转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 82 / 136 下载 TSV

上一页 82 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G000640 Chr04 NC_080390.1:7270735-7270745promoter 内 1714-1724 bp - 2277 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 3 7273022-7275924(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGAT
SmilChr07G000261 Chr07 NC_080393.1:1680237-1680247promoter 内 678-688 bp + 3313 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 3 1675671-1676924(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGCA
SmilChr07G000263 Chr07 NC_080393.1:1680237-1680247promoter 内 508-518 bp + 3483 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 3 1683730-1710809(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGAG
SmilChr01G005767 Chr01 NC_080387.1:73754327-73754337promoter 内 2930-2940 bp - 1061 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 73755398-73759578(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGAA
SmilChr02G004278 Chr02 NC_080388.1:64975160-64975170promoter 内 2898-2908 bp - 1093 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 64976263-64976652(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCCCTGAGCC
SmilChr07G003468 Chr07 NC_080393.1:38782261-38782271promoter 内 2890-2900 bp - 1101 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 38775658-38781160(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCAGC
SmilChr01G002793 Chr01 NC_080387.1:46443776-46443786promoter 内 2723-2733 bp + 1268 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 46437765-46442508(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGAT
SmilChr01G002653 Chr01 NC_080387.1:44843822-44843832promoter 内 2636-2646 bp + 1355 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 44839835-44842467(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGCA
SmilChr01G002659 Chr01 NC_080387.1:44843822-44843832promoter 内 2202-2212 bp + 1789 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 44841936-44842033(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGCA
SmilChr04G000211 Chr04 NC_080390.1:1875488-1875498promoter 内 2114-2124 bp - 1877 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 1871736-1873611(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGAG
SmilChr01G002658 Chr01 NC_080387.1:44843822-44843832promoter 内 1852-1862 bp + 2139 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 44841605-44841683(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGCA
SmilChr08G003878 Chr08 NC_080394.1:45965974-45965984promoter 内 1787-1797 bp + 2204 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 45968188-45968784(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGAG
SmilChr01G002657 Chr01 NC_080387.1:44843822-44843832promoter 内 1669-1679 bp + 2322 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 44841411-44841500(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGCA
SmilChr03G004563 Chr03 NC_080389.1:63573499-63573509promoter 内 1550-1560 bp - 2441 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 63565992-63571058(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGGGGT
SmilChr01G002656 Chr01 NC_080387.1:44843822-44843832promoter 内 1314-1324 bp + 2677 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 44841020-44841145(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGCA
SmilChr01G002655 Chr01 NC_080387.1:44843822-44843832promoter 内 955-965 bp + 3036 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 44840703-44840786(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGCA
SmilChr03G002346 Chr03 NC_080389.1:36995172-36995182promoter 内 632-642 bp - 3359 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 36987825-36991813(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ATCTCAGCGCC
SmilChr01G004531 Chr01 NC_080387.1:63487545-63487555promoter 内 83-93 bp + 3908 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 63491463-63493123(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGAG
SmilChr01G004393 Chr01 NC_080387.1:62102207-62102217promoter 内 3836-3846 bp - 155 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 62098704-62102052(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGAC
SmilChr06G001090 Chr06 NC_080392.1:10898698-10898708promoter 内 3772-3782 bp + 219 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 10898927-10903682(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGGGTC
SmilChr06G001468 Chr06 NC_080392.1:15571562-15571572promoter 内 3765-3775 bp + 226 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 15569451-15571336(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGAT
SmilChr03G004526 Chr03 NC_080389.1:63310269-63310279promoter 内 3663-3673 bp - 328 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 63307850-63309941(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGAG
SmilChr08G001355 Chr08 NC_080394.1:10867578-10867588promoter 内 3653-3663 bp - 338 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 10867926-10870769(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGAA
SmilChr08G002126 Chr08 NC_080394.1:19135698-19135708promoter 内 3603-3613 bp + 388 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 19133340-19135310(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGAT
SmilChr02G000180 Chr02 NC_080388.1:2300251-2300261promoter 内 3562-3572 bp - 429 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 2300690-2304986(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGAA
SmilChr05G002506 Chr05 NC_080391.1:27800136-27800146promoter 内 3465-3475 bp + 526 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 27800672-27806140(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGAG
SmilChr01G003256 Chr01 NC_080387.1:51266353-51266363promoter 内 3459-3469 bp - 532 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 51262243-51265821(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGGGTC
SmilChr03G002349 Chr03 NC_080389.1:37124528-37124538promoter 内 3422-3432 bp + 569 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 37125107-37130887(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCAGC
SmilChr02G004277 Chr02 NC_080388.1:64977087-64977097promoter 内 3375-3385 bp + 616 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 64970756-64976471(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGAT
SmilChr01G005774 Chr01 NC_080387.1:73814681-73814691promoter 内 3341-3351 bp + 650 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 73815341-73819678(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGAC
SmilChr04G000189 Chr04 NC_080390.1:1686938-1686948promoter 内 3308-3318 bp + 683 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 1677559-1686255(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGACGC
SmilChr01G002330 Chr01 NC_080387.1:40455531-40455541promoter 内 3239-3249 bp + 752 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 40456293-40457039(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ATCTCAGCGCC
SmilChr06G001587 Chr06 NC_080392.1:17363972-17363982promoter 内 3223-3233 bp + 768 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 17364750-17369808(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ATCTCAGCGCC
SmilChr03G002575 Chr03 NC_080389.1:40973782-40973792promoter 内 3005-3015 bp + 986 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 40971049-40972796(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACCCTGAGCC
SmilChr01G000393 Chr01 NC_080387.1:8075275-8075285promoter 内 2997-3007 bp + 994 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 8068297-8074281(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCTGCTGAGCG
SmilChr08G001462 Chr08 NC_080394.1:11780346-11780356promoter 内 2938-2948 bp - 1053 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 11781409-11784643(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGAA
SmilChr05G004230 Chr05 NC_080391.1:56122565-56122575promoter 内 2925-2935 bp + 1066 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 56117709-56121499(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACCCTGAGCC
SmilChr03G002315 Chr03 NC_080389.1:36457196-36457206promoter 内 2856-2866 bp + 1135 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 36453037-36456061(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCTGCTGAGCG
SmilChr08G004067 Chr08 NC_080394.1:49309910-49309920promoter 内 2727-2737 bp + 1264 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 49307576-49308646(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACCCTGAGCC
SmilChr03G004055 Chr03 NC_080389.1:59501152-59501162promoter 内 2717-2727 bp + 1274 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 59494761-59499878(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACCCTGAGCC
SmilChr08G003980 Chr08 NC_080394.1:47889062-47889072promoter 内 2657-2667 bp + 1334 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 47881316-47887728(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCCCTGAGCC
SmilChr08G000588 Chr08 NC_080394.1:4370287-4370297promoter 内 2645-2655 bp + 1346 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 4371643-4374224(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ATCTCAGCGCC
SmilChr06G000165 Chr06 NC_080392.1:1149561-1149571promoter 内 2578-2588 bp + 1413 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 1146771-1148148(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCTGCTGAGCG
SmilChr01G001862 Chr01 NC_080387.1:33579099-33579109promoter 内 2521-2531 bp + 1470 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 33580579-33581364(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGAG
SmilChr07G001265 Chr07 NC_080393.1:9718050-9718060promoter 内 2490-2500 bp - 1501 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 9712119-9716549(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGAG
SmilChr05G001116 Chr05 NC_080391.1:9315701-9315711promoter 内 2479-2489 bp - 1512 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 9312383-9314189(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGAG
SmilChr02G004461 Chr02 NC_080388.1:67036197-67036207promoter 内 2445-2455 bp - 1546 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 67033231-67034651(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ATCTCAGCGCC
SmilChr05G002164 Chr05 NC_080391.1:22899650-22899660promoter 内 2440-2450 bp + 1551 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 22901211-22902727(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TTCTCAGCGCG
SmilChr08G000038 Chr08 NC_080394.1:256644-256654promoter 内 2351-2361 bp - 1640 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 258294-260146(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGAT
SmilChr07G003008 Chr07 NC_080393.1:30935684-30935694promoter 内 2315-2325 bp - 1676 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 30937370-30945104(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACCCTGAGCC