转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G000157; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00006890-RA_Salv SmilChr04G000157 bHLH XP_057807462.1 MP00081 AGCCACGTGA

可能结合的靶基因

9942 个结合位点 6729 个候选靶基因 第 6 / 135 下载 TSV

上一页 6 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G000116 Chr05 NC_080391.1:864479-864488promoter 内 3518-3527 bp - 474 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 860654-864005(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 AGCCACGTGG
SmilChr02G000323 Chr02 NC_080388.1:4050530-4050539promoter 内 3515-3524 bp + 477 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 4051016-4054345(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 AGCCACGTGG
SmilChr03G000765 Chr03 NC_080389.1:8748290-8748299promoter 内 3485-3494 bp + 507 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 8748806-8752097(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 AGCCACGTGG
SmilChr03G004720 Chr03 NC_080389.1:64427274-64427283promoter 内 3451-3460 bp + 541 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 64420713-64426733(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 CCACGTGGCT
SmilChr01G005092 Chr01 NC_080387.1:68782013-68782022promoter 内 3435-3444 bp - 557 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 68782579-68784843(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 CCACGTGGCT
SmilChr01G004839 Chr01 NC_080387.1:66525230-66525239promoter 内 3433-3442 bp + 559 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 66523337-66524671(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 CCACGTGGCT
SmilChr02G003051 Chr02 NC_080388.1:51297693-51297702promoter 内 3420-3429 bp + 572 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 51298274-51299990(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 AGCCACGTGG
SmilChr03G000468 Chr03 NC_080389.1:4993521-4993530promoter 内 3420-3429 bp + 572 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 4994102-4997403(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 AGCCACGTGG
SmilChr02G000325 Chr02 NC_080388.1:4086131-4086140promoter 内 3400-3409 bp + 592 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 4086732-4089943(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 AGCCACGTGG
SmilChr01G003113 Chr01 NC_080387.1:49937005-49937014promoter 内 3391-3400 bp + 601 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 49937615-49940773(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 AGCCACGTGG
SmilChr03G001972 Chr03 NC_080389.1:28415303-28415312promoter 内 3349-3358 bp - 643 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 28415955-28416551(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 CCACGTGGCT
SmilChr03G001994 Chr03 NC_080389.1:29423740-29423749promoter 内 3349-3358 bp + 643 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 29419250-29423097(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 CCACGTGGCT
SmilChr05G001912 Chr05 NC_080391.1:19404796-19404805promoter 内 3341-3350 bp - 651 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 19400714-19404145(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 AGCCACGTGG
SmilChr03G002369 Chr03 NC_080389.1:37315272-37315281promoter 内 3303-3312 bp + 689 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 37315970-37317665(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 AGCCACGTGG
SmilChr05G001296 Chr05 NC_080391.1:11142641-11142650promoter 内 3303-3312 bp - 689 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 11138888-11141952(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 AGCCACGTGG
SmilChr04G002200 Chr04 NC_080390.1:35630859-35630868promoter 内 3302-3311 bp - 690 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 35627112-35630169(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 AGCCACGTGG
SmilChr04G004160 Chr04 NC_080390.1:56286333-56286342promoter 内 3298-3307 bp + 694 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 56287036-56288624(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 AGCCACGTGG
SmilChr03G000827 Chr03 NC_080389.1:9458989-9458998promoter 内 3287-3296 bp + 705 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 9459703-9460153(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 AGCCACGTGG
SmilChr02G000551 Chr02 NC_080388.1:7725697-7725706promoter 内 3278-3287 bp - 714 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 7723383-7724983(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 AGCCACGTGG
SmilChr03G000639 Chr03 NC_080389.1:7036690-7036699promoter 内 3271-3280 bp - 721 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 7032952-7035969(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 AGCCACGTGG
SmilChr02G000835 Chr02 NC_080388.1:14110388-14110397promoter 内 3259-3268 bp + 733 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 14111130-14114061(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 AGCCACGTGG
SmilChr03G000819 Chr03 NC_080389.1:9390442-9390451promoter 内 3219-3228 bp - 773 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 9386835-9389669(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 AGCCACGTGG
SmilChr02G002137 Chr02 NC_080388.1:38472434-38472443promoter 内 3189-3198 bp + 803 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 38473246-38475937(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 AGCCACGTGG
SmilChr02G000196 Chr02 NC_080388.1:2453989-2453998promoter 内 3139-3148 bp + 853 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 2454851-2457037(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 AGCCACGTGG
SmilChr03G000145 Chr03 NC_080389.1:1586125-1586134promoter 内 3081-3090 bp + 911 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 1587045-1589941(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 AGCCACGTGG
SmilChr05G002752 Chr05 NC_080391.1:31792963-31792972promoter 内 2998-3007 bp - 994 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 31786027-31791969(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 AGCCACGTGG
SmilChr04G003627 Chr04 NC_080390.1:52759465-52759474promoter 内 2916-2925 bp + 1076 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 52757318-52758389(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 CCACGTGGCT
SmilChr04G002539 Chr04 NC_080390.1:40657060-40657069promoter 内 2907-2916 bp + 1085 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 40658154-40659056(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 AGCCACGTGG
SmilChr04G001798 Chr04 NC_080390.1:29454007-29454016promoter 内 2884-2893 bp - 1108 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 29455124-29456928(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 CCACGTGGCT
SmilChr05G001345 Chr05 NC_080391.1:11885951-11885960promoter 内 2844-2853 bp + 1148 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 11881977-11884803(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 CCACGTGGCT
SmilChr05G002525 Chr05 NC_080391.1:28102160-28102169promoter 内 2810-2819 bp - 1182 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 28098986-28100978(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 AGCCACGTGG
SmilChr03G003647 Chr03 NC_080389.1:55238942-55238951promoter 内 2701-2710 bp + 1291 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 55240242-55241327(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 AGCCACGTGG
SmilChr01G006169 Chr01 NC_080387.1:77197351-77197360promoter 内 2700-2709 bp - 1292 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 77198652-77205021(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 CCACGTGGCT
SmilChr03G001960 Chr03 NC_080389.1:28085220-28085229promoter 内 2532-2541 bp - 1460 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 28086689-28096713(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 CCACGTGGCT
SmilChr03G001109 Chr03 NC_080389.1:12788477-12788486promoter 内 2442-2451 bp - 1550 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 12790036-12791228(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 CCACGTGGCT
SmilChr05G001434 Chr05 NC_080391.1:13084514-13084523promoter 内 2411-2420 bp + 1581 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 13080736-13082933(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 CCACGTGGCT
SmilChr02G002183 Chr02 NC_080388.1:39033495-39033504promoter 内 2396-2405 bp + 1596 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 39035100-39037243(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 AGCCACGTGG
SmilChr03G001510 Chr03 NC_080389.1:18511280-18511289promoter 内 2343-2352 bp + 1649 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 18512938-18514058(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 AGCCACGTGG
SmilChr02G001781 Chr02 NC_080388.1:32594732-32594741promoter 内 2304-2313 bp - 1688 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 32596429-32605638(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 CCACGTGGCT
SmilChr02G003074 Chr02 NC_080388.1:51641429-51641438promoter 内 2290-2299 bp - 1702 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 51643140-51644435(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 CCACGTGGCT
SmilChr04G003100 Chr04 NC_080390.1:47598393-47598402promoter 内 2274-2283 bp + 1718 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 47590595-47596675(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 CCACGTGGCT
SmilChr02G005361 Chr02 NC_080388.1:74327860-74327869promoter 内 2182-2191 bp + 1810 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 74329679-74332328(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 AGCCACGTGG
SmilChr05G001624 Chr05 NC_080391.1:15141697-15141706promoter 内 2153-2162 bp + 1839 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 15143545-15143919(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 AGCCACGTGG
SmilChr02G000665 Chr02 NC_080388.1:10212018-10212027promoter 内 2123-2132 bp + 1869 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 10208037-10210149(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 CCACGTGGCT
SmilChr05G002028 Chr05 NC_080391.1:21062622-21062631promoter 内 2099-2108 bp - 1893 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 21064524-21068807(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 CCACGTGGCT
SmilChr04G001622 Chr04 NC_080390.1:26988833-26988842promoter 内 2085-2094 bp - 1907 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 26990749-26993464(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 CCACGTGGCT
SmilChr03G001550 Chr03 NC_080389.1:19536957-19536966promoter 内 2031-2040 bp - 1961 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 19538927-19540509(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 CCACGTGGCT
SmilChr04G001997 Chr04 NC_080390.1:32331832-32331841promoter 内 1959-1968 bp + 2033 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 32324841-32329799(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 CCACGTGGCT
SmilChr04G000767 Chr04 NC_080390.1:9385220-9385229promoter 内 1880-1889 bp - 2112 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 9387341-9389181(+) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 CCACGTGGCT
SmilChr04G000458 Chr04 NC_080390.1:4885197-4885206promoter 内 1851-1860 bp + 2141 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 4882637-4883056(-) SMil_00006890-RA_Salv MP00081 CCACGTGGCT