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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G004009; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00018864-RA_Salv SmilChr05G004009 MYB XP_057810662.1 MP00216 AAAAAAGTTAGGTAG

可能结合的靶基因

9832 个结合位点 7342 个候选靶基因 第 61 / 147 下载 TSV

上一页 61 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G000511 Chr03 NC_080389.1:5502351-5502365promoter 内 2927-2941 bp + 1060 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 5503425-5506651(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TAATATGTTAGGTAA
SmilChr03G001623 Chr03 NC_080389.1:20828436-20828450promoter 内 2814-2828 bp + 1173 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 20825715-20827263(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 CTACCTAAATTTTAG
SmilChr04G000110 Chr04 NC_080390.1:973226-973240promoter 内 2735-2749 bp - 1252 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 967949-971974(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 ACATATGTTAGGTCA
SmilChr03G001260 Chr03 NC_080389.1:14543588-14543602promoter 内 2673-2687 bp + 1314 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 14541501-14542274(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TGACCTAACCCTAGC
SmilChr02G004045 Chr02 NC_080388.1:62761550-62761564promoter 内 2641-2655 bp - 1346 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 62756637-62760204(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TAATTAGTTAGGTTA
SmilChr02G002965 Chr02 NC_080388.1:50166721-50166735promoter 内 2630-2644 bp + 1357 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 50168092-50171839(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TCCTTAGTTAGGTAT
SmilChr01G003906 Chr01 NC_080387.1:57349883-57349897promoter 内 2571-2585 bp - 1416 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 57351313-57354688(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 GAACCTAACCCTATC
SmilChr03G001528 Chr03 NC_080389.1:19044404-19044418promoter 内 2539-2553 bp + 1448 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 19040345-19042956(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TGACCTAACCCCTTC
SmilChr03G002314 Chr03 NC_080389.1:36415515-36415529promoter 内 2530-2544 bp + 1457 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 36410888-36414058(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 ATACCTAATTATCAT
SmilChr02G001279 Chr02 NC_080388.1:23487334-23487348promoter 内 2498-2512 bp + 1489 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 23485375-23485845(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TTACCTAATTAGCCT
SmilChr02G001327 Chr02 NC_080388.1:24743411-24743425promoter 内 2436-2450 bp - 1551 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 24738717-24741860(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 CTTATGGTTAGGTAA
SmilChr02G000537 Chr02 NC_080388.1:7398180-7398194promoter 内 2388-2402 bp + 1599 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 7399793-7400930(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TATGGAGTTAGGTGC
SmilChr04G000544 Chr04 NC_080390.1:6060541-6060555promoter 内 2378-2392 bp + 1609 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 6057076-6058932(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 CTACCTAATATTCAT
SmilChr03G000262 Chr03 NC_080389.1:3052712-3052726promoter 内 2215-2229 bp - 1772 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 3049996-3050940(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 GTTCGAGTTAGGTCA
SmilChr03G004687 Chr03 NC_080389.1:64262011-64262025promoter 内 2208-2222 bp - 1779 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 64263804-64269899(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TAACCTAACCCCTTT
SmilChr02G004579 Chr02 NC_080388.1:68289128-68289142promoter 内 2202-2216 bp + 1785 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 68276587-68287343(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 AGGCCTAACTCAAAT
SmilChr01G003955 Chr01 NC_080387.1:57924636-57924650promoter 内 2125-2139 bp - 1862 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 57926512-57928904(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 CAGCCTAACTGCGGG
SmilChr03G002529 Chr03 NC_080389.1:40351483-40351497promoter 内 2008-2022 bp - 1979 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 40353476-40357643(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 ACACCTAACCCTTTA
SmilChr03G004202 Chr03 NC_080389.1:60645123-60645137promoter 内 1958-1972 bp - 2029 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 60638345-60643094(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 GCCAATGTTAGGTCA
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SmilChr03G004203 Chr03 NC_080389.1:60645123-60645137promoter 内 1952-1966 bp - 2035 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 60641507-60643088(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 GCCAATGTTAGGTCA
SmilChr01G002859 Chr01 NC_080387.1:47166877-47166891promoter 内 1773-1787 bp - 2214 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 47164582-47164663(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 GCAAAAGTTTGGCTC
SmilChr01G002357 Chr01 NC_080387.1:40757345-40757359promoter 内 1729-1743 bp - 2258 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 40743682-40755087(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 GCGCAGCTTAGGTAG
SmilChr03G000915 Chr03 NC_080389.1:10473120-10473134promoter 内 1715-1729 bp + 2272 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 10469068-10470848(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TGGCCTAACTCCATA
SmilChr02G002945 Chr02 NC_080388.1:49969345-49969359promoter 内 1692-1706 bp + 2295 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 49966577-49967050(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TTACCTAACATTACA
SmilChr03G001223 Chr03 NC_080389.1:14095462-14095476promoter 内 1584-1598 bp + 2403 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 14097879-14100533(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TATGAAGTTAGGTTT
SmilChr02G000262 Chr02 NC_080388.1:3414262-3414276promoter 内 1401-1415 bp + 2586 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 3409681-3411676(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 ACACCTAACTAAAAT
SmilChr02G002898 Chr02 NC_080388.1:49249079-49249093promoter 内 1401-1415 bp - 2586 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 49251679-49253043(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 ATACCTAACTAAGGA
SmilChr02G005467 Chr02 NC_080388.1:74964302-74964316promoter 内 1391-1405 bp - 2596 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 74959871-74961706(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 ATAATGGTTAGGTTT
SmilChr01G004755 Chr01 NC_080387.1:65751071-65751085promoter 内 1379-1393 bp + 2608 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 65753693-65755291(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TGAAAATTTAGGTAG
SmilChr02G004320 Chr02 NC_080388.1:65510182-65510196promoter 内 1349-1363 bp + 2638 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 65512834-65514958(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 CAAGAGGTTAGGTTT
SmilChr04G001327 Chr04 NC_080390.1:21412429-21412443promoter 内 1233-1247 bp - 2754 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 21405779-21409675(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 GGTTTGGTTAGGTAA
SmilChr01G005713 Chr01 NC_080387.1:73348503-73348517promoter 内 1044-1058 bp - 2943 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 73341651-73345560(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 ATAATGGTTAGGTTT
SmilChr01G006073 Chr01 NC_080387.1:76163856-76163870promoter 内 997-1011 bp - 2990 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 76166860-76175433(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 AAACCTAACTCAAGC
SmilChr02G004267 Chr02 NC_080388.1:64889923-64889937promoter 内 936-950 bp - 3051 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 64885815-64886872(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 CTTTTAGTTAGGTAT
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SmilChr03G001571 Chr03 NC_080389.1:19838873-19838887promoter 内 908-922 bp + 3079 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 19841966-19849617(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TCATTAGTTAGGTTA
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SmilChr04G000209 Chr04 NC_080390.1:1859195-1859209promoter 内 673-687 bp - 3314 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 1862523-1862596(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 ATACCTAATTTCCAT
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SmilChr02G001555 Chr02 NC_080388.1:28854409-28854423promoter 内 628-642 bp + 3359 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 28857782-28868220(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TCAAAAGTTTGGCAA
SmilChr04G001118 Chr04 NC_080390.1:16192425-16192439promoter 内 546-560 bp + 3441 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 16188334-16188984(-) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 AAACCTAACTCAAGC
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SmilChr01G005707 Chr01 NC_080387.1:73301654-73301668promoter 内 384-398 bp + 3603 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 73305271-73306354(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TAATTAGTTAGGTCC
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SmilChr03G002991 Chr03 NC_080389.1:46725103-46725117promoter 内 314-328 bp + 3673 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 46728790-46730217(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 TATGGAGTTAGGCCA
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SmilChr01G002860 Chr01 NC_080387.1:47166877-47166891promoter 内 218-232 bp - 3769 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 47170660-47178450(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 GAGCCAAACTTTTGC
SmilChr01G002359 Chr01 NC_080387.1:40757345-40757359promoter 内 205-219 bp - 3782 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 40761141-40763492(+) SMil_00018864-RA_Salv MP00216 CTACCTAAGCTGCGC