转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G001094; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00021820-RA_Salv SmilChr04G001094 WRKY XP_057804404.1 MP00408 AGCGTTGACTTTT

可能结合的靶基因

9902 个结合位点 8149 个候选靶基因 第 83 / 163 下载 TSV

上一页 83 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G006134 Chr01 NC_080387.1:76854343-76854355promoter 内 1876-1888 bp + 2113 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 76856468-76859505(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGTGTTGACTTGT
SmilChr08G000224 Chr08 NC_080394.1:1509144-1509156promoter 内 1867-1879 bp + 2122 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 1511278-1516515(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ATTGTTGACTTTC
SmilChr02G005581 Chr02 NC_080388.1:75645024-75645036promoter 内 1839-1851 bp + 2150 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 75637200-75642874(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ATAAGTCAACAGT
SmilChr03G003259 Chr03 NC_080389.1:50491144-50491156promoter 内 1769-1781 bp - 2220 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 50493376-50494987(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GATGGTCAACGAT
SmilChr06G001966 Chr06 NC_080392.1:24757099-24757111promoter 内 1723-1735 bp - 2266 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 24752610-24754833(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ATAGTTGACTTAT
SmilChr01G003600 Chr01 NC_080387.1:54561624-54561636promoter 内 1714-1726 bp + 2275 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 54563911-54565456(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GGGGTTGACTATA
SmilChr08G000329 Chr08 NC_080394.1:2306335-2306347promoter 内 1632-1644 bp - 2357 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 2302467-2303978(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ATAGTTGACTTAT
SmilChr03G001956 Chr03 NC_080389.1:27964952-27964964promoter 内 1627-1639 bp + 2362 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 27967326-27967778(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GTCGTTGACGTTG
SmilChr04G001732 Chr04 NC_080390.1:28563454-28563466promoter 内 1509-1521 bp - 2480 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 28558171-28560974(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AAAGTTGACTTAT
SmilChr02G001810 Chr02 NC_080388.1:32923457-32923469promoter 内 1485-1497 bp - 2504 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 32919823-32920953(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ATAGTTGACTTAT
SmilChr03G002124 Chr03 NC_080389.1:33022936-33022948promoter 内 1466-1478 bp + 2523 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 33019287-33020413(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AACAGTCAACTGC
SmilChr03G003218 Chr03 NC_080389.1:49821207-49821219promoter 内 1465-1477 bp + 2524 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 49814543-49818683(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CAAAGTCAATGAC
SmilChr05G002032 Chr05 NC_080391.1:21125544-21125556promoter 内 1459-1471 bp - 2530 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 21128086-21129444(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AACAGTCAACTGC
SmilChr06G001541 Chr06 NC_080392.1:16686485-16686497promoter 内 1413-1425 bp - 2576 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 16689073-16696046(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CATAGTCAACCCA
SmilChr04G003783 Chr04 NC_080390.1:53995832-53995844promoter 内 1408-1420 bp - 2581 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 53998425-53999929(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AAGGGTCAACGTA
SmilChr04G000019 Chr04 NC_080390.1:243313-243325promoter 内 1356-1368 bp - 2633 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 239940-240680(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TAGGTTGACTTTA
SmilChr02G000859 Chr02 NC_080388.1:14758972-14758984promoter 内 1333-1345 bp + 2656 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 14755255-14756316(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CAAAGTCAATGAC
SmilChr01G004002 Chr01 NC_080387.1:58409891-58409903promoter 内 1282-1294 bp + 2707 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 58412610-58415919(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TACGTTGACCTCC
SmilChr07G001134 Chr07 NC_080393.1:8522333-8522345promoter 内 1240-1252 bp + 2749 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 8518343-8519584(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ATAAGTCAACTTT
SmilChr08G000815 Chr08 NC_080394.1:6011305-6011317promoter 内 1228-1240 bp + 2761 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 5998961-6008544(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CCAAGTCAACCTC
SmilChr07G003567 Chr07 NC_080393.1:41668946-41668958promoter 内 1159-1171 bp + 2830 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 41664136-41666116(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TAAAGTCAACATC
SmilChr01G005269 Chr01 NC_080387.1:70124882-70124894promoter 内 1097-1109 bp + 2892 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 70127786-70128712(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CCCGTTGACCGTG
SmilChr05G002391 Chr05 NC_080391.1:26421987-26421999promoter 内 1050-1062 bp + 2939 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 26417710-26419048(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CAAAGTCAATGAC
SmilChr06G003185 Chr06 NC_080392.1:44749202-44749214promoter 内 1047-1059 bp + 2942 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 44752156-44753533(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AAAGTTGACTTAT
SmilChr01G005288 Chr01 NC_080387.1:70219729-70219741promoter 内 1031-1043 bp + 2958 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 70222699-70224075(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CCCGTTGACCGTG
SmilChr03G001018 Chr03 NC_080389.1:11708038-11708050promoter 内 1001-1013 bp - 2988 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 11711038-11712571(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AACAGTCAACTGC
SmilChr08G000592 Chr08 NC_080394.1:4406948-4406960promoter 内 948-960 bp + 3041 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 4410001-4410837(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGTGTTGACTTGT
SmilChr04G000198 Chr04 NC_080390.1:1779936-1779948promoter 内 894-906 bp + 3095 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 1773695-1776841(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CCAAGTCAACCTC
SmilChr07G000023 Chr07 NC_080393.1:103116-103128promoter 内 883-895 bp - 3106 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 106234-108520(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CCAAGTCAACCTC
SmilChr03G001204 Chr03 NC_080389.1:13875252-13875264promoter 内 863-875 bp + 3126 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 13878390-13879761(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGAGTTGACTTCA
SmilChr03G001317 Chr03 NC_080389.1:15454018-15454030promoter 内 787-799 bp - 3202 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 15449509-15450816(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGAGTTGACTTCA
SmilChr07G002140 Chr07 NC_080393.1:19559663-19559675promoter 内 637-649 bp + 3352 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 19563027-19567920(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ACCGTTGACGTTC
SmilChr05G002393 Chr05 NC_080391.1:26421987-26421999promoter 内 617-629 bp + 3372 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 26425371-26428150(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GTCATTGACTTTG
SmilChr06G002798 Chr06 NC_080392.1:40683854-40683866promoter 内 565-577 bp - 3424 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 40679069-40680430(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ATCGTTGACCATC
SmilChr03G003382 Chr03 NC_080389.1:52189357-52189369promoter 内 549-561 bp + 3440 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 52175671-52185917(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TGAAGTCAACTCT
SmilChr03G000546 Chr03 NC_080389.1:5925547-5925559promoter 内 517-529 bp - 3472 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 5920385-5922075(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGAGTTGACTTCA
SmilChr08G000480 Chr08 NC_080394.1:3446261-3446273promoter 内 468-480 bp - 3521 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 3439265-3442740(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GTCGTTGACTCAC
SmilChr08G001047 Chr08 NC_080394.1:7993757-7993769promoter 内 459-471 bp - 3530 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 7988485-7990227(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GTAGTTGACTATG
SmilChr07G003294 Chr07 NC_080393.1:34734750-34734762promoter 内 428-440 bp - 3561 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 34729240-34731189(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TTCGTTGACTCCT
SmilChr01G001318 Chr01 NC_080387.1:26220011-26220023promoter 内 370-382 bp + 3619 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 26215736-26216392(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 GAAAGTCAATGGT
SmilChr03G004201 Chr03 NC_080389.1:60632456-60632468promoter 内 336-348 bp + 3653 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 60636121-60638293(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 AGAGTTGACTTCA
SmilChr02G004491 Chr02 NC_080388.1:67411446-67411458promoter 内 334-346 bp - 3655 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 67405402-67407791(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ACGGTTGACTTGC
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SmilChr06G000073 Chr06 NC_080392.1:554731-554743promoter 内 301-313 bp - 3688 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 558431-560792(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TAAAGTCAACATC
SmilChr08G001169 Chr08 NC_080394.1:9370304-9370316promoter 内 287-299 bp + 3702 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 9365740-9366602(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 CCAAGTCAACCAC
SmilChr01G001908 Chr01 NC_080387.1:34166841-34166853promoter 内 267-279 bp + 3722 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 34170575-34171755(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TAGGTTGACTTTA
SmilChr08G001764 Chr08 NC_080394.1:14857382-14857394promoter 内 260-272 bp - 3729 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 14852364-14853653(-) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TCCGTTGACTGAT
SmilChr08G001770 Chr08 NC_080394.1:14903871-14903883promoter 内 250-262 bp - 3739 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 14907622-14913604(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ATAAGTCAACTTT
SmilChr01G001865 Chr01 NC_080387.1:33593813-33593825promoter 内 245-257 bp + 3744 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 33597569-33598788(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 TAGGTTGACTTTA
SmilChr03G003616 Chr03 NC_080389.1:54828141-54828153promoter 内 231-243 bp + 3758 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 54831911-54833182(+) SMil_00021820-RA_Salv MP00408 ATTGTTGACTTTC