转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000741; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00002054-RA_Salv SmilChr05G000741 ARF XP_057764423.1 MP00021 TTGTCGGAAA

可能结合的靶基因

9812 个结合位点 7629 个候选靶基因 第 86 / 153 下载 TSV

上一页 86 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G002503 Chr03 NC_080389.1:39872802-39872811promoter 内 2481-2490 bp + 1511 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 39865434-39871291(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 GAGCCGACAA
SmilChr01G001183 Chr01 NC_080387.1:23897334-23897343promoter 内 2455-2464 bp - 1537 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 23890170-23895797(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TGGTCGGAAA
SmilChr02G001462 Chr02 NC_080388.1:27321194-27321203promoter 内 2450-2459 bp - 1542 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 27322745-27323768(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTTCCGACAT
SmilChr03G004611 Chr03 NC_080389.1:63840388-63840397promoter 内 2442-2451 bp + 1550 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 63836493-63838838(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TACCCGACAA
SmilChr01G000085 Chr01 NC_080387.1:1596515-1596524promoter 内 2429-2438 bp - 1563 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 1598087-1599924(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TACCCGACAA
SmilChr05G002300 Chr05 NC_080391.1:24824205-24824214promoter 内 2429-2438 bp - 1563 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 24821819-24822642(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 ATGTCGGAAA
SmilChr03G002699 Chr03 NC_080389.1:42965994-42966003promoter 内 2421-2430 bp - 1571 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 42956058-42964423(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TGGTCGGAAA
SmilChr03G000352 Chr03 NC_080389.1:3948296-3948305promoter 内 2419-2428 bp - 1573 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 3943991-3946723(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGCTC
SmilChr01G000726 Chr01 NC_080387.1:16180145-16180154promoter 内 2407-2416 bp - 1585 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 16175692-16178560(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGCTC
SmilChr01G001997 Chr01 NC_080387.1:35431495-35431504promoter 内 2390-2399 bp + 1602 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 35433106-35441187(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TGGTCGGAAA
SmilChr05G001872 Chr05 NC_080391.1:18897459-18897468promoter 内 2381-2390 bp + 1611 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 18891763-18895848(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 GAGCCGACAA
SmilChr03G002421 Chr03 NC_080389.1:38434620-38434629promoter 内 2367-2376 bp + 1625 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 38436254-38437540(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 ATGTCGGAAA
SmilChr01G001685 Chr01 NC_080387.1:31083320-31083329promoter 内 2360-2369 bp - 1632 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 31080667-31081688(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TGGTCGGAAA
SmilChr03G001029 Chr03 NC_080389.1:12011375-12011384promoter 内 2353-2362 bp - 1639 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 12008590-12009736(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGTA
SmilChr03G000073 Chr03 NC_080389.1:913870-913879promoter 内 2338-2347 bp - 1654 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 911287-912216(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TGGTCGGAAA
SmilChr03G001496 Chr03 NC_080389.1:18255441-18255450promoter 内 2330-2339 bp + 1662 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 18253381-18253779(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTTCCGACAT
SmilChr01G000003 Chr01 NC_080387.1:81995-82004promoter 内 2326-2335 bp - 1666 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 77269-80329(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TGGTCGGAAA
SmilChr02G005487 Chr02 NC_080388.1:75063970-75063979promoter 内 2322-2331 bp - 1670 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 75058151-75062300(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TGGTCGGAAA
SmilChr03G000883 Chr03 NC_080389.1:10025441-10025450promoter 内 2313-2322 bp - 1679 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 10022162-10023762(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 ATGTCGGAAA
SmilChr01G000126 Chr01 NC_080387.1:2134321-2134330promoter 内 2304-2313 bp + 1688 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 2136018-2139017(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TGGTCGGAAA
SmilChr05G000489 Chr05 NC_080391.1:3828103-3828112promoter 内 2303-2312 bp - 1689 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 3823468-3826414(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 ATGTCGGAAA
SmilChr01G005965 Chr01 NC_080387.1:75369890-75369899promoter 内 2301-2310 bp - 1691 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 75371590-75371663(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTTCCGACCA
SmilChr02G002209 Chr02 NC_080388.1:39344027-39344036promoter 内 2300-2309 bp + 1692 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 39345728-39349214(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TGGTCGGAAA
SmilChr04G002127 Chr04 NC_080390.1:34266943-34266952promoter 内 2297-2306 bp - 1695 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 34263665-34265248(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TGGTCGGAAA
SmilChr04G001619 Chr04 NC_080390.1:26955299-26955308promoter 内 2275-2284 bp + 1717 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 26957025-26960456(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TGGTCGGAAA
SmilChr03G004154 Chr03 NC_080389.1:60337501-60337510promoter 内 2272-2281 bp + 1720 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 60330852-60335781(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTTCCGACAT
SmilChr03G000005 Chr03 NC_080389.1:84545-84554promoter 内 2261-2270 bp - 1731 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 78540-82814(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TGGTCGGAAA
SmilChr03G003265 Chr03 NC_080389.1:50587657-50587666promoter 内 2235-2244 bp - 1757 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 50589423-50590130(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TACCCGACAA
SmilChr05G001265 Chr05 NC_080391.1:10785681-10785690promoter 内 2226-2235 bp + 1766 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 10780478-10783915(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTTCCGACCA
SmilChr04G002488 Chr04 NC_080390.1:39740898-39740907promoter 内 2204-2213 bp - 1788 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 39742695-39744325(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTTCCGACAT
SmilChr04G001153 Chr04 NC_080390.1:17003903-17003912promoter 内 2170-2179 bp + 1822 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 17005734-17013027(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGTA
SmilChr02G003588 Chr02 NC_080388.1:57085152-57085161promoter 内 2157-2166 bp + 1835 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 57086996-57088465(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGTA
SmilChr03G002752 Chr03 NC_080389.1:43748516-43748525promoter 内 2148-2157 bp + 1844 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 43741341-43746672(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTTCCGACAT
SmilChr03G001663 Chr03 NC_080389.1:21567697-21567706promoter 内 2142-2151 bp - 1850 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 21564855-21565847(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGCTC
SmilChr05G002053 Chr05 NC_080391.1:21402417-21402426promoter 内 2118-2127 bp - 1874 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 21397016-21400543(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TGGTCGGAAA
SmilChr01G003127 Chr01 NC_080387.1:50098933-50098942promoter 内 2098-2107 bp - 1894 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 50092005-50097039(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 ATGTCGGAAA
SmilChr04G001617 Chr04 NC_080390.1:26955299-26955308promoter 内 2095-2104 bp + 1897 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 26953201-26953402(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTTCCGACCA
SmilChr04G003317 Chr04 NC_080390.1:49903336-49903345promoter 内 2074-2083 bp + 1918 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 49905263-49911202(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGCTC
SmilChr02G004296 Chr02 NC_080388.1:65314926-65314935promoter 内 2069-2078 bp + 1923 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 65316858-65319136(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGTA
SmilChr05G000236 Chr05 NC_080391.1:1818025-1818034promoter 内 2069-2078 bp - 1923 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 1819957-1825488(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTTCCGACAT
SmilChr02G000602 Chr02 NC_080388.1:8760289-8760298promoter 内 2058-2067 bp + 1934 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 8762232-8763090(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 ATGTCGGAAA
SmilChr02G000692 Chr02 NC_080388.1:11027465-11027474promoter 内 2053-2062 bp - 1939 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 11024817-11025526(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 ATGTCGGAAA
SmilChr01G000374 Chr01 NC_080387.1:7708661-7708670promoter 内 2052-2061 bp + 1940 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 7710610-7713571(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CTGTCGGACC
SmilChr05G001099 Chr05 NC_080391.1:9150834-9150843promoter 内 2050-2059 bp + 1942 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 9152785-9157046(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TGGTCGGAAA
SmilChr01G005085 Chr01 NC_080387.1:68728416-68728425promoter 内 2020-2029 bp - 1972 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 68724846-68726444(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CTGTCGGACC
SmilChr01G002577 Chr01 NC_080387.1:43918158-43918167promoter 内 2002-2011 bp - 1990 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 43920157-43922480(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTTCCGACAT
SmilChr03G003141 Chr03 NC_080389.1:48630033-48630042promoter 内 2000-2009 bp + 1992 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 48627339-48628041(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTTCCGACCA
SmilChr01G003366 Chr01 NC_080387.1:52405117-52405126promoter 内 1982-1991 bp - 2010 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 52401490-52403107(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 ATGTCGGAAA
SmilChr02G003486 Chr02 NC_080388.1:56123578-56123587promoter 内 1981-1990 bp + 2011 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 56121495-56121567(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTTCCGACAT
SmilChr03G003610 Chr03 NC_080389.1:54727309-54727318promoter 内 1981-1990 bp - 2011 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 54724309-54725298(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGCTC