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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr03G002503; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027448-RA_Salv SmilChr03G002503 MYB XP_057801356.1 MP00482 AAAATATGACCGTTG

可能结合的靶基因

8940 个结合位点 6899 个候选靶基因 第 63 / 138 下载 TSV

上一页 63 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G003762 Chr03 NC_080389.1:56771280-56771294promoter 内 492-506 bp - 3495 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 56774789-56778580(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TAACGGTCTAATTGG
SmilChr03G002542 Chr03 NC_080389.1:40592343-40592357promoter 内 452-466 bp + 3535 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 40581936-40588808(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTTTGAAATC
SmilChr07G004066 Chr07 NC_080393.1:51957253-51957267promoter 内 428-442 bp + 3559 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 51960826-51961786(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AAGTTAAAACCGTTG
SmilChr03G004269 Chr03 NC_080389.1:61174060-61174074promoter 内 384-398 bp + 3603 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 61165887-61170457(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTAAGGTGTG
SmilChr05G002682 Chr05 NC_080391.1:30365581-30365595promoter 内 357-371 bp + 3630 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 30360350-30361951(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTTGCAACCG
SmilChr05G003440 Chr05 NC_080391.1:45731550-45731564promoter 内 341-355 bp + 3646 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 45735210-45738348(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AAGTTAAAACCGTTG
SmilChr06G002111 Chr06 NC_080392.1:28209522-28209536promoter 内 317-331 bp + 3670 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 28204722-28205852(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTAAAAGTGA
SmilChr07G001953 Chr07 NC_080393.1:16995564-16995578promoter 内 226-240 bp + 3761 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 16989104-16991803(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TAACGGTCAACACCT
SmilChr03G004699 Chr03 NC_080389.1:64314008-64314022promoter 内 220-234 bp + 3767 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 64308714-64310241(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTTGTATGTA
SmilChr04G000948 Chr04 NC_080390.1:12545000-12545014promoter 内 198-212 bp + 3789 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 12539771-12541211(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTTTGAAATC
SmilChr07G002632 Chr07 NC_080393.1:25398399-25398413promoter 内 169-183 bp + 3818 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 25388722-25394581(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TAACGGTCATTAGAC
SmilChr05G002406 Chr05 NC_080391.1:26559994-26560008promoter 内 168-182 bp - 3819 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 26563827-26575030(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TAACGGATATATTTT
SmilChr06G001801 Chr06 NC_080392.1:21179117-21179131promoter 内 63-77 bp + 3924 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 21183055-21184582(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AAGTTAAAACCGTTG
SmilChr08G000168 Chr08 NC_080394.1:1169678-1169692promoter 内 34-48 bp + 3953 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 1160450-1165725(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTTCGTTGTT
SmilChr05G003151 Chr05 NC_080391.1:40232401-40232415promoter 内 9-23 bp - 3978 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 40236393-40237949(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AAACGGTCATCTTAT
SmilChr04G000741 Chr04 NC_080390.1:9106789-9106803promoter 内 960-974 bp - 3027 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 8 9101059-9103762(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AGGTAACGACCGTTA
SmilChr07G003134 Chr07 NC_080393.1:33266326-33266340promoter 内 508-522 bp + 3479 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 7 33261810-33262847(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TAACGGTCGTTACAT
SmilChr03G002915 Chr03 NC_080389.1:45904985-45904999promoter 内 3681-3695 bp + 306 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 6 45905305-45905967(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AGGTAACGACCGTTA
SmilChr03G001829 Chr03 NC_080389.1:25064698-25064712promoter 内 2940-2954 bp - 1047 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 3 25063548-25063651(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 GGATCCAGACCGTTG
SmilChr08G001942 Chr08 NC_080394.1:17051694-17051708promoter 内 3643-3657 bp + 344 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 17048853-17051350(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTCCGAGTCG
SmilChr07G003369 Chr07 NC_080393.1:36296484-36296498promoter 内 3421-3435 bp - 566 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 36297064-36298039(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTAGAAACTA
SmilChr03G002644 Chr03 NC_080389.1:42063797-42063811promoter 内 3334-3348 bp + 653 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 42061571-42063144(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTAGCATGTA
SmilChr01G005103 Chr01 NC_080387.1:68822446-68822460promoter 内 3237-3251 bp + 750 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 68818996-68821696(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTTGTTAAAG
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SmilChr08G001207 Chr08 NC_080394.1:9747269-9747283promoter 内 3128-3142 bp + 859 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 9745361-9746410(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTATCTTATA
SmilChr01G002214 Chr01 NC_080387.1:38480792-38480806promoter 内 2960-2974 bp - 1027 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 38481833-38482558(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TAACGGTCGTTACAT
SmilChr06G001370 Chr06 NC_080392.1:14370614-14370628promoter 内 2692-2706 bp + 1295 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 14366642-14369319(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTTGGCAATC
SmilChr07G003687 Chr07 NC_080393.1:44376706-44376720promoter 内 2100-2114 bp - 1887 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 44378607-44379071(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTCAGACCAG
SmilChr05G000111 Chr05 NC_080391.1:729384-729398promoter 内 906-920 bp + 3081 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 732479-733183(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 ACCCAGTGACCGTTG
SmilChr05G002524 Chr05 NC_080391.1:28082322-28082336promoter 内 788-802 bp - 3199 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 28085535-28090191(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AAACGGTCGTGTTTT
SmilChr06G000219 Chr06 NC_080392.1:1470440-1470454promoter 内 640-654 bp - 3347 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 1464235-1467093(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 ATATCTGTACCGTTG
SmilChr07G002643 Chr07 NC_080393.1:25587472-25587486promoter 内 81-95 bp - 3906 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 25580115-25583566(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AAAATATAAACGTTG
SmilChr01G002215 Chr01 NC_080387.1:38480792-38480806promoter 内 77-91 bp - 3910 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 38484716-38489024(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TAACGGTCGTTACAT
SmilChr01G002231 Chr01 NC_080387.1:38790221-38790235promoter 内 51-65 bp - 3936 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 38794171-38798479(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TAACGGTCGTTACAT
SmilChr08G004061 Chr08 NC_080394.1:49228303-49228317promoter 内 3979-3993 bp + 8 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 49227633-49228295(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTCGGGTCGG
SmilChr08G004092 Chr08 NC_080394.1:49610272-49610286promoter 内 3979-3993 bp + 8 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 49609602-49610264(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTCGGGTCGG
SmilChr01G000750 Chr01 NC_080387.1:16575742-16575756promoter 内 3880-3894 bp + 107 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 16575863-16581141(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 TAACAGGAACCGTTG
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SmilChr08G004807 Chr08 NC_080394.1:57383017-57383031promoter 内 3786-3800 bp - 201 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 57383232-57391037(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTTTATATAT
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SmilChr02G001141 Chr02 NC_080388.1:20648941-20648955promoter 内 3763-3777 bp + 224 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 20647071-20648717(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTTATAGACG
SmilChr07G003590 Chr07 NC_080393.1:41921598-41921612promoter 内 3744-3758 bp - 243 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 41918258-41921355(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 ATGCTATAACCGTTG
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SmilChr01G002581 Chr01 NC_080387.1:43942986-43943000promoter 内 3691-3705 bp - 296 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 43942147-43942690(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 AATCGGCGACCGTTG
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SmilChr07G003691 Chr07 NC_080393.1:44436809-44436823promoter 内 3523-3537 bp - 464 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 44433640-44436345(-) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CTGGTCTGACCGTTG
SmilChr02G001425 Chr02 NC_080388.1:26914812-26914826promoter 内 3522-3536 bp - 465 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 26915291-26916539(+) SMil_00027448-RA_Salv MP00482 CAACGGTTCTAAAAA