转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因,每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G004607; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00002089-RA_Salv SmilChr02G004607 C2H2 XP_057791470.1 MP00608 AAAAACAGAGCA

可能结合的靶基因

9817 个结合位点 6398 个候选靶基因 第 72 / 128 下载 TSV

上一页 72 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002176 Chr02 NC_080388.1:38986232-38986243promoter 内 1943-1954 bp - 2047 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 38980129-38984185(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 ATAAACAGAGGC
SmilChr01G003351 Chr01 NC_080387.1:52266783-52266794promoter 内 1900-1911 bp - 2090 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 52261010-52264693(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 ATGAACAGAGCA
SmilChr01G005147 Chr01 NC_080387.1:69256605-69256616promoter 内 1858-1869 bp - 2132 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 69252152-69254473(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAAAGGC
SmilChr02G001951 Chr02 NC_080388.1:35214976-35214987promoter 内 1800-1811 bp - 2190 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 35211877-35212786(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAGAG
SmilChr01G004347 Chr01 NC_080387.1:61613492-61613503promoter 内 1789-1800 bp + 2201 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 61615704-61616943(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAAAGGC
SmilChr03G001432 Chr03 NC_080389.1:16991042-16991053promoter 内 1735-1746 bp - 2255 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 16987485-16988787(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAGAG
SmilChr01G003865 Chr01 NC_080387.1:56894966-56894977promoter 内 1680-1691 bp - 2310 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 56897287-56900336(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GCCTCTGTTTAT
SmilChr03G000789 Chr03 NC_080389.1:9000581-9000592promoter 内 1511-1522 bp + 2479 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 8992586-8998102(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GCCTCTGTTTAT
SmilChr01G002568 Chr01 NC_080387.1:43784271-43784282promoter 内 1432-1443 bp - 2558 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 43781518-43781713(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAGAG
SmilChr03G001040 Chr03 NC_080389.1:12130826-12130837promoter 内 1299-1310 bp + 2691 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 12127188-12128135(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTCAT
SmilChr02G004063 Chr02 NC_080388.1:62928960-62928971promoter 内 1266-1277 bp - 2724 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 62931695-62936721(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CTCTCTGTTTTA
SmilChr01G001427 Chr01 NC_080387.1:27915667-27915678promoter 内 1212-1223 bp - 2778 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 27918456-27919332(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GCCTTTGTTTTT
SmilChr01G002424 Chr01 NC_080387.1:41742682-41742693promoter 内 1148-1159 bp + 2842 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 41745535-41746849(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAAAGGC
SmilChr02G000995 Chr02 NC_080388.1:17488253-17488264promoter 内 1147-1158 bp - 2843 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 17482184-17485410(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 ATGAACAGAGCA
SmilChr01G002515 Chr01 NC_080387.1:43104720-43104731promoter 内 1140-1151 bp - 2850 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 43098669-43101870(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 ATGAACAGAGCA
SmilChr02G000241 Chr02 NC_080388.1:3118535-3118546promoter 内 1130-1141 bp - 2860 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 3112493-3115675(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 ATGAACAGAGCA
SmilChr01G001048 Chr01 NC_080387.1:21769632-21769643promoter 内 1111-1122 bp + 2879 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 21772522-21840439(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGAAACAGAGAG
SmilChr01G003017 Chr01 NC_080387.1:49194590-49194601promoter 内 1111-1122 bp + 2879 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 49197480-49200171(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 ATGAACAGAGCA
SmilChr02G001105 Chr02 NC_080388.1:19867924-19867935promoter 内 1109-1120 bp + 2881 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 19870816-19873507(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 ATGAACAGAGCA
SmilChr01G003758 Chr01 NC_080387.1:55969736-55969747promoter 内 1106-1117 bp - 2884 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 55972631-55975320(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTCAT
SmilChr01G001421 Chr01 NC_080387.1:27809520-27809531promoter 内 1103-1114 bp + 2887 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 27812418-27815565(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 ATGAACAGAGCA
SmilChr01G003757 Chr01 NC_080387.1:55969736-55969747promoter 内 1058-1069 bp - 2932 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 55963691-55966804(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 ATGAACAGAGCA
SmilChr01G001052 Chr01 NC_080387.1:21858610-21858621promoter 内 1010-1021 bp - 2980 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 21854656-21855630(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TAAAACAGAGAG
SmilChr01G002023 Chr01 NC_080387.1:35796686-35796697promoter 内 979-990 bp + 3011 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 35792603-35793675(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GCCTTTGTTTTT
SmilChr01G002051 Chr01 NC_080387.1:36316053-36316064promoter 内 954-965 bp - 3036 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 36319100-36320150(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GCCTTTGTTTTT
SmilChr02G003296 Chr02 NC_080388.1:54230187-54230198promoter 内 741-752 bp - 3249 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 54233447-54235258(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCATTT
SmilChr01G004381 Chr01 NC_080387.1:61996562-61996573promoter 内 502-513 bp - 3488 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 62000061-62002883(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCTTAT
SmilChr02G000962 Chr02 NC_080388.1:16785950-16785961promoter 内 409-420 bp + 3581 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 16776812-16782369(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCATTT
SmilChr02G000864 Chr02 NC_080388.1:14887761-14887772promoter 内 362-373 bp - 3628 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 14891400-14894409(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CTCTCTGTTTCA
SmilChr02G003104 Chr02 NC_080388.1:51963188-51963199promoter 内 277-288 bp + 3713 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 51966912-51969101(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TAAAACAGAGAG
SmilChr03G001079 Chr03 NC_080389.1:12476800-12476811promoter 内 117-128 bp - 3873 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 12480684-12481652(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTTCAT
SmilChr02G003388 Chr02 NC_080388.1:54983132-54983143promoter 内 3452-3463 bp - 538 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 4 54983681-54986207(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGTTCTGTTTTG
SmilChr02G000514 Chr02 NC_080388.1:7105767-7105778promoter 内 1170-1181 bp + 2820 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 4 7108598-7108704(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAAAACAGAACT
SmilChr02G002563 Chr02 NC_080388.1:44572350-44572361promoter 内 1150-1161 bp - 2840 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 4 44569404-44569510(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAAAACAGAACT
SmilChr02G002565 Chr02 NC_080388.1:44627550-44627561promoter 内 1149-1160 bp - 2841 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 4 44624603-44624709(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAAAACAGAACT
SmilChr01G000447 Chr01 NC_080387.1:9147000-9147011promoter 内 2152-2163 bp + 1838 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 3 9140781-9145162(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 ATCTCTGTTCCT
SmilChr02G001068 Chr02 NC_080388.1:18996864-18996875promoter 内 1446-1457 bp + 2544 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 3 18992446-18994320(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 ATCTCTGTTCCT
SmilChr02G003279 Chr02 NC_080388.1:54081071-54081082promoter 内 1373-1384 bp - 2617 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 3 54083699-54084713(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGTTCTGTTTTG
SmilChr02G001516 Chr02 NC_080388.1:28277997-28278008promoter 内 1274-1285 bp + 2716 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 3 28275200-28275281(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGTTCTGTTTCG
SmilChr02G003755 Chr02 NC_080388.1:59208303-59208314promoter 内 1202-1213 bp - 2788 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 3 59205409-59205515(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAAAACAGAACT
SmilChr02G003387 Chr02 NC_080388.1:54983132-54983143promoter 内 1166-1177 bp - 2824 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 3 54980202-54980308(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAAAACAGAACT
SmilChr02G001844 Chr02 NC_080388.1:33661324-33661335promoter 内 3669-3680 bp + 321 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 33657329-33661003(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGTTCTGTTTTG
SmilChr01G004830 Chr01 NC_080387.1:66435716-66435727promoter 内 3512-3523 bp - 478 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 66436205-66438902(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTCTCTGTTCCA
SmilChr01G001623 Chr01 NC_080387.1:30313375-30313386promoter 内 3350-3361 bp + 640 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 30314026-30315456(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGAGACAGAGCG
SmilChr02G003548 Chr02 NC_080388.1:56628149-56628160promoter 内 3323-3334 bp + 667 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 56620362-56627482(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTCTCTGTTCCA
SmilChr02G003606 Chr02 NC_080388.1:57311263-57311274promoter 内 3171-3182 bp + 819 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 57304569-57310444(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTCTCTGTTCCA
SmilChr02G005461 Chr02 NC_080388.1:74916688-74916699promoter 内 3103-3114 bp - 887 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 74917586-74920857(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TTCTCTGTTCCA
SmilChr01G001037 Chr01 NC_080387.1:21566941-21566952promoter 内 2905-2916 bp + 1085 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 21558355-21565856(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GTCTCTGTTCCG
SmilChr02G003102 Chr02 NC_080388.1:51955813-51955824promoter 内 2070-2081 bp - 1920 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 51951341-51953893(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TAGAACAGAGCT
SmilChr01G004828 Chr01 NC_080387.1:66435716-66435727promoter 内 1752-1763 bp - 2238 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 66432362-66433478(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGGAACAGAGAA