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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G004408; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00011278-RA_Salv SmilChr08G004408 MYB XP_057780613.1 MP00114 AAGTTGGTAGGTGAG

可能结合的靶基因

9897 个结合位点 8151 个候选靶基因 第 67 / 164 下载 TSV

上一页 67 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr08G001783 Chr08 NC_080394.1:15029116-15029130promoter 内 140-154 bp + 3847 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 15032977-15036647(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CGTTTGGTAGGTATG
SmilChr03G000112 Chr03 NC_080389.1:1254662-1254676promoter 内 3965-3979 bp + 22 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 1241646-1254640(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CTCACCTACTCTACT
SmilChr03G000766 Chr03 NC_080389.1:8773528-8773542promoter 内 3953-3967 bp + 34 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 8760405-8773494(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TGCACCTACCCAATA
SmilChr01G001968 Chr01 NC_080387.1:35038296-35038310promoter 内 3927-3941 bp + 60 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 35032507-35038236(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATCACCTACCTCTCA
SmilChr02G000596 Chr02 NC_080388.1:8605066-8605080promoter 内 3921-3935 bp - 66 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 8605146-8607318(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CTCAACTACCAAAGC
SmilChr03G003064 Chr03 NC_080389.1:47584226-47584240promoter 内 3859-3873 bp + 128 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 47584368-47589089(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TGTAAAGTAGGTGAG
SmilChr08G000596 Chr08 NC_080394.1:4432832-4432846promoter 内 3838-3852 bp + 149 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 4432995-4436215(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATAAGAGTAGGTGGG
SmilChr08G000599 Chr08 NC_080394.1:4448808-4448822promoter 内 3838-3852 bp + 149 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 4448971-4450899(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATAAGAGTAGGTGGG
SmilChr04G000511 Chr04 NC_080390.1:5603461-5603475promoter 内 3824-3838 bp - 163 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 5603638-5604871(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ACCACCTACCTTTTT
SmilChr08G000035 Chr08 NC_080394.1:247960-247974promoter 内 3824-3838 bp + 163 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 248137-250766(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TGAAAGGTAGGTGTA
SmilChr01G003566 Chr01 NC_080387.1:54243902-54243916promoter 内 3809-3823 bp - 178 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 54242166-54243724(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TAGAAGGTAGGTATG
SmilChr03G000273 Chr03 NC_080389.1:3118826-3118840promoter 内 3809-3823 bp + 178 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 3115970-3118648(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CTCACCTACTCTACT
SmilChr02G000581 Chr02 NC_080388.1:8375014-8375028promoter 内 3796-3810 bp - 191 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 8373689-8374823(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATAAGAGTAGGTGGG
SmilChr06G000532 Chr06 NC_080392.1:4401036-4401050promoter 内 3659-3673 bp + 328 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 4399901-4400708(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GCCACCTACTACATC
SmilChr03G000001 Chr03 NC_080389.1:43083-43097promoter 内 3525-3539 bp - 462 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 40523-42621(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATAAGAGTAGGTGGG
SmilChr03G000113 Chr03 NC_080389.1:1244853-1244867promoter 内 3502-3516 bp + 485 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 1245352-1248850(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTAGAGTAGGTGAG
SmilChr01G000128 Chr01 NC_080387.1:2159128-2159142promoter 内 3495-3509 bp - 492 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 2150771-2158636(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATAAGAGTAGGTGGG
SmilChr08G000800 Chr08 NC_080394.1:5871777-5871791promoter 内 3452-3466 bp - 535 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 5872326-5872779(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GCCACCTACCGCACC
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SmilChr04G000611 Chr04 NC_080390.1:6900063-6900077promoter 内 3217-3231 bp + 770 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 6897804-6899293(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACTAATCA
SmilChr05G003175 Chr05 NC_080391.1:40672449-40672463promoter 内 3105-3119 bp + 882 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 40673345-40683654(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GGAATGGTAGGTGTC
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SmilChr02G002724 Chr02 NC_080388.1:47136105-47136119promoter 内 3057-3071 bp + 930 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 47137049-47139241(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTAAAAGTAGGTGGG
SmilChr08G001045 Chr08 NC_080394.1:7979110-7979124promoter 内 3034-3048 bp - 953 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 7980077-7983110(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATCACCTACCATTTT
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SmilChr07G003991 Chr07 NC_080393.1:50972983-50972997promoter 内 3014-3028 bp + 973 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 50964673-50972010(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ACCACCTACCTATCG
SmilChr07G004076 Chr07 NC_080393.1:52217409-52217423promoter 内 3008-3022 bp + 979 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 52213855-52216430(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GCCACCTACCGCACC
SmilChr04G002808 Chr04 NC_080390.1:44008629-44008643promoter 内 2961-2975 bp - 1026 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 44009669-44011722(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GCCACCTACCGCACC
SmilChr07G004160 Chr07 NC_080393.1:53486223-53486237promoter 内 2912-2926 bp - 1075 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 53487312-53500964(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CTCACCTAACATTTC
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SmilChr03G000402 Chr03 NC_080389.1:4387562-4387576promoter 内 2856-2870 bp - 1131 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 4385403-4386431(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATAAGAGTAGGTGGG
SmilChr08G000269 Chr08 NC_080394.1:1838879-1838893promoter 内 2817-2831 bp + 1170 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 1840063-1842057(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATAAGAGTAGGTGGG
SmilChr04G003847 Chr04 NC_080390.1:54468758-54468772promoter 内 2803-2817 bp - 1184 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 54469956-54473509(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCAACTACCAAACT
SmilChr02G002552 Chr02 NC_080388.1:44415773-44415787promoter 内 2762-2776 bp + 1225 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 44412869-44414548(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GCCACCTACCGCACC
SmilChr03G000264 Chr03 NC_080389.1:3055603-3055617promoter 内 2688-2702 bp + 1299 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 3056916-3064283(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTAGAGTAGGTGAG
SmilChr06G001239 Chr06 NC_080392.1:12779071-12779085promoter 内 2666-2680 bp + 1321 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 12776232-12777750(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCTACCCACCAACTT
SmilChr05G003176 Chr05 NC_080391.1:40672449-40672463promoter 内 2631-2645 bp + 1356 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 40673819-40674872(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GGAATGGTAGGTGTC
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SmilChr03G000401 Chr03 NC_080389.1:4387562-4387576promoter 内 2493-2507 bp - 1494 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 4377832-4386068(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATAAGAGTAGGTGGG
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SmilChr08G001007 Chr08 NC_080394.1:7579254-7579268promoter 内 2404-2418 bp - 1583 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 7580851-7583771(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATCACCTACCATTTT
SmilChr06G001722 Chr06 NC_080392.1:19840145-19840159promoter 内 2390-2404 bp + 1597 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 19841756-19851735(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AATAAAGTAGGTGAG
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SmilChr02G004973 Chr02 NC_080388.1:71620796-71620810promoter 内 2026-2040 bp + 1961 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 71622771-71626876(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GGAAGGGTAGGTGCA
SmilChr04G001172 Chr04 NC_080390.1:17539837-17539851promoter 内 1921-1935 bp - 2066 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 17541917-17543133(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GCCACCTACCGCACC