转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr03G003924; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010794-RA_Salv SmilChr03G003924 NAC XP_057798851.1 MP00059 TAACACGCCACA

可能结合的靶基因

9940 个结合位点 8333 个候选靶基因 第 55 / 167 下载 TSV

上一页 55 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G004700 Chr02 NC_080388.1:69313882-69313893promoter 内 667-678 bp - 3323 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 69317216-69319888(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GATGGCGTGCTA
SmilChr04G001482 Chr04 NC_080390.1:24257729-24257740promoter 内 655-666 bp + 3335 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 24253149-24254394(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GGTTGCGTGTTG
SmilChr02G001866 Chr02 NC_080388.1:33890177-33890188promoter 内 645-656 bp + 3345 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 33893533-33894546(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CAACACGCAACC
SmilChr03G001070 Chr03 NC_080389.1:12407182-12407193promoter 内 632-643 bp + 3358 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 12402708-12403824(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 AATGGCGTGTGG
SmilChr03G003885 Chr03 NC_080389.1:57923738-57923749promoter 内 602-613 bp - 3388 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 57927137-57928793(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 AATGGCGTGTGC
SmilChr04G003527 Chr04 NC_080390.1:51643386-51643397promoter 内 576-587 bp + 3414 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 51646811-51648140(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CCACACGCCATT
SmilChr05G004349 Chr05 NC_080391.1:57110883-57110894promoter 内 576-587 bp + 3414 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 57103791-57107469(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGTGGCGTGGCA
SmilChr02G004539 Chr02 NC_080388.1:67961056-67961067promoter 内 552-563 bp + 3438 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 67964505-67965669(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CGACACGCCATT
SmilChr04G002968 Chr04 NC_080390.1:46050209-46050220promoter 内 547-558 bp + 3443 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 46039958-46046766(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 AATGGCGTGTGG
SmilChr05G004238 Chr05 NC_080391.1:56206501-56206512promoter 内 532-543 bp - 3458 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 56201389-56203043(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GTACACGCCATG
SmilChr06G001062 Chr06 NC_080392.1:10498520-10498531promoter 内 532-543 bp - 3458 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 10492552-10495062(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GAACACGCAACC
SmilChr03G000748 Chr03 NC_080389.1:8552436-8552447promoter 内 531-542 bp + 3459 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 8546752-8548977(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CATGGCGTGCTA
SmilChr07G000716 Chr07 NC_080393.1:4988692-4988703promoter 内 527-538 bp - 3463 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 4976890-4985229(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 ACACACGCCATG
SmilChr07G002318 Chr07 NC_080393.1:21455812-21455823promoter 内 524-535 bp + 3466 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 21446943-21452346(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGTGGCGTGGTC
SmilChr01G005830 Chr01 NC_080387.1:74309844-74309855promoter 内 514-525 bp + 3476 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 74302395-74306368(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGTGGCGTGGCA
SmilChr08G003870 Chr08 NC_080394.1:45780928-45780939promoter 内 503-514 bp + 3487 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 45784426-45788763(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CACCACGCCACA
SmilChr06G002438 Chr06 NC_080392.1:35117430-35117441promoter 内 463-474 bp - 3527 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 35120968-35124071(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CATGGCGTGCTA
SmilChr01G005836 Chr01 NC_080387.1:74381777-74381788promoter 内 432-443 bp + 3558 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 74371627-74378219(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGTGGCGTGGCA
SmilChr01G001482 Chr01 NC_080387.1:28593839-28593850promoter 内 430-441 bp - 3560 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 28597410-28598474(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GGTTGCGTGTTG
SmilChr06G000219 Chr06 NC_080392.1:1470696-1470707promoter 内 387-398 bp - 3603 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 1464235-1467093(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GGACACGCCATT
SmilChr06G002597 Chr06 NC_080392.1:37227085-37227096promoter 内 346-357 bp - 3644 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 37230740-37238413(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GGTTGCGTGTTG
SmilChr05G002706 Chr05 NC_080391.1:31115313-31115324promoter 内 321-332 bp - 3669 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 31111003-31111644(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GCACACGCCATT
SmilChr06G003036 Chr06 NC_080392.1:43219744-43219755promoter 内 306-317 bp + 3684 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 43210346-43216060(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CATGGCGTGTGT
SmilChr01G005070 Chr01 NC_080387.1:68589083-68589094promoter 内 276-287 bp - 3714 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 68583423-68585369(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GCACACGCCATT
SmilChr07G000627 Chr07 NC_080393.1:4237671-4237682promoter 内 274-285 bp - 3716 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 4232362-4233955(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GACCACGCCACA
SmilChr03G003146 Chr03 NC_080389.1:48762091-48762102promoter 内 224-235 bp - 3766 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 48765868-48767042(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GGTTGCGTGTTG
SmilChr04G000126 Chr04 NC_080390.1:1074739-1074750promoter 内 208-219 bp + 3782 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 1067777-1070957(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGTGGCGTGGGA
SmilChr08G003011 Chr08 NC_080394.1:30223491-30223502promoter 内 202-213 bp + 3788 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 30227290-30228918(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GCACACGCCATT
SmilChr01G000314 Chr01 NC_080387.1:6061191-6061202promoter 内 178-189 bp - 3812 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 6065014-6066013(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GGTTGCGTGTTG
SmilChr08G002762 Chr08 NC_080394.1:27249955-27249966promoter 内 168-179 bp - 3822 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 27244242-27246133(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 AGACACGCCATG
SmilChr01G000035 Chr01 NC_080387.1:568112-568123promoter 内 155-166 bp - 3835 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 571958-572815(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GGTTGCGTGTTG
SmilChr08G001978 Chr08 NC_080394.1:17500091-17500102promoter 内 137-148 bp - 3853 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 17493079-17496238(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 ACACACGCCATG
SmilChr05G001046 Chr05 NC_080391.1:8628745-8628756promoter 内 125-136 bp + 3865 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 8623771-8624880(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GGTTGCGTGTTG
SmilChr06G000532 Chr06 NC_080392.1:4404590-4404601promoter 内 108-119 bp + 3882 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 4399901-4400708(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CATGGCGTGCTA
SmilChr07G003784 Chr07 NC_080393.1:46432332-46432343promoter 内 76-87 bp + 3914 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 46427057-46428418(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GGTTGCGTGTTG
SmilChr08G002352 Chr08 NC_080394.1:22252492-22252503promoter 内 3246-3257 bp - 744 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 3 22253247-22259711(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TATGGCGTGCCA
SmilChr04G000500 Chr04 NC_080390.1:5465314-5465325promoter 内 3855-3866 bp - 135 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 5465460-5466367(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GTTGGCGTGGGC
SmilChr04G000491 Chr04 NC_080390.1:5339883-5339894promoter 内 3852-3863 bp - 138 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 5340032-5340947(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GTTGGCGTGGGC
SmilChr01G001363 Chr01 NC_080387.1:26990289-26990300promoter 内 3644-3655 bp + 346 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 26990646-26992428(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGGCACGCCATA
SmilChr08G000746 Chr08 NC_080394.1:5518741-5518752promoter 内 3531-3542 bp - 459 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 5515904-5518282(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GAACACGCCATA
SmilChr03G003831 Chr03 NC_080389.1:57409946-57409957promoter 内 3529-3540 bp + 461 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 57410418-57417373(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TAACACGCCATG
SmilChr04G000266 Chr04 NC_080390.1:2420400-2420411promoter 内 3102-3113 bp + 888 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 2421299-2425399(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGGCACGCCATA
SmilChr05G004348 Chr05 NC_080391.1:57104187-57104198promoter 内 3054-3065 bp - 936 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 57102218-57103251(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CCCCACGCCAAG
SmilChr08G004065 Chr08 NC_080394.1:49300723-49300734promoter 内 3052-3063 bp + 938 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 49293560-49299785(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TATGGCGTGCCA
SmilChr02G001098 Chr02 NC_080388.1:19799139-19799150promoter 内 2422-2433 bp + 1568 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 19800718-19802970(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGACACGCCATA
SmilChr02G000836 Chr02 NC_080388.1:14199148-14199159promoter 内 2272-2283 bp - 1718 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 14194506-14197430(-) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGACACGCCATA
SmilChr04G000501 Chr04 NC_080390.1:5465314-5465325promoter 内 1942-1953 bp - 2048 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 5467373-5469188(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 GTTGGCGTGGGC
SmilChr08G001011 Chr08 NC_080394.1:7593630-7593641promoter 内 1553-1564 bp + 2437 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 7596078-7602105(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 CCCCACGCCAAC
SmilChr02G003867 Chr02 NC_080388.1:60640334-60640345promoter 内 1321-1332 bp - 2669 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 60643014-60644448(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TATGGCGTGTGA
SmilChr06G002092 Chr06 NC_080392.1:27815767-27815778promoter 内 1055-1066 bp + 2935 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 27818713-27822417(+) SMil_00010794-RA_Salv MP00059 TGGCACGCCATA