65099661promoter 内 220-233 bp + 3768 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 65094038-65095880(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCGGCGAG
SmilChr01G002712 Chr01 NC_080387.1:45368133-45368146promoter 内 3923-3936 bp - 65 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 45368211-45371658(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCAATCA
SmilChr01G005422 Chr01 NC_080387.1:71413956-71413969promoter 内 3832-3845 bp - 156 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 71407830-71413800(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGATTGCCACGTGG
SmilChr01G002912 Chr01 NC_080387.1:47845347-47845360promoter 内 3684-3697 bp - 304 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 47841294-47845043(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTCGGAGCACGTGG
SmilChr06G001499 Chr06 NC_080392.1:16055752-16055765promoter 内 3112-3125 bp + 876 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 16050764-16054876(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGTGTTCC
SmilChr04G001478 Chr04 NC_080390.1:24219120-24219133promoter 内 3059-3072 bp - 929 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 24220062-24220832(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGACACGAT
SmilChr01G000888 Chr01 NC_080387.1:18932773-18932786promoter 内 2992-3005 bp + 996 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 18933782-18935224(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GAACTGTCACGTGG
SmilChr01G005405 Chr01 NC_080387.1:71308281-71308294promoter 内 2969-2982 bp - 1019 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 71305825-71307262(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GATTCGTCACGTGG
SmilChr05G002061 Chr05 NC_080391.1:21482140-21482153promoter 内 2870-2883 bp - 1118 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 21475153-21481022(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GATTCGTCACGTGG
SmilChr05G001477 Chr05 NC_080391.1:13551168-13551181promoter 内 2828-2841 bp - 1160 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 13540999-13550008(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GAGCTGGCACGTGG
SmilChr03G003003 Chr03 NC_080389.1:46878704-46878717promoter 内 2592-2605 bp + 1396 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 46880113-46883906(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GACTTGACACGTGG
SmilChr02G003037 Chr02 NC_080388.1:51077857-51077870promoter 内 2589-2602 bp + 1399 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 51079269-51080318(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGAAGTACACGTGG
SmilChr07G000107 Chr07 NC_080393.1:585500-585513promoter 内 2571-2584 bp + 1417 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 586930-590538(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTCCAGTCACGTGC
SmilChr04G004148 Chr04 NC_080390.1:56205638-56205651promoter 内 2451-2464 bp - 1537 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 56207188-56209220(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCCAGCTC
SmilChr02G003436 Chr02 NC_080388.1:55598197-55598210promoter 内 2406-2419 bp + 1582 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 55589245-55596615(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGACCGAAT
SmilChr01G004965 Chr01 NC_080387.1:67747047-67747060promoter 内 2289-2302 bp + 1699 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 67742964-67745348(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGATTCCCT
SmilChr07G001121 Chr07 NC_080393.1:8341475-8341488promoter 内 2172-2185 bp - 1816 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 8336819-8339659(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAGGGCTCACGTGC
SmilChr04G001479 Chr04 NC_080390.1:24219120-24219133promoter 内 2096-2109 bp - 1892 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 24221025-24221546(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGACACGAT
SmilChr01G000890 Chr01 NC_080387.1:18943634-18943647promoter 内 2042-2055 bp + 1946 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 18941142-18941688(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGACAGTTC
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SmilChr01G002934 Chr01 NC_080387.1:48102338-48102351promoter 内 1755-1768 bp - 2233 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 48104584-48106855(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTACTCTC
SmilChr02G002795 Chr02 NC_080388.1:48034908-48034921promoter 内 1676-1689 bp + 2312 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 48037233-48039898(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGATTGCCACGTGG
SmilChr04G004146 Chr04 NC_080390.1:56205638-56205651promoter 内 1442-1455 bp - 2546 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 56201896-56203092(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GAGCTGGCACGTGG
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SmilChr01G004631 Chr01 NC_080387.1:64354763-64354776promoter 内 1109-1122 bp + 2879 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 64349703-64351884(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGACACCAT
SmilChr08G001167 Chr08 NC_080394.1:9350511-9350524promoter 内 1108-1121 bp + 2880 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 9353404-9354635(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGTGCTTCACGTGG
SmilChr05G001927 Chr05 NC_080391.1:19554540-19554553promoter 内 1080-1093 bp - 2908 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 19557461-19560655(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGAGCTGCA
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SmilChr01G001348 Chr01 NC_080387.1:26748265-26748278promoter 内 785-798 bp + 3203 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 26751481-26755073(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGAGGTGCACGTGG