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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004199; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010571-RA_Salv SmilChr01G004199 bHLH XP_057782208.1 MP00074 AGAAGGTCACGTGG

可能结合的靶基因

9969 个结合位点 7396 个候选靶基因 第 52 / 148 下载 TSV

上一页 52 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G004336 Chr02 NC_080388.1:65620525-65620538promoter 内 663-676 bp - 3325 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 65613795-65617200(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GACAGTACACGTGG
SmilChr06G001323 Chr06 NC_080392.1:13739095-13739108promoter 内 556-569 bp - 3432 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 13742540-13745052(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAACCGAA
SmilChr03G001809 Chr03 NC_080389.1:24704328-24704341promoter 内 487-500 bp + 3501 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 24693455-24700827(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTGTTCTC
SmilChr01G001376 Chr01 NC_080387.1:27116041-27116054promoter 内 356-369 bp - 3632 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 27119686-27126433(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGACACGAT
SmilChr06G003041 Chr06 NC_080392.1:43268201-43268214promoter 内 232-245 bp + 3756 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 43261512-43264445(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAAGCTTC
SmilChr01G002062 Chr01 NC_080387.1:36452857-36452870promoter 内 67-80 bp + 3921 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 36456791-36460998(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATCGTGTCACGTGT
SmilChr06G001324 Chr06 NC_080392.1:13739095-13739108promoter 内 3-16 bp - 3985 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 13743093-13743216(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAACCGAA
SmilChr05G003661 Chr05 NC_080391.1:49334047-49334060promoter 内 3347-3360 bp - 641 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 4 49329933-49333406(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAAAAGCCACGTGG
SmilChr08G000939 Chr08 NC_080394.1:6978292-6978305promoter 内 3777-3790 bp + 211 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 3 6978516-6979631(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CTGCCGCCACGTGG
SmilChr03G002837 Chr03 NC_080389.1:44912301-44912314promoter 内 3931-3944 bp + 57 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 44912371-44919831(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAGTGGCCACGTGG
SmilChr04G003208 Chr04 NC_080390.1:48936237-48936250promoter 内 3910-3923 bp + 78 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 48936328-48941246(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGACAGCCACGTGG
SmilChr04G003008 Chr04 NC_080390.1:46453306-46453319promoter 内 3847-3860 bp - 141 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 46448364-46453165(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGACAGCCACGTGG
SmilChr01G002071 Chr01 NC_080387.1:36581779-36581792promoter 内 3811-3824 bp + 177 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 36581969-36584586(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGCAGGTCACGCGG
SmilChr04G002629 Chr04 NC_080390.1:41697670-41697683promoter 内 3707-3720 bp - 281 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 41695722-41697389(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TAAAAGACACGTGG
SmilChr06G000249 Chr06 NC_080392.1:1653192-1653205promoter 内 2716-2729 bp - 1272 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 1654477-1655494(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCACATA
SmilChr01G005141 Chr01 NC_080387.1:69194717-69194730promoter 内 2177-2190 bp - 1811 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 69196541-69199173(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCTTTTT
SmilChr04G004045 Chr04 NC_080390.1:55669807-55669820promoter 内 2039-2052 bp + 1949 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 55671769-55674743(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATAGCCCCACGTGG
SmilChr08G000458 Chr08 NC_080394.1:3291256-3291269promoter 内 1481-1494 bp + 2507 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 3285619-3288749(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCATTTT
SmilChr04G002890 Chr04 NC_080390.1:45118069-45118082promoter 内 1206-1219 bp - 2782 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 45111525-45115287(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATTGCGTCACGTGA
SmilChr03G001461 Chr03 NC_080389.1:17459221-17459234promoter 内 1186-1199 bp + 2802 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 17462036-17467359(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GATTGGACACGTGG
SmilChr05G000857 Chr05 NC_080391.1:6777436-6777449promoter 内 1004-1017 bp - 2984 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 6771295-6774452(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGTTGGGCACGTGG
SmilChr03G002744 Chr03 NC_080389.1:43601910-43601923promoter 内 676-689 bp - 3312 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 43605235-43608348(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGACTTTAC
SmilChr02G002844 Chr02 NC_080388.1:48574561-48574574promoter 内 480-493 bp + 3508 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 48578082-48580292(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGACAGCCACGTGG
SmilChr06G002635 Chr06 NC_080392.1:37957445-37957458promoter 内 436-449 bp - 3552 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 37952896-37953893(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCGCACCACGTGG
SmilChr01G002191 Chr01 NC_080387.1:38057808-38057821promoter 内 343-356 bp + 3645 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 2 38061466-38062409(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATCCTGACACGTGG
SmilChr02G004733 Chr02 NC_080388.1:69565350-69565363promoter 内 3850-3863 bp - 138 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 69561938-69565212(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGACTGTCACGTGA
SmilChr07G000009 Chr07 NC_080393.1:39590-39603promoter 内 3746-3759 bp + 242 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 32209-39348(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGACTCAAT
SmilChr02G003207 Chr02 NC_080388.1:53236153-53236166promoter 内 3728-3741 bp + 260 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 53233294-53235893(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCACATT
SmilChr04G001975 Chr04 NC_080390.1:32004039-32004052promoter 内 3717-3730 bp + 271 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 32002398-32003768(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGACTACAT
SmilChr03G004170 Chr03 NC_080389.1:60451156-60451169promoter 内 3609-3622 bp - 379 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 60447240-60450777(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGTTAGTCACGTGC
SmilChr01G006186 Chr01 NC_080387.1:77406890-77406903promoter 内 3308-3321 bp + 680 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 77401606-77406210(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTGCCAAT
SmilChr01G005798 Chr01 NC_080387.1:74057712-74057725promoter 内 3129-3142 bp - 859 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 74058584-74062104(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAGCCCAG
SmilChr07G004730 Chr07 NC_080393.1:60184057-60184070promoter 内 3091-3104 bp + 897 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 60184967-60188167(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGAATGTCACGTGT
SmilChr02G001045 Chr02 NC_080388.1:18509880-18509893promoter 内 3080-3093 bp - 908 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 18507736-18508972(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGCGAATCACGTGC
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SmilChr04G003871 Chr04 NC_080390.1:54602659-54602672promoter 内 2921-2934 bp + 1067 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 54603739-54615388(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGCGAATCACGTGC
SmilChr01G003410 Chr01 NC_080387.1:52758943-52758956promoter 内 2831-2844 bp - 1157 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 52755441-52757786(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TAAAAGACACGTGG
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SmilChr05G004392 Chr05 NC_080391.1:57365850-57365863promoter 内 2816-2829 bp - 1172 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 57363760-57364678(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAAAAGGCACGTGG
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SmilChr07G004352 Chr07 NC_080393.1:56066686-56066699promoter 内 2690-2703 bp + 1298 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 56067997-56070217(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TAAATGACACGTGG
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SmilChr01G005800 Chr01 NC_080387.1:74072246-74072259promoter 内 2208-2221 bp - 1780 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 74074039-74077240(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAGCCCAG
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SmilChr08G001162 Chr08 NC_080394.1:9297754-9297767promoter 内 1938-1951 bp - 2050 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 9294118-9295704(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CAGAGCTCACGTGG
SmilChr07G001075 Chr07 NC_080393.1:7907892-7907905promoter 内 1914-1927 bp - 2074 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 7904529-7905818(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGAACCTCACGTGC