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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G002147; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004577-RA_Salv SmilChr07G002147 MYB XP_057774045.1 MP00500 AATATGGATAAGG

可能结合的靶基因

9681 个结合位点 6697 个候选靶基因 第 59 / 134 下载 TSV

上一页 59 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G000862 Chr02 NC_080388.1:14803191-14803203promoter 内 1058-1070 bp - 2931 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 14806134-14806589(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCGTGTA
SmilChr01G002363 Chr01 NC_080387.1:40785342-40785354promoter 内 1033-1045 bp - 2956 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 40781386-40782386(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATTTTGGATAAGT
SmilChr01G001981 Chr01 NC_080387.1:35200709-35200721promoter 内 1019-1031 bp + 2970 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 35203691-35205227(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATTAGAGATAAGG
SmilChr01G005506 Chr01 NC_080387.1:71917216-71917228promoter 内 1008-1020 bp + 2981 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 71920209-71927452(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATTCCGGATAAGA
SmilChr01G002468 Chr01 NC_080387.1:42398728-42398740promoter 内 888-900 bp - 3101 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 42401841-42404048(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCATCTAC
SmilChr03G000638 Chr03 NC_080389.1:7018241-7018253promoter 内 885-897 bp + 3104 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 7021357-7024041(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TATATGGATAATG
SmilChr01G004106 Chr01 NC_080387.1:59571209-59571221promoter 内 860-872 bp - 3129 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 59566356-59568080(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GAGGCGGATAAGA
SmilChr02G001441 Chr02 NC_080388.1:27105280-27105292promoter 内 852-864 bp - 3137 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 27099113-27102143(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTTGTGGATAACA
SmilChr03G000982 Chr03 NC_080389.1:11108518-11108530promoter 内 783-795 bp + 3206 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 11111736-11114161(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATTTTGGATAAGT
SmilChr01G000788 Chr01 NC_080387.1:17146794-17146806promoter 内 780-792 bp + 3209 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 17141217-17143585(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCACCAT
SmilChr01G004208 Chr01 NC_080387.1:60521084-60521096promoter 内 717-729 bp - 3272 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 60524368-60527197(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCATTGT
SmilChr01G006102 Chr01 NC_080387.1:76527148-76527160promoter 内 696-708 bp - 3293 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 76521564-76523855(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATTCTGGATAAGC
SmilChr02G002576 Chr02 NC_080388.1:44813976-44813988promoter 内 662-674 bp + 3327 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 44817315-44817967(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATTTGGGATAAGA
SmilChr02G002810 Chr02 NC_080388.1:48145425-48145437promoter 内 657-669 bp - 3332 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 48148769-48150806(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCGCCTC
SmilChr01G000703 Chr01 NC_080387.1:15825992-15826004promoter 内 651-663 bp - 3338 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 15821262-15822654(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATTCTGGATAAGC
SmilChr03G000610 Chr03 NC_080389.1:6744476-6744488promoter 内 639-651 bp - 3350 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 6747838-6749580(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACTTATCCAAAAT
SmilChr02G002049 Chr02 NC_080388.1:36884995-36885007promoter 内 616-628 bp - 3373 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 36879878-36881622(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GGTCCAGATAAGG
SmilChr03G000994 Chr03 NC_080389.1:11311109-11311121promoter 内 604-616 bp - 3385 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 11306232-11307724(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATTCTGGATAAGC
SmilChr03G001815 Chr03 NC_080389.1:24817981-24817993promoter 内 582-594 bp + 3407 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 24821400-24833993(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AGGTTGGATAAGG
SmilChr02G001317 Chr02 NC_080388.1:24486652-24486664promoter 内 536-548 bp - 3453 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 24482259-24483199(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AGAAAGGATAAGC
SmilChr03G001112 Chr03 NC_080389.1:12827786-12827798promoter 内 496-508 bp + 3493 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 12819542-12824293(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CATTATCCATATA
SmilChr03G001460 Chr03 NC_080389.1:17448254-17448266promoter 内 488-500 bp + 3501 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 17442779-17444753(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CATTATCCACACT
SmilChr02G001093 Chr02 NC_080388.1:19694935-19694947promoter 内 438-450 bp + 3551 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 19698498-19699654(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATTCTGGATAAGC
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SmilChr02G000821 Chr02 NC_080388.1:13830195-13830207promoter 内 422-434 bp + 3567 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 13833774-13835877(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATTAGAGATAAGG
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SmilChr01G003820 Chr01 NC_080387.1:56543011-56543023promoter 内 392-404 bp - 3597 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 56546620-56550205(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCAACAG
SmilChr02G001829 Chr02 NC_080388.1:33300811-33300823promoter 内 371-383 bp - 3618 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 33304441-33304544(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTCTATG
SmilChr02G003460 Chr02 NC_080388.1:55893280-55893292promoter 内 333-345 bp + 3656 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 55896948-55897020(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCAGGGGATAAGG
SmilChr01G003300 Chr01 NC_080387.1:51689650-51689662promoter 内 310-322 bp + 3679 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 51683701-51685971(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGTTATCCACAAA
SmilChr02G000323 Chr02 NC_080388.1:4047323-4047335promoter 内 308-320 bp + 3681 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 4051016-4054345(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATTTTGGATAAGT
SmilChr02G000325 Chr02 NC_080388.1:4082928-4082940promoter 内 197-209 bp + 3792 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 4086732-4089943(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATTTTGGATAAGT
SmilChr03G000379 Chr03 NC_080389.1:4241468-4241480promoter 内 144-156 bp - 3845 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 4234526-4237623(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATTTTGGATAAGT
SmilChr01G005259 Chr01 NC_080387.1:70083863-70083875promoter 内 76-88 bp + 3913 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 70079283-70079950(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCAACCT
SmilChr01G000058 Chr01 NC_080387.1:901147-901159promoter 内 74-86 bp + 3915 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 905074-909862(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AGGTTGGATAAGG
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SmilChr01G002545 Chr01 NC_080387.1:43542231-43542243promoter 内 1768-1780 bp - 2221 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 4 43537481-43540010(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TAATTGGATAAGT
SmilChr02G000458 Chr02 NC_080388.1:6123547-6123559promoter 内 1703-1715 bp - 2286 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 4 6118977-6121261(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GGGGTAGATAAGG
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SmilChr01G002109 Chr01 NC_080387.1:37152154-37152166promoter 内 3269-3281 bp + 720 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 37148586-37151434(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACTTATCCAATTA
SmilChr01G000700 Chr01 NC_080387.1:15693149-15693161promoter 内 3010-3022 bp + 979 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 15690510-15692170(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GCTTATCCCAATC
SmilChr01G004566 Chr01 NC_080387.1:63733255-63733267promoter 内 2821-2833 bp + 1168 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 63727451-63732087(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CGTTATCCAAACA
SmilChr03G000799 Chr03 NC_080389.1:9144864-9144876promoter 内 2682-2694 bp - 1307 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 9143451-9143557(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTTGGATAAGA
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SmilChr01G002295 Chr01 NC_080387.1:39776455-39776467promoter 内 1742-1754 bp - 2247 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 39778714-39782298(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTCTTCC
SmilChr03G002124 Chr03 NC_080389.1:33022910-33022922promoter 内 1492-1504 bp - 2497 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 33019287-33020413(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GGAAGAGATAAGG
SmilChr01G002045 Chr01 NC_080387.1:36191972-36191984promoter 内 664-676 bp - 3325 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 3 36195309-36197167(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCCATTA
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SmilChr02G004829 Chr02 NC_080388.1:70391254-70391266promoter 内 3856-3868 bp + 133 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 70386120-70391121(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACTTATCCTGATC