转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G001269; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00019281-RA_Salv SmilChr05G001269 G2-like XP_057765199.1 MP00252 AAAAGAATATTCC

可能结合的靶基因

9780 个结合位点 6478 个候选靶基因 第 67 / 130 下载 TSV

上一页 67 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G002307 Chr01 NC_080387.1:40003014-40003026promoter 内 3083-3095 bp - 906 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 40003932-40007099(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 ATAATATTCTTTT
SmilChr01G002318 Chr01 NC_080387.1:40208942-40208954promoter 内 3082-3094 bp - 907 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 40209861-40213027(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 ATAATATTCTTTT
SmilChr01G002900 Chr01 NC_080387.1:47670146-47670158promoter 内 3042-3054 bp + 947 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 47671105-47672514(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 ATAAGAATATTTT
SmilChr01G004310 Chr01 NC_080387.1:61277180-61277192promoter 内 2991-3003 bp + 998 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 61278190-61287644(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGTGGAATATTTG
SmilChr01G005089 Chr01 NC_080387.1:68762157-68762169promoter 内 2980-2992 bp + 1009 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 68763178-68764269(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 ATAAGAATATTTT
SmilChr03G000251 Chr03 NC_080389.1:2976101-2976113promoter 内 2853-2865 bp + 1136 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 2963739-2974965(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAAATATTCCCTA
SmilChr01G003141 Chr01 NC_080387.1:50246297-50246309promoter 内 2835-2847 bp + 1154 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 50247463-50250725(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAAAGAATATTAT
SmilChr01G005664 Chr01 NC_080387.1:72961408-72961420promoter 内 2682-2694 bp - 1307 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 72962727-72962800(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAAATATTCCCTA
SmilChr02G003683 Chr02 NC_080388.1:58195202-58195214promoter 内 2674-2686 bp - 1315 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 58188716-58193887(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGGGGAATATTTT
SmilChr01G001549 Chr01 NC_080387.1:29478243-29478255promoter 内 2630-2642 bp - 1359 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 29472855-29476884(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAAAGAATATTAT
SmilChr02G004845 Chr02 NC_080388.1:70588519-70588531promoter 内 2622-2634 bp + 1367 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 70575749-70587152(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAAATATTCTTAT
SmilChr02G001334 Chr02 NC_080388.1:24803832-24803844promoter 内 2562-2574 bp - 1427 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 24805271-24808516(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 ATAATATTCGTTT
SmilChr01G002646 Chr01 NC_080387.1:44770323-44770335promoter 内 2560-2572 bp - 1429 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 44771764-44773241(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAAATATTCCGAT
SmilChr02G002329 Chr02 NC_080388.1:40986625-40986637promoter 内 2504-2516 bp - 1485 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 40983990-40985140(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 ATAAGAATATTTT
SmilChr01G003775 Chr01 NC_080387.1:56158639-56158651promoter 内 2489-2501 bp + 1500 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 56154167-56157139(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GAAATATTCTAAT
SmilChr02G004120 Chr02 NC_080388.1:63477554-63477566promoter 内 2421-2433 bp - 1568 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 63479134-63483294(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 ATAATATTCTTTT
SmilChr01G001551 Chr01 NC_080387.1:29495461-29495473promoter 内 2369-2381 bp - 1620 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 29497093-29500181(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAAATATTCGTAT
SmilChr01G001524 Chr01 NC_080387.1:29201725-29201737promoter 内 2286-2298 bp - 1703 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 29203440-29206343(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAAATATTCGTAT
SmilChr01G005003 Chr01 NC_080387.1:68074735-68074747promoter 内 2245-2257 bp + 1744 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 68076491-68103913(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AATAGAATATTAC
SmilChr02G000639 Chr02 NC_080388.1:9680662-9680674promoter 内 2209-2221 bp - 1780 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 9674435-9678882(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAACGAATATTAT
SmilChr02G004326 Chr02 NC_080388.1:65545122-65545134promoter 内 2136-2148 bp + 1853 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 65546987-65548788(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GTTAGAATATACT
SmilChr01G001550 Chr01 NC_080387.1:29478243-29478255promoter 内 2108-2120 bp - 1881 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 29480136-29483075(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 ATAATATTCTTTT
SmilChr01G005665 Chr01 NC_080387.1:72961408-72961420promoter 内 2059-2071 bp - 1930 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 72963350-72964618(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAAATATTCCCTA
SmilChr01G006184 Chr01 NC_080387.1:77354636-77354648promoter 内 1938-1950 bp + 2051 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 77356699-77357470(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 ATAAGAATATTTT
SmilChr02G004381 Chr02 NC_080388.1:66163044-66163056promoter 内 1879-1891 bp + 2110 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 66165166-66169186(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 TCGAGTATATTCC
SmilChr01G003414 Chr01 NC_080387.1:52783846-52783858promoter 内 1873-1885 bp - 2116 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 52785974-52788731(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GTAATATTCTATT
SmilChr01G005022 Chr01 NC_080387.1:68203077-68203089promoter 内 1871-1883 bp - 2118 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 68197204-68200959(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GTTAGAATATACT
SmilChr01G003903 Chr01 NC_080387.1:57300563-57300575promoter 内 1865-1877 bp - 2124 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 57302699-57302894(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGGATATTCTACG
SmilChr01G004991 Chr01 NC_080387.1:67937658-67937670promoter 内 1824-1836 bp + 2165 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 67939835-67943482(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GGGGGAATATTTT
SmilChr02G004837 Chr02 NC_080388.1:70493961-70493973promoter 内 1815-1827 bp + 2174 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 70490461-70491787(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GTAATATTCCTCG
SmilChr01G002745 Chr01 NC_080387.1:45779474-45779486promoter 内 1743-1755 bp + 2246 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 45769517-45777228(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 ATAATATTCTTTT
SmilChr01G003490 Chr01 NC_080387.1:53451816-53451828promoter 内 1710-1722 bp - 2279 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 53454107-53456184(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 ATAATATTCTTTT
SmilChr01G003975 Chr01 NC_080387.1:58186679-58186691promoter 内 1704-1716 bp + 2285 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 58181847-58184394(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAAATATTCCCTA
SmilChr01G002244 Chr01 NC_080387.1:38984328-38984340promoter 内 1682-1694 bp - 2307 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 38980095-38982021(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AAACGAATATTAT
SmilChr02G000869 Chr02 NC_080388.1:14926023-14926035promoter 内 1628-1640 bp - 2361 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 14928396-14936575(+) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 GAAATATTCTAAT
SmilChr01G005897 Chr01 NC_080387.1:74887988-74888000promoter 内 1592-1604 bp + 2397 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 74881056-74885591(-) SMil_00019281-RA_Salv MP00252 AGTATATTCTAAC
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