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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G004392; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00022653-RA_Salv SmilChr05G004392 WRKY XP_057811204.1 MP00506 AAAAGTCAACGAC

可能结合的靶基因

9818 个结合位点 7173 个候选靶基因 第 75 / 144 下载 TSV

上一页 75 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G001091 Chr04 NC_080390.1:15618514-15618526promoter 内 3772-3784 bp + 217 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 15618743-15622884(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CCCAGTCAACGTG
SmilChr02G001633 Chr02 NC_080388.1:30287228-30287240promoter 内 3752-3764 bp - 237 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 30284726-30286991(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TAAAGTCAATGCA
SmilChr01G000594 Chr01 NC_080387.1:12938369-12938381promoter 内 3743-3755 bp - 246 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 12938627-12948947(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TGAGTTGACTATT
SmilChr01G002156 Chr01 NC_080387.1:37565029-37565041promoter 内 3701-3713 bp - 288 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 37565329-37567601(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AACGTTGACCACG
SmilChr03G002980 Chr03 NC_080389.1:46630112-46630124promoter 内 3691-3703 bp - 298 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 46626245-46629814(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CCAAGTCAATGCC
SmilChr04G000823 Chr04 NC_080390.1:10328161-10328173promoter 内 3638-3650 bp + 351 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 10328524-10331716(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TAAAGTCAATGCA
SmilChr02G003821 Chr02 NC_080388.1:59832732-59832744promoter 内 3619-3631 bp + 370 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 59823695-59832362(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TGCATTGACTTTA
SmilChr02G003793 Chr02 NC_080388.1:59588911-59588923promoter 内 3604-3616 bp + 385 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 59579878-59588526(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TGCATTGACTTTA
SmilChr02G002450 Chr02 NC_080388.1:42756283-42756295promoter 内 3595-3607 bp - 394 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 42755311-42755889(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TAAAGTCAATGGA
SmilChr04G001517 Chr04 NC_080390.1:25030217-25030229promoter 内 3536-3548 bp + 453 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 25025588-25029764(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GAGTTTGACTTTG
SmilChr01G003318 Chr01 NC_080387.1:51907072-51907084promoter 内 3401-3413 bp - 588 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 51905777-51906484(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TAAAGTCAATGCA
SmilChr03G001098 Chr03 NC_080389.1:12652763-12652775promoter 内 3398-3410 bp - 591 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 12653366-12654334(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TATGTTGACTATT
SmilChr02G000473 Chr02 NC_080388.1:6470421-6470433promoter 内 3314-3326 bp - 675 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 6467041-6469746(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TGAAGTCAACAGA
SmilChr02G002541 Chr02 NC_080388.1:44275595-44275607promoter 内 3274-3286 bp - 715 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 44263095-44274880(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 ATTAGTCAACCGC
SmilChr01G001929 Chr01 NC_080387.1:34455078-34455090promoter 内 3182-3194 bp + 807 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 34455897-34457066(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TAAAGTCAATGCA
SmilChr01G000808 Chr01 NC_080387.1:17470169-17470181promoter 内 3077-3089 bp + 912 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 17468334-17469257(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TCCATTGACTTTA
SmilChr02G002510 Chr02 NC_080388.1:43566648-43566660promoter 内 3056-3068 bp + 933 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 43565565-43565715(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TCCATTGACTTTA
SmilChr04G001244 Chr04 NC_080390.1:19578076-19578088promoter 内 3002-3014 bp - 987 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 19574648-19577089(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AAAAGTCAAGGCT
SmilChr02G002507 Chr02 NC_080388.1:43545906-43545918promoter 内 3001-3013 bp + 988 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 43544768-43544918(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TCCATTGACTTTA
SmilChr03G000584 Chr03 NC_080389.1:6506440-6506452promoter 内 2954-2966 bp + 1035 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 6504695-6505405(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TTCTTTGACTTCG
SmilChr02G000316 Chr02 NC_080388.1:3981819-3981831promoter 内 2907-2919 bp - 1082 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 3982913-3984679(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TGCATTGACTTTA
SmilChr01G003224 Chr01 NC_080387.1:51007310-51007322promoter 内 2892-2904 bp + 1097 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 51008419-51009645(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TAAAGTCAATGCA
SmilChr03G002493 Chr03 NC_080389.1:39714010-39714022promoter 内 2808-2820 bp - 1181 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 39715203-39718804(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GCTGTTGACTAGT
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SmilChr04G000399 Chr04 NC_080390.1:4117033-4117045promoter 内 2442-2454 bp - 1547 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 4118592-4120985(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GCATTTGACTTTT
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SmilChr01G004701 Chr01 NC_080387.1:65125217-65125229promoter 内 2402-2414 bp + 1587 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 65126816-65129837(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CATAGTCAACAAT
SmilChr02G005495 Chr02 NC_080388.1:75107526-75107538promoter 内 2386-2398 bp - 1603 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 75104660-75105923(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GACAGTCAACACA
SmilChr04G000008 Chr04 NC_080390.1:124397-124409promoter 内 2318-2330 bp + 1671 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 126080-127625(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TAGGGTCAACGTT
SmilChr01G003708 Chr01 NC_080387.1:55432555-55432567promoter 内 2148-2160 bp - 1841 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 55434408-55435001(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CACGTTGACCACT
SmilChr02G003802 Chr02 NC_080388.1:59653345-59653357promoter 内 2101-2113 bp - 1888 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 59655245-59658777(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AGGGTTGACTATA
SmilChr02G005243 Chr02 NC_080388.1:73602548-73602560promoter 内 2087-2099 bp - 1902 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 73599124-73600646(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AAAAGTCAAGGGA
SmilChr03G002523 Chr03 NC_080389.1:40214331-40214343promoter 内 2064-2076 bp - 1925 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 40216268-40219071(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GAGTTTGACTTTG
SmilChr02G002787 Chr02 NC_080388.1:47938991-47939003promoter 内 2025-2037 bp + 1964 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 47940967-47944805(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TAAAGTCAATGCA
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SmilChr02G000237 Chr02 NC_080388.1:3018608-3018620promoter 内 1787-1799 bp + 2202 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 3020822-3022040(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AATAGTCAACTCA
SmilChr03G000854 Chr03 NC_080389.1:9765737-9765749promoter 内 1774-1786 bp - 2215 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 9762111-9763522(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TAAAGTCAATGCA
SmilChr03G003368 Chr03 NC_080389.1:52041994-52042006promoter 内 1614-1626 bp + 2375 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 52034681-52039619(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AAGGTTGACTTGG
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SmilChr01G003865 Chr01 NC_080387.1:56894529-56894541promoter 内 1243-1255 bp + 2746 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 56897287-56900336(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AATAGTCAACTCA