转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 78 / 143 下载 TSV

上一页 78 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G003407 Chr03 NC_080389.1:52411958-52411969promoter 内 2117-2128 bp + 1873 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 52413842-52414897(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGGG
SmilChr05G004029 Chr05 NC_080391.1:54299080-54299091promoter 内 2042-2053 bp - 1948 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 54301039-54303721(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTAGT
SmilChr07G003473 Chr07 NC_080393.1:38949028-38949039promoter 内 1996-2007 bp - 1994 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 38951033-38953195(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAACTGTCAA
SmilChr03G004521 Chr03 NC_080389.1:63280051-63280062promoter 内 1988-1999 bp + 2002 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 63273797-63278049(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTAGT
SmilChr03G000757 Chr03 NC_080389.1:8642566-8642577promoter 内 1901-1912 bp - 2089 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 8644666-8646235(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGATT
SmilChr02G003970 Chr02 NC_080388.1:61879080-61879091promoter 内 1897-1908 bp - 2093 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 61876547-61876987(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTAGA
SmilChr04G001374 Chr04 NC_080390.1:22318597-22318608promoter 内 1427-1438 bp - 2563 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 22321171-22322319(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGCAGCTGTCAC
SmilChr05G002777 Chr05 NC_080391.1:32366290-32366301promoter 内 1270-1281 bp + 2720 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 32338545-32363570(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTAGT
SmilChr05G001277 Chr05 NC_080391.1:10923753-10923764promoter 内 1215-1226 bp - 2775 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 10913881-10920978(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGTCCAGCTGTG
SmilChr04G003189 Chr04 NC_080390.1:48592566-48592577promoter 内 1115-1126 bp + 2875 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 48580804-48589691(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCCA
SmilChr08G000955 Chr08 NC_080394.1:7110360-7110371promoter 内 1106-1117 bp + 2884 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 7113255-7114840(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTAGA
SmilChr01G001959 Chr01 NC_080387.1:34844594-34844605promoter 内 1045-1056 bp + 2945 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 34847550-34851223(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGGG
SmilChr05G004028 Chr05 NC_080391.1:54299080-54299091promoter 内 1022-1033 bp - 2968 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 54291683-54296112(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTACAGCTGAC
SmilChr08G001412 Chr08 NC_080394.1:11314572-11314583promoter 内 991-1002 bp - 2999 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 11309089-11311573(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTACAGCTGAC
SmilChr06G003051 Chr06 NC_080392.1:43406710-43406721promoter 内 981-992 bp - 3009 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 43402452-43403701(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGGG
SmilChr06G002133 Chr06 NC_080392.1:28731100-28731111promoter 内 837-848 bp - 3153 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 28726910-28727947(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATCCAGCTGTG
SmilChr03G003592 Chr03 NC_080389.1:54568865-54568876promoter 内 572-583 bp + 3418 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 54572294-54574332(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTACAGCTGAC
SmilChr05G002150 Chr05 NC_080391.1:22716612-22716623promoter 内 540-551 bp + 3450 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 22707872-22713162(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCCA
SmilChr01G001544 Chr01 NC_080387.1:29442248-29442259promoter 内 404-415 bp - 3586 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 29445845-29446040(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTAGCTGTCGT
SmilChr03G000758 Chr03 NC_080389.1:8642566-8642577promoter 内 330-341 bp - 3660 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 8646237-8647566(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGATT
SmilChr01G000166 Chr01 NC_080387.1:2740933-2740944promoter 内 263-274 bp + 3727 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 2736844-2737206(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTAGCTGTCTC
SmilChr01G001542 Chr01 NC_080387.1:29442248-29442259promoter 内 196-207 bp - 3794 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 29435888-29438454(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGACAGCTAAC
SmilChr03G001510 Chr03 NC_080389.1:18509120-18509131promoter 内 183-194 bp + 3807 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 18512938-18514058(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATCCAGCTGTG
SmilChr01G005306 Chr01 NC_080387.1:70320963-70320974promoter 内 181-192 bp + 3809 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 70324783-70325698(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTGCC
SmilChr04G000856 Chr04 NC_080390.1:10873839-10873850promoter 内 148-159 bp - 3842 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 10869096-10869997(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGGG
SmilChr06G002739 Chr06 NC_080392.1:39696215-39696226promoter 内 144-155 bp - 3846 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 39700072-39701167(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGCAGCTGTCAC
SmilChr02G005230 Chr02 NC_080388.1:73506851-73506862promoter 内 125-136 bp - 3865 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 73497171-73502986(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTAGA
SmilChr08G001744 Chr08 NC_080394.1:14666322-14666333promoter 内 77-88 bp - 3913 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 14670246-14678571(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAACTGTCAA
SmilChr04G004029 Chr04 NC_080390.1:55557365-55557376promoter 内 2943-2954 bp + 1047 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 3 55553177-55556318(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTATC
SmilChr01G004017 Chr01 NC_080387.1:58559229-58559240promoter 内 2884-2895 bp + 1106 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 3 58560346-58570392(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATCCAGCTGTT
SmilChr04G000524 Chr04 NC_080390.1:5763266-5763277promoter 内 707-718 bp + 3283 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 3 5756241-5759983(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGATT
SmilChr02G005186 Chr02 NC_080388.1:73175986-73175997promoter 内 3863-3874 bp + 127 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 73172860-73175859(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCCT
SmilChr05G001412 Chr05 NC_080391.1:12752220-12752231promoter 内 3793-3804 bp - 197 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 12752428-12753252(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTATC
SmilChr08G003293 Chr08 NC_080394.1:34037930-34037941promoter 内 3741-3752 bp - 249 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 34036899-34037681(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGTG
SmilChr05G002446 Chr05 NC_080391.1:26947243-26947254promoter 内 3459-3470 bp - 531 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 26947785-26950342(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGATT
SmilChr01G003759 Chr01 NC_080387.1:55978581-55978592promoter 内 2992-3003 bp + 998 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 55979590-55982896(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTAAA
SmilChr03G002429 Chr03 NC_080389.1:38577501-38577512promoter 内 2586-2597 bp + 1404 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 38578916-38581857(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTAAA
SmilChr02G001079 Chr02 NC_080388.1:19340959-19340970promoter 内 2327-2338 bp - 1663 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 19336612-19339296(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTAAA
SmilChr02G004635 Chr02 NC_080388.1:68821915-68821926promoter 内 2180-2191 bp + 1810 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 68818426-68820105(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGATT
SmilChr04G002029 Chr04 NC_080390.1:32997366-32997377promoter 内 1927-1938 bp + 2063 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 32992541-32995303(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAACTGTCAA
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SmilChr01G000218 Chr01 NC_080387.1:3791020-3791031promoter 内 510-521 bp - 3480 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 3794511-3799399(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGAGCTGTCCG
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SmilChr04G000525 Chr04 NC_080390.1:5763266-5763277promoter 内 218-229 bp + 3772 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 5767049-5771100(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATCCAGCTGTT
SmilChr05G000650 Chr05 NC_080391.1:4917530-4917541promoter 内 3962-3973 bp + 28 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 4917569-4917979(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTAAA
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SmilChr03G000512 Chr03 NC_080389.1:5511651-5511662promoter 内 3854-3865 bp - 136 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 5511798-5516423(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAACTGTCAA