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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 74 / 149 下载 TSV

上一页 74 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G001490 Chr04 NC_080390.1:24357724-24357734promoter 内 44-54 bp + 3947 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 24350011-24353777(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTTA
SmilChr07G000215 Chr07 NC_080393.1:1384668-1384678promoter 内 22-32 bp + 3969 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 1377815-1380699(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGG
SmilChr03G000059 Chr03 NC_080389.1:630605-630615promoter 内 3-13 bp + 3988 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 624084-626617(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTAG
SmilChr05G001413 Chr05 NC_080391.1:12750472-12750482promoter 内 924-934 bp - 3067 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 5 12753549-12754367(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCTA
SmilChr01G001252 Chr01 NC_080387.1:25161484-25161494promoter 内 1097-1107 bp + 2894 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 4 25164388-25164972(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTAAGCTGTCA
SmilChr02G000935 Chr02 NC_080388.1:16332669-16332679promoter 内 3920-3930 bp - 71 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 3 16332750-16336805(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTAA
SmilChr05G001412 Chr05 NC_080391.1:12750472-12750482promoter 内 2045-2055 bp - 1946 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 3 12752428-12753252(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCTA
SmilChr03G003651 Chr03 NC_080389.1:55275371-55275381promoter 内 1891-1901 bp + 2100 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 3 55271835-55273271(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCTA
SmilChr07G000060 Chr07 NC_080393.1:278086-278096promoter 内 1440-1450 bp - 2551 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 3 270185-275535(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCAAGCTGTCC
SmilChr01G001210 Chr01 NC_080387.1:24331229-24331239promoter 内 1151-1161 bp + 2840 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 3 24334079-24334794(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCG
SmilChr06G000933 Chr06 NC_080392.1:8859454-8859464promoter 内 3909-3919 bp - 82 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 8855261-8859372(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCG
SmilChr06G003087 Chr06 NC_080392.1:43733552-43733562promoter 内 3832-3842 bp - 159 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 43733721-43736786(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCTA
SmilChr02G001924 Chr02 NC_080388.1:34649790-34649800promoter 内 3657-3667 bp - 334 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 34650134-34653116(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCTA
SmilChr02G001837 Chr02 NC_080388.1:33473860-33473870promoter 内 3612-3622 bp + 379 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 33471214-33473481(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTCTG
SmilChr01G002353 Chr01 NC_080387.1:40701607-40701617promoter 内 3316-3326 bp + 675 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 40680169-40700932(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCTA
SmilChr03G001831 Chr03 NC_080389.1:25087676-25087686promoter 内 3132-3142 bp + 859 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 25088545-25089437(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCAAGCTGTCC
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SmilChr07G002621 Chr07 NC_080393.1:25278016-25278026promoter 内 3092-3102 bp + 899 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 25278925-25282992(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCAAGCTGTCC
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SmilChr07G002673 Chr07 NC_080393.1:26043201-26043211promoter 内 2294-2304 bp + 1697 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 26037301-26041504(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCTA
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SmilChr04G001751 Chr04 NC_080390.1:28830136-28830146promoter 内 1471-1481 bp - 2520 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 28826880-28827616(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTAAGCTGTCA
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SmilChr02G001035 Chr02 NC_080388.1:18398011-18398021promoter 内 1416-1426 bp + 2575 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 18393809-18395436(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTCTG
SmilChr01G001557 Chr01 NC_080387.1:29590557-29590567promoter 内 1364-1374 bp - 2627 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 29593194-29595995(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGTG
SmilChr02G000498 Chr02 NC_080388.1:6861497-6861507promoter 内 1260-1270 bp + 2731 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 6864238-6867223(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTAAGCTGTCA
SmilChr01G001270 Chr01 NC_080387.1:25378129-25378139promoter 内 1108-1118 bp - 2883 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 25381022-25384673(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCTA
SmilChr02G002377 Chr02 NC_080388.1:41657991-41658001promoter 内 1095-1105 bp - 2896 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 41660897-41662976(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCTA
SmilChr01G001125 Chr01 NC_080387.1:22853327-22853337promoter 内 1015-1025 bp + 2976 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 22856313-22858491(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTAAGCTGTCA
SmilChr02G000802 Chr02 NC_080388.1:13392341-13392351promoter 内 1008-1018 bp - 2983 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 13395334-13396059(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTCTG
SmilChr02G005552 Chr02 NC_080388.1:75492420-75492430promoter 内 862-872 bp + 3129 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 75495559-75498044(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCG
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SmilChr07G000901 Chr07 NC_080393.1:6457638-6457648promoter 内 350-360 bp + 3641 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 6461289-6464051(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCAAGCTGTCC
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SmilChr07G002619 Chr07 NC_080393.1:25278016-25278026promoter 内 35-45 bp + 3956 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 25272812-25274060(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTGA
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SmilChr01G002135 Chr01 NC_080387.1:37338042-37338052promoter 内 3964-3974 bp - 27 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 37338079-37338807(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTCTG
SmilChr02G000629 Chr02 NC_080388.1:9493836-9493846promoter 内 3955-3965 bp - 36 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 9493882-9494572(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCTA
SmilChr07G000062 Chr07 NC_080393.1:287704-287714promoter 内 3948-3958 bp - 43 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 279241-287661(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCAAGCTGTCC
SmilChr06G000260 Chr06 NC_080392.1:1715861-1715871promoter 内 3905-3915 bp + 86 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 1714115-1715775(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTCCAGCTGGG
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SmilChr05G003883 Chr05 NC_080391.1:52593394-52593404promoter 内 3883-3893 bp + 108 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 1 52593512-52597822(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACAGCTGTAA