转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 82 / 143 下载 TSV

上一页 82 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G000437 Chr06 NC_080392.1:3571961-3571972promoter 内 1488-1499 bp + 2502 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 3574474-3576521(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTAAA
SmilChr04G002997 Chr04 NC_080390.1:46369743-46369754promoter 内 1461-1472 bp - 2529 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 46372283-46373410(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCACCTGTCAA
SmilChr02G005193 Chr02 NC_080388.1:73209349-73209360promoter 内 1359-1370 bp + 2631 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 73203421-73206718(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTAGCTGTCTA
SmilChr03G001300 Chr03 NC_080389.1:15227511-15227522promoter 内 1294-1305 bp + 2696 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 15222696-15224815(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAACTGTCAA
SmilChr01G004613 Chr01 NC_080387.1:64091451-64091462promoter 内 1223-1234 bp - 2767 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 64086966-64088684(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGTT
SmilChr05G000156 Chr05 NC_080391.1:1260474-1260485promoter 内 1211-1222 bp + 2779 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 1253918-1257695(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCGC
SmilChr06G002518 Chr06 NC_080392.1:36074002-36074013promoter 内 1190-1201 bp - 2800 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 36076813-36078617(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTATC
SmilChr07G004540 Chr07 NC_080393.1:58058305-58058316promoter 内 1148-1159 bp - 2842 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 58054939-58055463(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTAGA
SmilChr06G000608 Chr06 NC_080392.1:5254800-5254811promoter 内 1122-1133 bp + 2868 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 5246819-5251932(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCACCTGTCAA
SmilChr03G001645 Chr03 NC_080389.1:21280706-21280717promoter 内 1111-1122 bp + 2879 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 21283596-21286659(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTACAGCTGAA
SmilChr01G002168 Chr01 NC_080387.1:37768066-37768077promoter 内 1027-1038 bp + 2963 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 37763587-37765103(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTAGG
SmilChr01G000656 Chr01 NC_080387.1:14622420-14622431promoter 内 981-992 bp + 3009 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 14614324-14619411(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGAGCTGTCTA
SmilChr02G002819 Chr02 NC_080388.1:48285559-48285570promoter 内 875-886 bp - 3115 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 48288685-48289447(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGAGCTGTCTA
SmilChr07G000730 Chr07 NC_080393.1:5092512-5092523promoter 内 787-798 bp + 3203 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 5083408-5089309(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTAGCTGTCTA
SmilChr02G004766 Chr02 NC_080388.1:69834817-69834828promoter 内 777-788 bp + 3213 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 69838041-69843112(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTACAGCTGAA
SmilChr05G003186 Chr05 NC_080391.1:40764963-40764974promoter 内 729-740 bp + 3261 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 40768235-40775102(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTAGA
SmilChr05G001353 Chr05 NC_080391.1:12055705-12055716promoter 内 728-739 bp + 3262 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 12047594-12052443(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTGCAC
SmilChr05G000150 Chr05 NC_080391.1:1224113-1224124promoter 内 695-706 bp + 3295 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 1220281-1220818(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCGC
SmilChr04G000998 Chr04 NC_080390.1:13823255-13823266promoter 内 637-648 bp - 3353 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 13826619-13827179(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGACT
SmilChr05G002787 Chr05 NC_080391.1:32578026-32578037promoter 内 626-637 bp + 3364 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 32568062-32574662(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCGC
SmilChr02G000949 Chr02 NC_080388.1:16498372-16498383promoter 内 573-584 bp - 3417 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 16501800-16512624(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTAGC
SmilChr05G001348 Chr05 NC_080391.1:11974492-11974503promoter 内 544-555 bp + 3446 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 11966182-11971046(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTGCAC
SmilChr03G002227 Chr03 NC_080389.1:35090627-35090638promoter 内 516-527 bp + 3474 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 35094112-35096951(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTAGA
SmilChr03G001860 Chr03 NC_080389.1:25677939-25677950promoter 内 467-478 bp - 3523 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 25681473-25688528(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGACT
SmilChr02G000738 Chr02 NC_080388.1:11959332-11959343promoter 内 357-368 bp + 3633 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 11952330-11955699(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGCAGCTGTCAA
SmilChr01G002495 Chr01 NC_080387.1:42716051-42716062promoter 内 328-339 bp - 3662 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 42711485-42712389(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGTT
SmilChr03G002814 Chr03 NC_080389.1:44601459-44601470promoter 内 257-268 bp - 3733 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 44605203-44609089(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTAGCTGTCTA
SmilChr04G003071 Chr04 NC_080390.1:47251144-47251155promoter 内 246-257 bp + 3744 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 47254899-47266853(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGCAAGCTGTA
SmilChr01G005900 Chr01 NC_080387.1:74907266-74907277promoter 内 242-253 bp - 3748 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 74901583-74903518(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTCAC
SmilChr03G001908 Chr03 NC_080389.1:26697913-26697924promoter 内 207-218 bp - 3783 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 26701707-26704144(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGACT
SmilChr07G003437 Chr07 NC_080393.1:38014413-38014424promoter 内 201-212 bp + 3789 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 38007674-38010624(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGACT
SmilChr08G001900 Chr08 NC_080394.1:16504774-16504785promoter 内 198-209 bp - 3792 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 16508577-16508650(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGACT
SmilChr01G003483 Chr01 NC_080387.1:53375586-53375597promoter 内 197-208 bp - 3793 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 53379390-53379461(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTAGC
SmilChr02G003900 Chr02 NC_080388.1:61096070-61096081promoter 内 197-208 bp + 3793 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 61099874-61102522(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGTT
SmilChr06G001213 Chr06 NC_080392.1:12435084-12435095promoter 内 175-186 bp - 3815 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 12428016-12431269(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGTCCAGCTGTG
SmilChr01G003417 Chr01 NC_080387.1:52799476-52799487promoter 内 57-68 bp - 3933 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 52803420-52803491(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTAGC
SmilChr02G003111 Chr02 NC_080388.1:52090509-52090520promoter 内 19-30 bp - 3971 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 52085105-52086538(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTAGA
SmilChr03G000016 Chr03 NC_080389.1:156413-156424promoter 内 3724-3735 bp - 266 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 3 156690-159408(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTACC
SmilChr07G000060 Chr07 NC_080393.1:275635-275646promoter 内 3890-3901 bp - 100 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 270185-275535(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGTA
SmilChr03G003429 Chr03 NC_080389.1:52629684-52629695promoter 内 3863-3874 bp - 127 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 52629822-52630371(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTATC
SmilChr05G000425 Chr05 NC_080391.1:3206475-3206486promoter 内 3860-3871 bp + 130 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 3203951-3206345(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTACC
SmilChr01G003866 Chr01 NC_080387.1:56902358-56902369promoter 内 3816-3827 bp - 174 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 56902543-56911371(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTATA
SmilChr02G004598 Chr02 NC_080388.1:68509220-68509231promoter 内 3816-3827 bp + 174 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 68500176-68509046(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTATA
SmilChr05G000488 Chr05 NC_080391.1:3813722-3813733promoter 内 3816-3827 bp - 174 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 3813907-3822764(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTATA
SmilChr05G001470 Chr05 NC_080391.1:13491000-13491011promoter 内 3816-3827 bp + 174 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 13481966-13490826(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTATA
SmilChr08G000708 Chr08 NC_080394.1:5269166-5269177promoter 内 3816-3827 bp + 174 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 5260124-5268992(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTATA
SmilChr07G001718 Chr07 NC_080393.1:14609078-14609089promoter 内 3773-3784 bp + 217 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 14600102-14608861(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTATA
SmilChr05G004362 Chr05 NC_080391.1:57169766-57169777promoter 内 3546-3557 bp + 444 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 57169190-57169322(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTATA
SmilChr08G001201 Chr08 NC_080394.1:9695766-9695777promoter 内 3536-3547 bp - 454 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 9696231-9704826(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTATA
SmilChr05G002528 Chr05 NC_080391.1:28115090-28115101promoter 内 3491-3502 bp - 499 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 28115600-28116492(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTACC