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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G004447; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027346-RA_Salv SmilChr02G004447 HD-ZIP XP_057797242.1 MP00200 AAAAGTAATGATTAC

可能结合的靶基因

9930 个结合位点 6661 个候选靶基因 第 77 / 134 下载 TSV

上一页 77 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G002051 Chr03 NC_080389.1:31064210-31064224promoter 内 422-436 bp + 3565 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 31060250-31060645(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTAGTAGA
SmilChr01G005380 Chr01 NC_080387.1:71026764-71026778promoter 内 336-350 bp + 3651 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 71030429-71031319(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GAGATTGATGATTAC
SmilChr01G003473 Chr01 NC_080387.1:53273640-53273654promoter 内 286-300 bp + 3701 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 53277355-53281155(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACGTGTGATGATTAA
SmilChr01G001333 Chr01 NC_080387.1:26523993-26524007promoter 内 279-293 bp - 3708 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 26527715-26528434(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAAATCATTACCACC
SmilChr02G003551 Chr02 NC_080388.1:56656109-56656123promoter 内 3956-3970 bp + 31 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 56650319-56656078(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTAAATTA
SmilChr02G004171 Chr02 NC_080388.1:64011545-64011559promoter 内 3950-3964 bp - 37 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 64004190-64011508(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AATACCAATGATTGA
SmilChr02G003609 Chr02 NC_080388.1:57346798-57346812promoter 内 3896-3910 bp + 91 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 57340981-57346707(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTAAATTA
SmilChr01G002720 Chr01 NC_080387.1:45486781-45486795promoter 内 3887-3901 bp + 100 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 45484868-45486681(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCAATCATTGCACAT
SmilChr01G003664 Chr01 NC_080387.1:55065698-55065712promoter 内 3823-3837 bp - 164 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 55061660-55065534(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AGTTGAAATGATTAT
SmilChr02G001952 Chr02 NC_080388.1:35214228-35214242promoter 内 3813-3827 bp + 174 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 35214416-35229933(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAAATCAATGATTAT
SmilChr03G000264 Chr03 NC_080389.1:3056728-3056742promoter 内 3813-3827 bp + 174 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 3056916-3064283(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCACATAATGATGAA
SmilChr02G003522 Chr02 NC_080388.1:56395383-56395397promoter 内 3805-3819 bp - 182 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 56395579-56397687(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTAATATA
SmilChr01G002850 Chr01 NC_080387.1:47075768-47075782promoter 内 3792-3806 bp - 195 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 47072622-47075573(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAGTTAATGATTAT
SmilChr02G003172 Chr02 NC_080388.1:52824761-52824775promoter 内 3731-3745 bp + 256 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 52825031-52826664(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TAATTTAATGATTAT
SmilChr03G000276 Chr03 NC_080389.1:3135658-3135672promoter 内 3723-3737 bp + 264 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 3135936-3139581(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCACATAATGATGAA
SmilChr01G003983 Chr01 NC_080387.1:58283788-58283802promoter 内 3686-3700 bp - 301 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 58281499-58283487(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TATTGAAATGATTAT
SmilChr01G002402 Chr01 NC_080387.1:41380966-41380980promoter 内 3638-3652 bp - 349 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 41381329-41382443(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTCATCATTATCGAA
SmilChr02G004778 Chr02 NC_080388.1:69950143-69950157promoter 内 3632-3646 bp - 355 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 69950512-69956552(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTAATCATTGTAGTA
SmilChr03G002312 Chr03 NC_080389.1:36379646-36379660promoter 内 3613-3627 bp - 374 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 36378395-36379272(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AGAGTTAATGATGAA
SmilChr01G002483 Chr01 NC_080387.1:42562782-42562796promoter 内 3547-3561 bp + 440 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 42558945-42562342(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTAAATTA
SmilChr02G000916 Chr02 NC_080388.1:15891925-15891939promoter 内 3520-3534 bp - 467 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 15885038-15891458(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TACAATGATGATTAT
SmilChr01G004887 Chr01 NC_080387.1:66932369-66932383promoter 内 3472-3486 bp + 515 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 66932898-66933727(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TATTGTAATGATAAT
SmilChr01G002016 Chr01 NC_080387.1:35733806-35733820promoter 内 3422-3436 bp - 565 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 35732175-35733241(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TAAAGTAATTATTAT
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SmilChr01G002056 Chr01 NC_080387.1:36357452-36357466promoter 内 3365-3379 bp + 622 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 36358088-36359104(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TAAAGTAATTATTAT
SmilChr01G002156 Chr01 NC_080387.1:37564684-37564698promoter 内 3356-3370 bp - 631 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 37565329-37567601(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATCTCCATC
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SmilChr01G004586 Chr01 NC_080387.1:63888565-63888579promoter 内 3295-3309 bp - 692 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 63889271-63890999(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTAATTATTACTTTA
SmilChr01G002290 Chr01 NC_080387.1:39738128-39738142promoter 内 3292-3306 bp + 695 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 39735727-39737433(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTTCAACT
SmilChr03G000263 Chr03 NC_080389.1:3056728-3056742promoter 内 3217-3231 bp + 770 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 3052567-3055958(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTCATCATTATGTGA
SmilChr03G001877 Chr03 NC_080389.1:26050706-26050720promoter 内 3166-3180 bp + 821 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 26051541-26060128(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GAAAAAAATGATTGC
SmilChr01G004414 Chr01 NC_080387.1:62270781-62270795promoter 内 3124-3138 bp + 863 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 62267610-62269918(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTAATCATTAAAATT
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SmilChr02G003875 Chr02 NC_080388.1:60803431-60803445promoter 内 3096-3110 bp + 891 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 60804336-60805807(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAGATTAATGATGAG
SmilChr02G000395 Chr02 NC_080388.1:4921089-4921103promoter 内 3036-3050 bp - 951 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 4888513-4920138(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAGTTTAATGATTAT
SmilChr01G000706 Chr01 NC_080387.1:15835316-15835330promoter 内 3015-3029 bp - 972 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 15833440-15834344(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GGTGGTTATGATTAC
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SmilChr01G004201 Chr01 NC_080387.1:60479880-60479894promoter 内 2290-2304 bp + 1697 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 60477960-60478183(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTTTTTTC
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SmilChr02G005028 Chr02 NC_080388.1:72017859-72017873promoter 内 2206-2220 bp + 1781 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 72019654-72023823(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GACATTAATGATGAT