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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G000162; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00008183-RA_Salv SmilChr04G000162 MYB XP_057807467.1 MP00134 TCCACCTACCACCAC

可能结合的靶基因

8676 个结合位点 7078 个候选靶基因 第 66 / 142 下载 TSV

上一页 66 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G001393 Chr05 NC_080391.1:12495584-12495598promoter 内 703-717 bp - 3284 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 12498882-12503214(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GCGACAGTAGGTGAG
SmilChr02G001809 Chr02 NC_080388.1:32918177-32918191promoter 内 656-670 bp + 3331 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 32912619-32914846(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GATGTAGTAGGTGGC
SmilChr02G005492 Chr02 NC_080388.1:75087651-75087665promoter 内 614-628 bp + 3373 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 75083585-75084278(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AGTTAGGTAGGTGCA
SmilChr04G000858 Chr04 NC_080390.1:10892110-10892124promoter 内 588-602 bp - 3399 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 10887216-10888711(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AGCACCTACCAGTTC
SmilChr07G003061 Chr07 NC_080393.1:31998708-31998722promoter 内 540-554 bp - 3447 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 31994262-31995261(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AGCACCTACCAGTTC
SmilChr04G002967 Chr04 NC_080390.1:46022820-46022834promoter 内 458-472 bp + 3529 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 46026363-46027266(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CCCACCTACTACGAA
SmilChr08G002829 Chr08 NC_080394.1:28150649-28150663promoter 内 458-472 bp - 3529 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 28154192-28158290(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TAGCTGTTAGGTGGA
SmilChr02G002488 Chr02 NC_080388.1:43296265-43296279promoter 内 447-461 bp - 3540 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 43299819-43300526(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GAACTGGTAGGTGCT
SmilChr03G002682 Chr03 NC_080389.1:42595853-42595867promoter 内 419-433 bp + 3568 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 42599435-42600295(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TGTACCTACCGCATA
SmilChr06G000910 Chr06 NC_080392.1:8585845-8585859promoter 内 397-411 bp - 3590 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 8580484-8582255(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATCAACAACCACCAT
SmilChr07G002909 Chr07 NC_080393.1:29500361-29500375promoter 内 385-399 bp + 3602 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 29493997-29496759(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CGGGTGGTAGGTATC
SmilChr02G002992 Chr02 NC_080388.1:50589134-50589148promoter 内 306-320 bp - 3681 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 50592829-50601363(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GAACTGGTAGGTGCT
SmilChr04G000666 Chr04 NC_080390.1:7542157-7542171promoter 内 206-220 bp + 3781 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 7532110-7538376(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GCAACAGTAGGTGGG
SmilChr08G002191 Chr08 NC_080394.1:19792013-19792027promoter 内 201-215 bp + 3786 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 19787523-19788227(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TCCTGGGTAGGTGGA
SmilChr01G003635 Chr01 NC_080387.1:54869748-54869762promoter 内 195-209 bp + 3792 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 54865129-54865956(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GAACTGGTAGGTGCT
SmilChr07G000025 Chr07 NC_080393.1:119891-119905promoter 内 173-187 bp + 3814 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 112773-116077(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GTGGTGGTGGTTACT
SmilChr08G002850 Chr08 NC_080394.1:28348004-28348018promoter 内 163-177 bp + 3824 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 28342571-28344180(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GAACTGGTAGGTGCT
SmilChr02G001417 Chr02 NC_080388.1:26806940-26806954promoter 内 79-93 bp + 3908 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 26799343-26803032(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GAACTGGTAGGTGCT
SmilChr02G000829 Chr02 NC_080388.1:14050248-14050262promoter 内 73-87 bp - 3914 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 14045221-14046334(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CCCACCTACTTCTCT
SmilChr01G002695 Chr01 NC_080387.1:45207781-45207795promoter 内 70-84 bp + 3917 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 45211712-45216382(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CATACCTACCACATG
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SmilChr04G000115 Chr04 NC_080390.1:998014-998028promoter 内 1667-1681 bp - 2320 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 3 1000348-1003600(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TGAATGGTAGGTGTA
SmilChr03G004496 Chr03 NC_080389.1:63082411-63082425promoter 内 1305-1319 bp + 2682 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 3 63077199-63079729(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TATTAGGTAGGTAGG
SmilChr02G003340 Chr02 NC_080388.1:54618561-54618575promoter 内 987-1001 bp - 3000 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 3 54613186-54615561(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATCAACAACCACCAA
SmilChr07G003148 Chr07 NC_080393.1:33383728-33383742promoter 内 3795-3809 bp - 192 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 33383934-33389391(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CCGTTAGTAGGTGGG
SmilChr07G003129 Chr07 NC_080393.1:33202138-33202152promoter 内 3499-3513 bp - 488 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 33202640-33208096(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CCGTTAGTAGGTGGG
SmilChr05G001293 Chr05 NC_080391.1:11086064-11086078promoter 内 3121-3135 bp - 866 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 11083142-11085198(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CTCACCAGCCACCAC
SmilChr07G001090 Chr07 NC_080393.1:8028304-8028318promoter 内 2015-2029 bp - 1972 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 8023285-8026332(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TCCACCTAACACGAA
SmilChr07G001092 Chr07 NC_080393.1:8028304-8028318promoter 内 1398-1412 bp - 2589 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 8030907-8036273(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TTCGTGTTAGGTGGA
SmilChr04G000561 Chr04 NC_080390.1:6269475-6269489promoter 内 1135-1149 bp + 2852 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 6264319-6266623(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GGAAAGGTAGGTGAC
SmilChr07G002076 Chr07 NC_080393.1:18887867-18887881promoter 内 80-94 bp - 3907 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 18880329-18883960(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CGTACCTACCTTAAC
SmilChr05G002807 Chr05 NC_080391.1:32860723-32860737promoter 内 3965-3979 bp - 22 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 32860759-32862901(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AAGTCAGTAGGTGGG
SmilChr02G002203 Chr02 NC_080388.1:39238727-39238741promoter 内 3963-3977 bp + 24 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 39238765-39239775(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AACACCTACCTCTTC
SmilChr02G003639 Chr02 NC_080388.1:57746559-57746573promoter 内 3962-3976 bp - 25 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 57745816-57746534(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TGCACCTACTTCCAC
SmilChr08G002114 Chr08 NC_080394.1:19006170-19006184promoter 内 3884-3898 bp + 103 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 19006287-19011588(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATCACCTACCGCTAG
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SmilChr03G003329 Chr03 NC_080389.1:51579978-51579992promoter 内 3816-3830 bp + 171 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 51577999-51579807(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TATTCGGTAGGTGCA
SmilChr01G005242 Chr01 NC_080387.1:69959149-69959163promoter 内 3795-3809 bp - 192 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 69959355-69959968(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATGCAGTTAGGTGGG
SmilChr02G002739 Chr02 NC_080388.1:47321786-47321800promoter 内 3794-3808 bp - 193 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 47321993-47324609(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GGAACAGTAGGTGGA
SmilChr06G000214 Chr06 NC_080392.1:1430935-1430949promoter 内 3781-3795 bp + 206 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 1431155-1434387(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATCACCTACCGACTA
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SmilChr04G002127 Chr04 NC_080390.1:34265467-34265481promoter 内 3768-3782 bp - 219 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 34263665-34265248(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATCACCTACCGCTAG
SmilChr01G004803 Chr01 NC_080387.1:66241239-66241253promoter 内 3763-3777 bp - 224 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 66237564-66241015(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TGCACCTACCGAATA
SmilChr08G004702 Chr08 NC_080394.1:56468187-56468201promoter 内 3707-3721 bp + 280 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 56464983-56467907(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AAAATGGTAGGTGGT
SmilChr05G003122 Chr05 NC_080391.1:39882106-39882120promoter 内 3664-3678 bp + 323 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 39878714-39881783(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATCGCGGTAGGTAGC
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SmilChr01G005203 Chr01 NC_080387.1:69710355-69710369promoter 内 3450-3464 bp + 537 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 69710906-69711393(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AGTACCTACCAACTC