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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G001094; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00021820-RA_Salv SmilChr04G001094 WRKY XP_057804404.1 MP00408 AGCGTTGACTTTT

可能结合的靶基因

9902 个结合位点 8149 个候选靶基因 第 52 / 163 下载 TSV

上一页 52 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G000665 Chr02 NC_080388.1:10213000-10213012promoter 内 1138-1150 bp - 2851 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 10208037-10210149(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CGCGTTGACCATC
SmilChr05G000112 Chr05 NC_080391.1:791261-791273promoter 内 1115-1127 bp + 2874 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 794147-794851(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGCATTGACTTTT
SmilChr05G001888 Chr05 NC_080391.1:19192075-19192087promoter 内 1069-1081 bp - 2920 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 19188247-19189155(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ACAGTTGACTTCG
SmilChr05G002143 Chr05 NC_080391.1:22594807-22594819promoter 内 1013-1025 bp + 2976 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 22597795-22597990(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CGCGTTGACCATC
SmilChr07G001110 Chr07 NC_080393.1:8190629-8190641promoter 内 981-993 bp - 3008 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 8193649-8196702(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AAAAGTCAATGCT
SmilChr07G000131 Chr07 NC_080393.1:778528-778540promoter 内 966-978 bp - 3023 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 781563-784232(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GCAGGTCAACGGA
SmilChr07G003028 Chr07 NC_080393.1:31327525-31327537promoter 内 803-815 bp + 3186 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 31320330-31324339(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ATAAGTCAACCGT
SmilChr02G003328 Chr02 NC_080388.1:54538108-54538120promoter 内 768-780 bp - 3221 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 54528113-54534887(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GCGGTTGACTATG
SmilChr08G000818 Chr08 NC_080394.1:6041216-6041228promoter 内 722-734 bp - 3267 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 6033185-6037949(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CGCGTTGACCATC
SmilChr03G004069 Chr03 NC_080389.1:59673834-59673846promoter 内 652-664 bp + 3337 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 59662715-59670497(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GATGGTCAACGCG
SmilChr08G000527 Chr08 NC_080394.1:3837231-3837243promoter 内 601-613 bp + 3388 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 3840631-3841780(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TGAGTTGACTTCT
SmilChr08G002297 Chr08 NC_080394.1:21481928-21481940promoter 内 567-579 bp - 3422 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 21477562-21478506(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ACAGTTGACTTCG
SmilChr01G004624 Chr01 NC_080387.1:64260714-64260726promoter 内 364-376 bp + 3625 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 64264351-64266280(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGAGTTGACTATT
SmilChr08G002885 Chr08 NC_080394.1:28726530-28726542promoter 内 112-124 bp + 3877 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 28719423-28722653(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ATGAGTCAACGGA
SmilChr05G002686 Chr05 NC_080391.1:30486055-30486067promoter 内 49-61 bp - 3940 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 30490007-30495337(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AACAGTCAACGAG
SmilChr06G001779 Chr06 NC_080392.1:20828281-20828293promoter 内 32-44 bp + 3957 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 20823688-20824324(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGAAGTCAACTGG
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SmilChr02G004853 Chr02 NC_080388.1:70680462-70680474promoter 内 2937-2949 bp + 1052 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 3 70681526-70683890(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CGCGTTGACTACC
SmilChr02G001974 Chr02 NC_080388.1:35723446-35723458promoter 内 90-102 bp - 3899 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 3 35718038-35719547(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GGCGTTGACTGAG
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SmilChr02G004940 Chr02 NC_080388.1:71366187-71366199promoter 内 3709-3721 bp - 280 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 71362767-71365907(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GCAGTTGACTTAC
SmilChr03G003592 Chr03 NC_080389.1:54571715-54571727promoter 内 3422-3434 bp - 567 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 54572294-54574332(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AAAAGTCAACAAT
SmilChr02G004852 Chr02 NC_080388.1:70680462-70680474promoter 内 3241-3253 bp + 748 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 70678035-70679714(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GGTAGTCAACGCG
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SmilChr05G001109 Chr05 NC_080391.1:9213317-9213329promoter 内 3007-3019 bp + 982 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 9206927-9212335(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TATAGTCAACGAA
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SmilChr02G001975 Chr02 NC_080388.1:35723446-35723458promoter 内 2702-2714 bp - 1287 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 35719848-35722159(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GGCGTTGACTGAG
SmilChr02G001299 Chr02 NC_080388.1:24050785-24050797promoter 内 2687-2699 bp - 1302 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 24052099-24068327(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GAGGGTCAACGCT
SmilChr06G002830 Chr06 NC_080392.1:41078253-41078265promoter 内 2676-2688 bp + 1313 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 41070167-41076940(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AAAAGTCAACAAT
SmilChr01G001941 Chr01 NC_080387.1:34586435-34586447promoter 内 2359-2371 bp - 1630 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 34588077-34591403(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GGTAGTCAACGCG
SmilChr01G005265 Chr01 NC_080387.1:70112373-70112385promoter 内 1928-1940 bp + 2061 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 70114446-70115342(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CGTGTTGACTTTC
SmilChr04G003627 Chr04 NC_080390.1:52760532-52760544promoter 内 1846-1858 bp - 2143 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 52757318-52758389(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CGCGTTGACTACC
SmilChr02G002277 Chr02 NC_080388.1:40260611-40260623promoter 内 1801-1813 bp + 2188 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 40253801-40258423(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CCAAGTCAACTCT
SmilChr03G001413 Chr03 NC_080389.1:16791220-16791232promoter 内 1770-1782 bp - 2219 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 16793451-16796328(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GGTAGTCAACGCG
SmilChr07G000074 Chr07 NC_080393.1:345914-345926promoter 内 1721-1733 bp - 2268 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 348194-354599(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AAAAGTCAACAAT
SmilChr02G005436 Chr02 NC_080388.1:74767458-74767470promoter 内 1690-1702 bp - 2299 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 74769769-74777238(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GAAAGTCAACCTT
SmilChr03G001333 Chr03 NC_080389.1:15564994-15565006promoter 内 1471-1483 bp + 2518 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 15559588-15562476(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GGTAGTCAACGCG
SmilChr07G000890 Chr07 NC_080393.1:6377094-6377106promoter 内 1288-1300 bp - 2701 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 6379807-6384369(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TAGAGTCAACGTT
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SmilChr01G004695 Chr01 NC_080387.1:65018180-65018192promoter 内 1131-1143 bp + 2858 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 65009907-65015322(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AAAAGTCAACAAT
SmilChr01G004845 Chr01 NC_080387.1:66598704-66598716promoter 内 1110-1122 bp + 2879 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 66589666-66595825(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AAAAGTCAACAAT
SmilChr05G000980 Chr05 NC_080391.1:7914754-7914766promoter 内 678-690 bp - 3311 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 7918077-7921479(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AAAAGTCAACAAT
SmilChr02G001162 Chr02 NC_080388.1:21207966-21207978promoter 内 496-508 bp + 3493 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 21211471-21212307(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GTCGTTGACCTGC
SmilChr05G001685 Chr05 NC_080391.1:16012712-16012724promoter 内 191-203 bp + 3798 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 16007418-16008914(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GAAAGTCAACCTT
SmilChr06G003069 Chr06 NC_080392.1:43577383-43577395promoter 内 3984-3996 bp - 5 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 43577400-43578756(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AAAAGTCAACAAT
SmilChr07G003036 Chr07 NC_080393.1:31394420-31394432promoter 内 3978-3990 bp - 11 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 31390413-31394409(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AACGTTGACCATT
SmilChr01G000798 Chr01 NC_080387.1:17239733-17239745promoter 内 3962-3974 bp - 27 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 17237048-17239706(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CGCGTTGACTACC
SmilChr01G003211 Chr01 NC_080387.1:50885382-50885394promoter 内 3929-3941 bp - 60 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 50882790-50885322(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AAGGTTGACTTTC
SmilChr06G003068 Chr06 NC_080392.1:43577383-43577395promoter 内 3906-3918 bp - 83 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 43576080-43577300(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ATTGTTGACTTTT