转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 85 / 143 下载 TSV

上一页 85 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G001701 Chr05 NC_080391.1:16214991-16215002promoter 内 3489-3500 bp + 501 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 16213345-16214490(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGAGCTGTCCA
SmilChr08G001513 Chr08 NC_080394.1:12288483-12288494promoter 内 3489-3500 bp - 501 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 12288995-12290488(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGAGCTGTCCA
SmilChr04G001345 Chr04 NC_080390.1:21814846-21814857promoter 内 3456-3467 bp - 534 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 21811613-21814312(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGG
SmilChr02G003850 Chr02 NC_080388.1:60261536-60261547promoter 内 3426-3437 bp - 564 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 60258727-60260972(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGG
SmilChr07G004320 Chr07 NC_080393.1:55754829-55754840promoter 内 3413-3424 bp - 577 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 55755417-55758736(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGAGCTGTCCA
SmilChr01G003771 Chr01 NC_080387.1:56080020-56080031promoter 内 3370-3381 bp - 620 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 56076342-56079400(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTACAGCTGAG
SmilChr01G001081 Chr01 NC_080387.1:22234637-22234648promoter 内 3360-3371 bp + 630 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 22235278-22236773(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTACAGCTGAA
SmilChr08G001079 Chr08 NC_080394.1:8308061-8308072promoter 内 3356-3367 bp + 634 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 8306469-8307427(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGAGCTGTCCA
SmilChr08G001678 Chr08 NC_080394.1:14013472-14013483promoter 内 3355-3366 bp - 635 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 14012039-14012837(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTACAGCTGAA
SmilChr06G002403 Chr06 NC_080392.1:34813876-34813887promoter 内 3344-3355 bp - 646 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 34804983-34813230(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTACAGCTGAA
SmilChr08G003431 Chr08 NC_080394.1:36589301-36589312promoter 内 3339-3350 bp + 651 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 36589963-36591637(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTACAGCTGAA
SmilChr03G000106 Chr03 NC_080389.1:1181968-1181979promoter 内 3337-3348 bp - 653 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 1179413-1181315(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGCAAGCTGTA
SmilChr05G003303 Chr05 NC_080391.1:43244857-43244868promoter 内 3305-3316 bp + 685 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 43245553-43250009(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTACAGCTGAA
SmilChr03G000957 Chr03 NC_080389.1:10809378-10809389promoter 内 3272-3283 bp + 718 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 10810107-10812420(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTATA
SmilChr01G006149 Chr01 NC_080387.1:76959069-76959080promoter 内 3157-3168 bp + 833 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 76959913-76962545(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTATA
SmilChr01G002874 Chr01 NC_080387.1:47336222-47336233promoter 内 3150-3161 bp - 840 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 47334007-47335382(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGG
SmilChr03G003645 Chr03 NC_080389.1:55126399-55126410promoter 内 3116-3127 bp - 874 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 55124810-55125525(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGG
SmilChr03G000602 Chr03 NC_080389.1:6677707-6677718promoter 内 3112-3123 bp + 878 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 6678596-6681405(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTATA
SmilChr02G003925 Chr02 NC_080388.1:61328653-61328664promoter 内 3088-3099 bp + 902 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 61329566-61330255(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGG
SmilChr03G000702 Chr03 NC_080389.1:7839306-7839317promoter 内 3076-3087 bp - 914 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 7840231-7841332(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGAGCTGTCCA
SmilChr03G004739 Chr03 NC_080389.1:64526696-64526707promoter 内 3036-3047 bp - 954 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 64527661-64529468(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCGA
SmilChr07G001360 Chr07 NC_080393.1:10539071-10539082promoter 内 3027-3038 bp - 963 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 10540045-10540990(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGAGCTGTCCA
SmilChr01G005188 Chr01 NC_080387.1:69588195-69588206promoter 内 2994-3005 bp - 996 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 69589202-69590147(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGAGCTGTCCA
SmilChr02G003510 Chr02 NC_080388.1:56305508-56305519promoter 内 2986-2997 bp + 1004 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 56306523-56307767(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGG
SmilChr06G001250 Chr06 NC_080392.1:13002016-13002027promoter 内 2979-2990 bp - 1011 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 12999972-13001005(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGG
SmilChr02G005085 Chr02 NC_080388.1:72477018-72477029promoter 内 2956-2967 bp - 1034 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 72474431-72475984(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGG
SmilChr05G003302 Chr05 NC_080391.1:43244857-43244868promoter 内 2946-2957 bp + 1044 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 43240501-43243813(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTAGA
SmilChr03G000528 Chr03 NC_080389.1:5654328-5654339promoter 内 2945-2956 bp - 1045 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 5651875-5653283(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTATA
SmilChr01G000598 Chr01 NC_080387.1:13033159-13033170promoter 内 2934-2945 bp + 1056 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 13034226-13037184(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGG
SmilChr02G003732 Chr02 NC_080388.1:58964052-58964063promoter 内 2929-2940 bp - 1061 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 58960737-58962991(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTACAGCTGTT
SmilChr07G000123 Chr07 NC_080393.1:707936-707947promoter 内 2929-2940 bp + 1061 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 704005-706875(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATAGCTGTCTT
SmilChr04G002065 Chr04 NC_080390.1:33378637-33378648promoter 内 2918-2929 bp - 1072 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 33375366-33377565(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTACAGCTGAA
SmilChr01G001302 Chr01 NC_080387.1:25934639-25934650promoter 内 2916-2927 bp + 1074 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 25929596-25933565(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGAGCTGTCCA
SmilChr01G000846 Chr01 NC_080387.1:18314906-18314917promoter 内 2902-2913 bp + 1088 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 18312378-18313818(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTGCAA
SmilChr08G002841 Chr08 NC_080394.1:28277229-28277240promoter 内 2850-2861 bp - 1140 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 28274361-28276089(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGG
SmilChr04G000024 Chr04 NC_080390.1:262889-262900promoter 内 2842-2853 bp - 1148 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 264048-264836(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGTAA
SmilChr03G003337 Chr03 NC_080389.1:51632568-51632579promoter 内 2830-2841 bp + 1160 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 51633739-51639024(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTATT
SmilChr05G002870 Chr05 NC_080391.1:34395127-34395138promoter 内 2767-2778 bp - 1223 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 34392959-34393904(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGG
SmilChr04G001231 Chr04 NC_080390.1:19345809-19345820promoter 内 2731-2742 bp + 1259 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 19347079-19348048(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGG
SmilChr01G000797 Chr01 NC_080387.1:17238304-17238315promoter 内 2718-2729 bp + 1272 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 17235549-17237032(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATAGCTGTCCA
SmilChr03G003919 Chr03 NC_080389.1:58287495-58287506promoter 内 2711-2722 bp + 1279 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 58283199-58286216(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATAGCTGTCCA
SmilChr05G000540 Chr05 NC_080391.1:4141048-4141059promoter 内 2691-2702 bp - 1299 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 4135896-4139749(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTACAGCTGAA
SmilChr06G002949 Chr06 NC_080392.1:42300574-42300585promoter 内 2680-2691 bp + 1310 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 42301895-42304012(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGG
SmilChr07G002102 Chr07 NC_080393.1:19123999-19124010promoter 内 2666-2677 bp + 1324 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 19122067-19122675(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGAGCTGTCCA
SmilChr01G004219 Chr01 NC_080387.1:60579622-60579633promoter 内 2647-2658 bp - 1343 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 60576167-60578279(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTAAA
SmilChr05G003760 Chr05 NC_080391.1:50830195-50830206promoter 内 2631-2642 bp - 1359 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 50827640-50828836(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGGG
SmilChr01G002278 Chr01 NC_080387.1:39546551-39546562promoter 内 2628-2639 bp - 1362 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 39547924-39548787(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGAGCTGTCCA
SmilChr04G001854 Chr04 NC_080390.1:30183211-30183222promoter 内 2524-2535 bp + 1466 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 30184688-30186658(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTAGG
SmilChr05G001714 Chr05 NC_080391.1:16404698-16404709promoter 内 2500-2511 bp + 1490 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 16406199-16408144(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTCAC
SmilChr05G003962 Chr05 NC_080391.1:53358728-53358739promoter 内 2438-2449 bp - 1552 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 53360291-53363977(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATAGCTGTCCA