转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 83 / 143 下载 TSV

上一页 83 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G004361 Chr05 NC_080391.1:57169766-57169777promoter 内 3308-3319 bp + 682 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 57168951-57169084(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTATA
SmilChr02G000501 Chr02 NC_080388.1:6885895-6885906promoter 内 3302-3313 bp + 688 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 6883782-6885207(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTACC
SmilChr05G001867 Chr05 NC_080391.1:18807091-18807102promoter 内 3227-3238 bp + 763 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 18807865-18810753(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATACAGCTGGT
SmilChr07G003344 Chr07 NC_080393.1:35852707-35852718promoter 内 3224-3235 bp + 766 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 35838530-35851941(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTACC
SmilChr01G001121 Chr01 NC_080387.1:22833161-22833172promoter 内 3153-3164 bp + 837 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 22831740-22832324(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTAGCTGTCGG
SmilChr05G002148 Chr05 NC_080391.1:22699877-22699888promoter 内 3099-3110 bp + 891 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 22656765-22698986(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGTAT
SmilChr01G002650 Chr01 NC_080387.1:44828425-44828436promoter 内 2968-2979 bp + 1022 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 44825256-44827403(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTACC
SmilChr05G001622 Chr05 NC_080391.1:15008426-15008437promoter 内 2877-2888 bp - 1113 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 15009550-15021553(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTACC
SmilChr07G001667 Chr07 NC_080393.1:14128291-14128302promoter 内 2641-2652 bp - 1349 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 14129651-14132092(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTACC
SmilChr06G001524 Chr06 NC_080392.1:16429840-16429851promoter 内 2570-2581 bp - 1420 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 16431271-16432656(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTATA
SmilChr03G002985 Chr03 NC_080389.1:46671978-46671989promoter 内 2306-2317 bp - 1684 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 46673673-46681349(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTACC
SmilChr02G004862 Chr02 NC_080388.1:70753074-70753085promoter 内 1887-1898 bp + 2103 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 70749785-70750971(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTACC
SmilChr02G000500 Chr02 NC_080388.1:6885895-6885906promoter 内 1795-1806 bp + 2195 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 6882747-6883700(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTACC
SmilChr07G000738 Chr07 NC_080393.1:5141601-5141612promoter 内 1782-1793 bp + 2208 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 5138830-5139393(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTACC
SmilChr05G004359 Chr05 NC_080391.1:57169766-57169777promoter 内 1464-1475 bp + 2526 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 57164704-57167240(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTATA
SmilChr04G002982 Chr04 NC_080390.1:46240757-46240768promoter 内 1393-1404 bp + 2597 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 46243365-46254252(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATACAGCTGGT
SmilChr01G002445 Chr01 NC_080387.1:42038400-42038411promoter 内 1345-1356 bp - 2645 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 42041056-42044875(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTACC
SmilChr01G002651 Chr01 NC_080387.1:44828427-44828438promoter 内 1299-1310 bp - 2691 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 44831129-44832049(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTACC
SmilChr02G001221 Chr02 NC_080388.1:22410534-22410545promoter 内 1176-1187 bp - 2814 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 22404995-22407720(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATACAGCTGTA
SmilChr01G000844 Chr01 NC_080387.1:18277452-18277463promoter 内 1146-1157 bp - 2844 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 18280307-18281844(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTACC
SmilChr05G001156 Chr05 NC_080391.1:9689244-9689255promoter 内 1034-1045 bp - 2956 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 9692211-9693771(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTATA
SmilChr04G000917 Chr04 NC_080390.1:11926646-11926657promoter 内 988-999 bp + 3002 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 11921453-11923644(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATAGCTGTCTA
SmilChr01G004520 Chr01 NC_080387.1:63313935-63313946promoter 内 963-974 bp + 3027 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 63316973-63324098(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGTCCAGCTGTT
SmilChr01G005018 Chr01 NC_080387.1:68169031-68169042promoter 内 778-789 bp - 3212 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 68172254-68178732(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTACC
SmilChr04G004137 Chr04 NC_080390.1:56176646-56176657promoter 内 680-691 bp + 3310 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 56171864-56173336(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTACC
SmilChr06G002776 Chr06 NC_080392.1:40453401-40453412promoter 内 605-616 bp + 3385 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 40448748-40450016(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTACC
SmilChr04G001931 Chr04 NC_080390.1:31406278-31406289promoter 内 310-321 bp - 3680 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 31409969-31411453(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTATA
SmilChr07G004145 Chr07 NC_080393.1:53272289-53272300promoter 内 137-148 bp - 3853 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 53276153-53277583(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTACC
SmilChr02G004010 Chr02 NC_080388.1:62418865-62418876promoter 内 49-60 bp - 3941 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 62422817-62427184(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTACC
SmilChr04G004140 Chr04 NC_080390.1:56176648-56176659promoter 内 7-18 bp - 3983 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 56180642-56181443(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTACC
SmilChr07G001555 Chr07 NC_080393.1:12673747-12673758promoter 内 3982-3993 bp + 8 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 12673766-12679083(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGGTGTA
SmilChr08G003420 Chr08 NC_080394.1:36414707-36414718promoter 内 3982-3993 bp - 8 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 36414726-36435775(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACACCTGTCAA
SmilChr06G001224 Chr06 NC_080392.1:12653852-12653863promoter 内 3701-3712 bp + 289 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 12645990-12653563(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACACCTGTCAA
SmilChr07G002710 Chr07 NC_080393.1:26531922-26531933promoter 内 3552-3563 bp - 438 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 26532371-26538924(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATAGCTGTCTA
SmilChr04G002296 Chr04 NC_080390.1:37219471-37219482promoter 内 3520-3531 bp - 470 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 37219952-37224381(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGCAGCTGTCAT
SmilChr03G004204 Chr03 NC_080389.1:60650436-60650447promoter 内 3116-3127 bp + 874 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 60643505-60649562(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATAGCTGTCTA
SmilChr05G003518 Chr05 NC_080391.1:46984932-46984943promoter 内 2907-2918 bp - 1083 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 46986026-46987370(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTAGCTGTCTT
SmilChr08G003446 Chr08 NC_080394.1:36874152-36874163promoter 内 2831-2842 bp - 1159 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 36875322-36875481(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGCAGCTGTCAT
SmilChr02G001828 Chr02 NC_080388.1:33298587-33298598promoter 内 2763-2774 bp + 1227 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 33299825-33301518(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGCC
SmilChr04G004182 Chr04 NC_080390.1:56397303-56397314promoter 内 2696-2707 bp - 1294 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 56394557-56396009(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTATA
SmilChr04G000762 Chr04 NC_080390.1:9301546-9301557promoter 内 2549-2560 bp - 1441 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 9302998-9308636(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATAGCTGTCTA
SmilChr06G003159 Chr06 NC_080392.1:44562823-44562834promoter 内 2476-2487 bp + 1514 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 44560251-44561309(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTAGCTGTCGG
SmilChr04G003098 Chr04 NC_080390.1:47577027-47577038promoter 内 2454-2465 bp - 1536 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 47578574-47579306(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTAGCTGTCTT
SmilChr02G004637 Chr02 NC_080388.1:68832847-68832858promoter 内 2195-2206 bp + 1795 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 68830047-68831052(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACACCTGTCAA
SmilChr04G000921 Chr04 NC_080390.1:12014459-12014470promoter 内 2182-2193 bp - 1808 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 12009710-12012651(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTATA
SmilChr07G001412 Chr07 NC_080393.1:11006013-11006024promoter 内 1793-1804 bp - 2197 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 11002449-11003816(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTAGA
SmilChr08G001120 Chr08 NC_080394.1:8714650-8714661promoter 内 1792-1803 bp + 2198 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 8716859-8716993(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTATA
SmilChr03G001642 Chr03 NC_080389.1:21232524-21232535promoter 内 1375-1386 bp + 2615 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 21235150-21239301(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGGTGTA
SmilChr01G000217 Chr01 NC_080387.1:3796219-3796230promoter 内 1348-1359 bp + 2642 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 3792740-3793577(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACACCTGTCAA
SmilChr06G000602 Chr06 NC_080392.1:5212570-5212581promoter 内 1189-1200 bp + 2801 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 5208694-5209769(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATAGCTGTCTC