转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 74 / 136 下载 TSV

上一页 74 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G001584 Chr05 NC_080391.1:14545639-14545649promoter 内 2634-2644 bp + 1357 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 14543140-14544282(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGACCA
SmilChr05G001585 Chr05 NC_080391.1:14566015-14566025promoter 内 2632-2642 bp + 1359 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 14563514-14564656(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGACCA
SmilChr07G001900 Chr07 NC_080393.1:16412893-16412903promoter 内 2610-2620 bp + 1381 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 16414284-16417336(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGGT
SmilChr08G000782 Chr08 NC_080394.1:5762600-5762610promoter 内 2526-2536 bp + 1465 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 5751986-5761135(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACGCTGAGCA
SmilChr03G000426 Chr03 NC_080389.1:4649754-4649764promoter 内 2518-2528 bp + 1473 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 4646667-4648281(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGGGTG
SmilChr02G001578 Chr02 NC_080388.1:29378271-29378281promoter 内 2498-2508 bp - 1493 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 29379774-29381798(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGACCA
SmilChr07G001326 Chr07 NC_080393.1:10199458-10199468promoter 内 2444-2454 bp + 1547 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 10194134-10197911(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGTT
SmilChr08G001364 Chr08 NC_080394.1:10888980-10888990promoter 内 2407-2417 bp - 1584 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 10885175-10887396(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCGG
SmilChr03G000830 Chr03 NC_080389.1:9528086-9528096promoter 内 2391-2401 bp - 1600 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 9523345-9526486(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGTCAGCGCC
SmilChr04G000204 Chr04 NC_080390.1:1821686-1821696promoter 内 2320-2330 bp + 1671 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 1818353-1820015(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGTT
SmilChr01G002635 Chr01 NC_080387.1:44633529-44633539promoter 内 2303-2313 bp - 1688 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 44635227-44639956(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGTT
SmilChr01G004390 Chr01 NC_080387.1:62060350-62060360promoter 内 2303-2313 bp + 1688 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 62056274-62058662(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAACA
SmilChr05G001556 Chr05 NC_080391.1:14287237-14287247promoter 内 2272-2282 bp - 1719 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 14279690-14285518(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCACG
SmilChr07G001784 Chr07 NC_080393.1:15157890-15157900promoter 内 2249-2259 bp - 1742 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 15159642-15163020(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGTGCA
SmilChr04G003937 Chr04 NC_080390.1:54993251-54993261promoter 内 2243-2253 bp - 1748 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 54995009-54998521(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGTGCA
SmilChr07G001670 Chr07 NC_080393.1:14162125-14162135promoter 内 2193-2203 bp - 1798 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 14163933-14165336(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCGGCTGAGCA
SmilChr01G001476 Chr01 NC_080387.1:28554513-28554523promoter 内 2158-2168 bp - 1833 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 28551799-28552680(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CAGTCAGCGCG
SmilChr04G000621 Chr04 NC_080390.1:7039900-7039910promoter 内 2140-2150 bp - 1851 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 7037654-7038049(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCACG
SmilChr02G002255 Chr02 NC_080388.1:39980073-39980083promoter 内 2132-2142 bp + 1859 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 39981942-39983388(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCACG
SmilChr08G001404 Chr08 NC_080394.1:11250665-11250675promoter 内 2121-2131 bp + 1870 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 11252545-11261422(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCGG
SmilChr02G002125 Chr02 NC_080388.1:38019880-38019890promoter 内 2073-2083 bp + 1918 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 38015292-38017962(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGTGCTGAGCA
SmilChr07G003465 Chr07 NC_080393.1:38732702-38732712promoter 内 2071-2081 bp + 1920 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 38734632-38736278(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGGT
SmilChr03G000891 Chr03 NC_080389.1:10174251-10174261promoter 内 2038-2048 bp + 1953 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 10171108-10172298(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAACA
SmilChr01G002865 Chr01 NC_080387.1:47259084-47259094promoter 内 2010-2020 bp + 1981 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 47249276-47257103(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGTT
SmilChr06G000904 Chr06 NC_080392.1:8518169-8518179promoter 内 1987-1997 bp + 2004 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 8515124-8516165(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGTGCTGAGCA
SmilChr01G006117 Chr01 NC_080387.1:76699798-76699808promoter 内 1934-1944 bp - 2057 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 76701865-76702674(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGTT
SmilChr08G000261 Chr08 NC_080394.1:1796078-1796088promoter 内 1928-1938 bp + 2063 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 1798151-1802847(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGGT
SmilChr05G001177 Chr05 NC_080391.1:9875116-9875126promoter 内 1892-1902 bp - 2099 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 9870211-9873017(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGGT
SmilChr07G003791 Chr07 NC_080393.1:46626297-46626307promoter 内 1811-1821 bp + 2180 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 46628487-46633250(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCACAGCGCG
SmilChr01G001658 Chr01 NC_080387.1:30646106-30646116promoter 内 1779-1789 bp + 2212 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 30648328-30650655(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCACAGCGCG
SmilChr04G003774 Chr04 NC_080390.1:53932056-53932066promoter 内 1745-1755 bp + 2246 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 53934312-53937175(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGGT
SmilChr04G002557 Chr04 NC_080390.1:40875259-40875269promoter 内 1739-1749 bp - 2252 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 40877521-40880801(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGTGCA
SmilChr04G003603 Chr04 NC_080390.1:52472110-52472120promoter 内 1719-1729 bp + 2272 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 52474392-52474475(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCGG
SmilChr07G002757 Chr07 NC_080393.1:27389018-27389028promoter 内 1708-1718 bp - 2283 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 27385203-27386735(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACCCAGCGCG
SmilChr02G003120 Chr02 NC_080388.1:52217209-52217219promoter 内 1699-1709 bp - 2292 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 52213582-52214917(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCCCT
SmilChr01G002803 Chr01 NC_080387.1:46568442-46568452promoter 内 1697-1707 bp - 2294 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 46570746-46573227(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGTT
SmilChr04G004105 Chr04 NC_080390.1:56011321-56011331promoter 内 1684-1694 bp - 2307 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 56013638-56016249(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGTGCTGAGCA
SmilChr02G000860 Chr02 NC_080388.1:14778929-14778939promoter 内 1638-1648 bp + 2353 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 14764178-14776576(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGACCG
SmilChr02G000855 Chr02 NC_080388.1:14572529-14572539promoter 内 1622-1632 bp + 2369 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 14556984-14570160(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGACCG
SmilChr08G003422 Chr08 NC_080394.1:36429178-36429188promoter 内 1615-1625 bp - 2376 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 36423826-36426802(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCCCT
SmilChr01G000190 Chr01 NC_080387.1:3261291-3261301promoter 内 1611-1621 bp + 2380 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 3263681-3265926(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCCCT
SmilChr04G000052 Chr04 NC_080390.1:459933-459943promoter 内 1589-1599 bp - 2402 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 462345-464873(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGACCA
SmilChr01G000980 Chr01 NC_080387.1:20760125-20760135promoter 内 1566-1576 bp + 2425 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 20753926-20757700(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGACTG
SmilChr04G003800 Chr04 NC_080390.1:54185017-54185027promoter 内 1557-1567 bp - 2434 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 54180144-54182583(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGTCAGCGCC
SmilChr08G003496 Chr08 NC_080394.1:37550174-37550184promoter 内 1542-1552 bp + 2449 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 37547147-37547725(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACGCTGAGCA
SmilChr01G004397 Chr01 NC_080387.1:62113180-62113190promoter 内 1481-1491 bp - 2510 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 62115700-62117532(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGACCA
SmilChr02G000987 Chr02 NC_080388.1:17360918-17360928promoter 内 1450-1460 bp - 2541 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 17363469-17366231(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCGGCTGAGCA
SmilChr01G006087 Chr01 NC_080387.1:76368384-76368394promoter 内 1426-1436 bp - 2565 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 76354954-76365819(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TACTCAGCGTG
SmilChr04G002109 Chr04 NC_080390.1:34078062-34078072promoter 内 1390-1400 bp + 2601 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 34074013-34075461(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGGCTGAGCG
SmilChr01G002522 Chr01 NC_080387.1:43184338-43184348promoter 内 1389-1399 bp - 2602 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 43186950-43188398(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGGGCTGAGCG