Red Sage Omics 丹参基因组信息平台
首页 基因查询 ID 对照表 功能注释 结构域预测 Pfam 基因组工具 蛋白互作 亚细胞定位 表达量 共表达 同源/共线性 GO/KEGG 注释 TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变 JBrowse BLAST 下载 关于 帮助
数据资源
ID 对照表 功能注释 功能检索 次生代谢专题 文献证据 结构域预测 Pfam 同源/共线性
分析工具
基因组工具 引物设计 同源重组引物设计 核酸翻译 BLAST 蛋白互作 亚细胞定位 共表达 GO/KEGG 注释 功能检索
调控/突变
TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变
帮助
关于 帮助 资源与版本
中文 EN

转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G004447; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027346-RA_Salv SmilChr02G004447 HD-ZIP XP_057797242.1 MP00200 AAAAGTAATGATTAC

可能结合的靶基因

9930 个结合位点 6661 个候选靶基因 第 65 / 134 下载 TSV

上一页 65 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G004549 Chr01 NC_080387.1:63613348-63613362promoter 内 1421-1435 bp + 2566 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 63608236-63610782(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCAATCATTATCCCT
SmilChr02G001651 Chr02 NC_080388.1:30619097-30619111promoter 内 1329-1343 bp - 2658 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 30614571-30616439(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AGAAACGATGATTAT
SmilChr02G004268 Chr02 NC_080388.1:64885163-64885177promoter 内 1321-1335 bp + 2666 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 64887843-64905621(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GGCGATGATGATTAT
SmilChr03G001715 Chr03 NC_080389.1:22977852-22977866promoter 内 1247-1261 bp - 2740 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 22980606-22980712(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATCACAAAA
SmilChr03G001031 Chr03 NC_080389.1:12018401-12018415promoter 内 1246-1260 bp + 2741 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 12013561-12015660(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCCATCATTATAAAT
SmilChr01G001998 Chr01 NC_080387.1:35479220-35479234promoter 内 1228-1242 bp - 2759 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 35470632-35476461(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTACCAATGATTGC
SmilChr01G001439 Chr01 NC_080387.1:28053214-28053228promoter 内 1222-1236 bp - 2765 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 28050333-28050449(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTTTGTGATGATTAA
SmilChr02G003755 Chr02 NC_080388.1:59208310-59208324promoter 内 1192-1206 bp + 2795 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 59205409-59205515(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATCACAAAA
SmilChr01G002916 Chr01 NC_080387.1:47878029-47878043promoter 内 1190-1204 bp - 2797 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 47880840-47883424(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GCAATCATTGTTGCT
SmilChr01G000839 Chr01 NC_080387.1:18136951-18136965promoter 内 1183-1197 bp - 2804 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 18111466-18134147(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTTTGTGATGATTAA
SmilChr02G003426 Chr02 NC_080388.1:55468772-55468786promoter 内 1182-1196 bp + 2805 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 55461968-55465967(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTAGGAGT
SmilChr03G000367 Chr03 NC_080389.1:4099952-4099966promoter 内 1177-1191 bp + 2810 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 4102776-4104254(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAGAACGATGATTAT
SmilChr02G003185 Chr02 NC_080388.1:52995962-52995976promoter 内 1171-1185 bp + 2816 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 52998792-53001288(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TACAACAATGATTAT
SmilChr02G000514 Chr02 NC_080388.1:7105757-7105771promoter 内 1160-1174 bp - 2827 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 7108598-7108704(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATCACAAAA
SmilChr02G003387 Chr02 NC_080388.1:54983139-54983153promoter 内 1156-1170 bp + 2831 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 54980202-54980308(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATCACAAAA
SmilChr01G006027 Chr01 NC_080387.1:75831961-75831975promoter 内 1104-1118 bp + 2883 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 75834858-75837255(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTTTCTAATGATTAT
SmilChr02G001145 Chr02 NC_080388.1:20836934-20836948promoter 内 1088-1102 bp - 2899 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 20831301-20834035(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTTTGTGATGATTAA
SmilChr03G002325 Chr03 NC_080389.1:36599910-36599924promoter 内 1058-1072 bp + 2929 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 36602853-36603350(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTTTGTGATGATTAA
SmilChr01G001103 Chr01 NC_080387.1:22579444-22579458promoter 内 1011-1025 bp - 2976 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 22569983-22576468(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GGCGATGATGATTAT
SmilChr03G001641 Chr03 NC_080389.1:21172265-21172279promoter 内 1001-1015 bp - 2986 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 21175265-21175371(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATCACAAAA
SmilChr01G001301 Chr01 NC_080387.1:25921708-25921722promoter 内 989-1003 bp - 2998 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 25924720-25928691(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACAATCATTGCAAAA
SmilChr01G001429 Chr01 NC_080387.1:27928793-27928807promoter 内 969-983 bp + 3018 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 27924911-27925775(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATCACAAAA
SmilChr02G004370 Chr02 NC_080388.1:66022627-66022641promoter 内 893-907 bp + 3094 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 66025735-66034194(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTAGCGATGATTAA
SmilChr01G005047 Chr01 NC_080387.1:68407955-68407969promoter 内 794-808 bp - 3193 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 68401320-68404762(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCCTATAATGATTAC
SmilChr02G004889 Chr02 NC_080388.1:70950272-70950286promoter 内 784-798 bp + 3203 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 70945121-70947069(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATTTCATTC
SmilChr01G002495 Chr01 NC_080387.1:42715602-42715616promoter 内 774-788 bp + 3213 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 42711485-42712389(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCCATCATTATAAAT
SmilChr02G000074 Chr02 NC_080388.1:952021-952035promoter 内 738-752 bp - 3249 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 945915-948772(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GAGAGAAATGATTGC
SmilChr01G003199 Chr01 NC_080387.1:50755500-50755514promoter 内 571-585 bp + 3416 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 50758930-50765314(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CAAAGTAATGATTTC
SmilChr03G003274 Chr03 NC_080389.1:50700129-50700143promoter 内 525-539 bp + 3462 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 50694656-50696667(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTGTTGCT
SmilChr02G005342 Chr02 NC_080388.1:74247927-74247941promoter 内 426-440 bp - 3561 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 74251502-74251948(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTCATCATTAATTTT
SmilChr01G003494 Chr01 NC_080387.1:53550380-53550394promoter 内 370-384 bp - 3617 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 53541977-53546763(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACATCTAATGATTAG
SmilChr02G003400 Chr02 NC_080388.1:55150100-55150114promoter 内 342-356 bp + 3645 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 55140322-55146455(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTCATCATTAAATGC
SmilChr01G001817 Chr01 NC_080387.1:33106279-33106293promoter 内 278-292 bp - 3709 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 33099523-33102570(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GATGGTAATGATTCC
SmilChr01G000408 Chr01 NC_080387.1:8335055-8335069promoter 内 250-264 bp + 3737 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 8329720-8331318(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATTTCATTC
SmilChr03G002897 Chr03 NC_080389.1:45693882-45693896promoter 内 233-247 bp + 3754 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 45697650-45700954(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TGTTATAATGATGGG
SmilChr01G001438 Chr01 NC_080387.1:28053214-28053228promoter 内 152-166 bp - 3835 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 28049219-28049379(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTTTGTGATGATTAA
SmilChr02G002908 Chr02 NC_080388.1:49382706-49382720promoter 内 48-62 bp + 3939 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 49386659-49392101(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GCAGATGATGATTAG
SmilChr01G003660 Chr01 NC_080387.1:55026020-55026034promoter 内 3396-3410 bp - 591 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 5 55020547-55025429(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAATTTAATGATGAA
SmilChr01G005113 Chr01 NC_080387.1:68902885-68902899promoter 内 3249-3263 bp + 738 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 5 68903637-68905770(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GACCGAAATGATTAC
SmilChr01G005112 Chr01 NC_080387.1:68902807-68902821promoter 内 1330-1344 bp - 2657 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 5 68899026-68900150(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GACCGAAATGATTAC
SmilChr01G005757 Chr01 NC_080387.1:73657896-73657910promoter 内 3764-3778 bp + 223 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 4 73658133-73660972(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CACAATAATGATTAA
SmilChr01G001417 Chr01 NC_080387.1:27758472-27758486promoter 内 1558-1572 bp + 2429 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 4 27755515-27756043(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTAATCATCATTAAT
SmilChr02G003371 Chr02 NC_080388.1:54839467-54839481promoter 内 3881-3895 bp - 106 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 3 54839587-54841481(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATTGTTTCA
SmilChr02G005595 Chr02 NC_080388.1:75702508-75702522promoter 内 3487-3501 bp - 500 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 3 75694468-75702008(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAATTTAATGATGAA
SmilChr01G005756 Chr01 NC_080387.1:73657896-73657910promoter 内 3329-3343 bp + 658 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 3 73645968-73657238(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATTATTGTG
SmilChr02G005398 Chr02 NC_080388.1:74561030-74561044promoter 内 3117-3131 bp - 870 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 3 74555887-74560160(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GACCGAAATGATTAC
SmilChr01G005350 Chr01 NC_080387.1:70755543-70755557promoter 内 1570-1584 bp - 2417 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 3 70748580-70753126(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GCTGCTAATGATGGT
SmilChr01G005477 Chr01 NC_080387.1:71768228-71768242promoter 内 1328-1342 bp - 2659 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 3 71759353-71765569(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TAAGTTAATGATTAT
SmilChr03G001136 Chr03 NC_080389.1:13092800-13092814promoter 内 1086-1100 bp - 2901 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 3 13087507-13089899(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GACCGAAATGATTAC
SmilChr03G001902 Chr03 NC_080389.1:26577147-26577161promoter 内 718-732 bp + 3269 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 3 26580430-26585758(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GACCGAAATGATTAC