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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G003955; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00019539-RA_Salv SmilChr04G003955 ERF XP_057805828.1 MP00120 GATATTGTCGGTGGT

可能结合的靶基因

7514 个结合位点 6144 个候选靶基因 第 83 / 123 下载 TSV

上一页 83 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr07G001547 Chr07 NC_080393.1:12569099-12569113promoter 内 3918-3932 bp + 69 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 12569182-12580651(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACACGCGTCGGTGAT
SmilChr07G001510 Chr07 NC_080393.1:12041686-12041700promoter 内 3905-3919 bp + 82 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 12041782-12053528(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACACGCGTCGGTGAT
SmilChr07G000763 Chr07 NC_080393.1:5359517-5359531promoter 内 3845-3859 bp - 142 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 5358569-5359375(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GATGCAGTCGGTGGT
SmilChr02G005341 Chr02 NC_080388.1:74248141-74248155promoter 内 3722-3736 bp + 265 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 74248420-74250670(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TTTTTTGGCGGTGGT
SmilChr01G000505 Chr01 NC_080387.1:10224835-10224849promoter 内 3716-3730 bp - 271 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 10222400-10224564(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ATCGGCGGCGGTGGT
SmilChr05G004384 Chr05 NC_080391.1:57322359-57322373promoter 内 3662-3676 bp + 325 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 57322698-57323172(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GAAATAGTCGGTGGA
SmilChr03G003061 Chr03 NC_080389.1:47557674-47557688promoter 内 3603-3617 bp + 384 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 47558072-47559707(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCTGCGGCGGTGGT
SmilChr05G001831 Chr05 NC_080391.1:18361918-18361932promoter 内 3599-3613 bp + 388 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 18360529-18361530(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCAACCGACACTAGC
SmilChr08G004257 Chr08 NC_080394.1:52070444-52070458promoter 内 3567-3581 bp + 420 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 52057989-52070024(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGCCGCACCT
SmilChr06G000404 Chr06 NC_080392.1:3282419-3282433promoter 内 3566-3580 bp + 421 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 3281130-3281998(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GACACCGACAGAATT
SmilChr01G005429 Chr01 NC_080387.1:71458195-71458209promoter 内 3544-3558 bp + 443 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 71458652-71461641(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 AAGAGCGTCGGTGAG
SmilChr01G000848 Chr01 NC_080387.1:18322921-18322935promoter 内 3539-3553 bp - 448 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 18321602-18322473(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCAAATGTCGGTGTG
SmilChr07G003098 Chr07 NC_080393.1:32764447-32764461promoter 内 3496-3510 bp + 491 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 32764952-32766118(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GTCGCGGTCGGTGGA
SmilChr03G002873 Chr03 NC_080389.1:45407683-45407697promoter 内 3442-3456 bp + 545 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 45395002-45407138(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGCCGCCTGG
SmilChr03G003915 Chr03 NC_080389.1:58247427-58247441promoter 内 3382-3396 bp - 605 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 58248046-58251686(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GGCGCCGACAATTTT
SmilChr07G000423 Chr07 NC_080393.1:2951943-2951957promoter 内 3380-3394 bp - 607 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 2949953-2951336(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TGGTGAGTCGGTGGC
SmilChr07G000424 Chr07 NC_080393.1:2956095-2956109promoter 内 3375-3389 bp - 612 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 2954125-2955483(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TGGTGAGTCGGTGGC
SmilChr02G000231 Chr02 NC_080388.1:2988986-2989000promoter 内 3295-3309 bp - 692 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 2987045-2988294(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCTTGTGTCGGTTGC
SmilChr04G001434 Chr04 NC_080390.1:23397261-23397275promoter 内 3291-3305 bp + 696 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 23386135-23396565(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GGCACCGACGGAATG
SmilChr02G005340 Chr02 NC_080388.1:74248141-74248155promoter 内 3275-3289 bp + 712 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 74243664-74247429(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGCCAAAAAA
SmilChr07G001785 Chr07 NC_080393.1:15198500-15198514promoter 内 3250-3264 bp - 737 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 15179214-15197763(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TGGGGGGTCGGTGGT
SmilChr01G002485 Chr01 NC_080387.1:42570126-42570140promoter 内 3226-3240 bp + 761 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 42570901-42575733(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 AATGGCGGCGGTGGT
SmilChr07G000378 Chr07 NC_080393.1:2556869-2556883promoter 内 3216-3230 bp + 771 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 2557654-2560703(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CTTTTTGACGGTGGT
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SmilChr08G002081 Chr08 NC_080394.1:18703435-18703449promoter 内 2981-2995 bp + 1006 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 18704455-18708320(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CTCTCCGTCGGTGCC
SmilChr07G001509 Chr07 NC_080393.1:12041686-12041700promoter 内 2976-2990 bp + 1011 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 12038522-12040675(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ATCACCGACGCGTGT
SmilChr03G003340 Chr03 NC_080389.1:51695835-51695849promoter 内 2971-2985 bp + 1016 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 51690180-51694819(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GTCACCGACCGCACC
SmilChr01G001748 Chr01 NC_080387.1:32220350-32220364promoter 内 2950-2964 bp + 1037 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 32221401-32235748(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GTGTCCGTCGGTGAA
SmilChr05G001807 Chr05 NC_080391.1:17857126-17857140promoter 内 2949-2963 bp + 1038 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 17858178-17861196(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 AATGGCGGCGGTGGT
SmilChr02G005436 Chr02 NC_080388.1:74768709-74768723promoter 内 2941-2955 bp - 1046 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 74769769-74777238(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGCCATTGTT
SmilChr02G000651 Chr02 NC_080388.1:9843584-9843598promoter 内 2904-2918 bp - 1083 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 9842430-9842501(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCCTGAGTCGGTGAC
SmilChr03G003612 Chr03 NC_080389.1:54780500-54780514promoter 内 2830-2844 bp + 1157 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 54777917-54779343(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCTACCGACAGTGGC
SmilChr03G001022 Chr03 NC_080389.1:11851336-11851350promoter 内 2827-2841 bp - 1160 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 11852510-11854008(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGCCGTCGGC
SmilChr08G001890 Chr08 NC_080394.1:16401235-16401249promoter 内 2820-2834 bp + 1167 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 16396906-16400068(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGCCGCCATT
SmilChr05G002537 Chr05 NC_080391.1:28317861-28317875promoter 内 2747-2761 bp + 1240 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 28319115-28319843(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TGAAATGTCGGTGTC
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SmilChr01G001551 Chr01 NC_080387.1:29495782-29495796promoter 内 2690-2704 bp - 1297 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 29497093-29500181(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGTCATCCCT
SmilChr02G000650 Chr02 NC_080388.1:9843584-9843598promoter 内 2636-2650 bp - 1351 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 9840881-9842233(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCCTGAGTCGGTGAC
SmilChr01G001524 Chr01 NC_080387.1:29202049-29202063promoter 内 2610-2624 bp - 1377 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 29203440-29206343(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGTCATCCCT
SmilChr03G004286 Chr03 NC_080389.1:61272608-61272622promoter 内 2599-2613 bp + 1388 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 61274010-61275939(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GATTTAGTCGGTGGA
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SmilChr03G003918 Chr03 NC_080389.1:58257006-58257020promoter 内 2515-2529 bp + 1472 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 58258492-58262037(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ATAGTCGTCGGTGCT
SmilChr01G004091 Chr01 NC_080387.1:59348987-59349001promoter 内 2489-2503 bp - 1498 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 59350499-59351367(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ATCACCGACGGCTTT
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SmilChr01G003003 Chr01 NC_080387.1:49026053-49026067promoter 内 2206-2220 bp - 1781 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 49021629-49024272(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GTGTGCGTCGGTGTC