转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 88 / 149 下载 TSV

上一页 88 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr07G002622 Chr07 NC_080393.1:25288754-25288764promoter 内 796-806 bp + 3195 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 25282843-25285559(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGT
SmilChr07G002099 Chr07 NC_080393.1:19109835-19109845promoter 内 791-801 bp - 3200 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 19100843-19106635(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGCCA
SmilChr01G002345 Chr01 NC_080387.1:40595959-40595969promoter 内 720-730 bp + 3271 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 40590469-40592688(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGTT
SmilChr07G003171 Chr07 NC_080393.1:33756575-33756585promoter 内 706-716 bp + 3285 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 33759870-33762067(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTCT
SmilChr01G000347 Chr01 NC_080387.1:7118142-7118152promoter 内 654-664 bp - 3337 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 7114407-7114805(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTCT
SmilChr03G004201 Chr03 NC_080389.1:60632672-60632682promoter 内 552-562 bp + 3439 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 60636121-60638293(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTTAGCTGTCA
SmilChr06G003138 Chr06 NC_080392.1:44333226-44333236promoter 内 526-536 bp - 3465 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 44328304-44329761(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTCT
SmilChr01G001178 Chr01 NC_080387.1:23832992-23833002promoter 内 513-523 bp - 3478 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 23827198-23829514(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGCCA
SmilChr02G005155 Chr02 NC_080388.1:72922414-72922424promoter 内 488-498 bp + 3503 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 72916532-72918911(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTGAA
SmilChr02G003190 Chr02 NC_080388.1:53051137-53051147promoter 内 466-476 bp + 3525 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 53054672-53059747(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAAAGCTGTCG
SmilChr07G001514 Chr07 NC_080393.1:12088812-12088822promoter 内 454-464 bp - 3537 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 12092359-12099185(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGT
SmilChr01G002994 Chr01 NC_080387.1:48866296-48866306promoter 内 442-452 bp - 3549 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 48859269-48862747(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AACAGCTGTAA
SmilChr05G000536 Chr05 NC_080391.1:4115827-4115837promoter 内 437-447 bp - 3554 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 4109259-4112273(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTCT
SmilChr03G002087 Chr03 NC_080389.1:32163057-32163067promoter 内 424-434 bp - 3567 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 32156574-32159490(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTCT
SmilChr03G002744 Chr03 NC_080389.1:43601629-43601639promoter 内 395-405 bp + 3596 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 43605235-43608348(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTCT
SmilChr01G000804 Chr01 NC_080387.1:17346882-17346892promoter 内 348-358 bp - 3643 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 17339192-17343239(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTCT
SmilChr07G001965 Chr07 NC_080393.1:17176162-17176172promoter 内 340-350 bp - 3651 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 17179823-17179904(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTTT
SmilChr01G000833 Chr01 NC_080387.1:17957613-17957623promoter 内 308-318 bp + 3683 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 17961306-17965999(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTCT
SmilChr01G001353 Chr01 NC_080387.1:26800352-26800362promoter 内 304-314 bp - 3687 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 26804049-26809727(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGTT
SmilChr01G005325 Chr01 NC_080387.1:70482677-70482687promoter 内 303-313 bp - 3688 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 70466763-70478989(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTCT
SmilChr01G002736 Chr01 NC_080387.1:45692212-45692222promoter 内 170-180 bp - 3821 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 45696043-45696201(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAT
SmilChr07G003193 Chr07 NC_080393.1:34060703-34060713promoter 内 168-178 bp - 3823 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 34064536-34064667(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGT
SmilChr03G001624 Chr03 NC_080389.1:20832692-20832702promoter 内 148-158 bp + 3843 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 20836545-20837898(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTCT
SmilChr01G001379 Chr01 NC_080387.1:27191922-27191932promoter 内 129-139 bp - 3862 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 27187377-27188060(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTCT
SmilChr03G001490 Chr03 NC_080389.1:17951958-17951968promoter 内 117-127 bp + 3874 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 17955842-17956975(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCAGCTGTCC
SmilChr07G002832 Chr07 NC_080393.1:28373063-28373073promoter 内 95-105 bp + 3896 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 28376969-28379671(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AACAGCTGTAA
SmilChr06G000843 Chr06 NC_080392.1:7964564-7964574promoter 内 90-100 bp + 3901 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 7957261-7960663(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTAGG
SmilChr02G004209 Chr02 NC_080388.1:64360206-64360216promoter 内 89-99 bp + 3902 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 64352947-64356304(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGTT
SmilChr03G002360 Chr03 NC_080389.1:37197736-37197746promoter 内 73-83 bp - 3918 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 37201664-37203817(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGTT
SmilChr04G003870 Chr04 NC_080390.1:54595410-54595420promoter 内 13-23 bp - 3978 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 1 54599398-54602966(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAC
SmilChr04G003972 Chr04 NC_080390.1:55189488-55189498promoter 内 1900-1910 bp + 2091 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 6 55185389-55187397(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTGA
SmilChr03G002384 Chr03 NC_080389.1:37654480-37654490promoter 内 2035-2045 bp + 1956 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 3 37652021-37652524(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTCTT
SmilChr01G004517 Chr01 NC_080387.1:63300277-63300287promoter 内 3850-3860 bp + 141 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 63300428-63304872(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATGGGCTGTCA
SmilChr01G001502 Chr01 NC_080387.1:28865783-28865793promoter 内 3251-3261 bp - 740 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 28859946-28865043(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAAAGCTGTCC
SmilChr06G002929 Chr06 NC_080392.1:42156459-42156469promoter 内 2968-2978 bp - 1023 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 42153638-42155436(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TATAGCTGTCA
SmilChr01G004496 Chr01 NC_080387.1:63071493-63071503promoter 内 2897-2907 bp + 1094 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 63072597-63075081(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCAAGCTGTCT
SmilChr01G001485 Chr01 NC_080387.1:28637906-28637916promoter 内 2828-2838 bp + 1163 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 28631904-28636743(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTTC
SmilChr06G000601 Chr06 NC_080392.1:5202529-5202539promoter 内 2145-2155 bp - 1846 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 5204385-5206479(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCAT
SmilChr05G002123 Chr05 NC_080391.1:22303864-22303874promoter 内 1986-1996 bp - 2005 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 22305879-22311853(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTTC
SmilChr01G001771 Chr01 NC_080387.1:32624377-32624387promoter 内 1239-1249 bp + 2752 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 32627139-32630775(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTTAGCTGTCA
SmilChr05G001313 Chr05 NC_080391.1:11304295-11304305promoter 内 1228-1238 bp + 2763 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 11307068-11311697(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAAAGCTGTCC
SmilChr01G001983 Chr01 NC_080387.1:35215434-35215444promoter 内 1214-1224 bp + 2777 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 35218221-35220823(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TATAGCTGTCA
SmilChr01G004045 Chr01 NC_080387.1:58874837-58874847promoter 内 1068-1078 bp + 2923 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 58877770-58889743(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAAAGCTGTCC
SmilChr03G000815 Chr03 NC_080389.1:9327445-9327455promoter 内 752-762 bp - 3239 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 9321230-9324206(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCAAGCTGTCT
SmilChr03G000816 Chr03 NC_080389.1:9334984-9334994promoter 内 752-762 bp - 3239 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 9328780-9331745(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCAAGCTGTCT
SmilChr04G003256 Chr04 NC_080390.1:49304108-49304118promoter 内 706-716 bp - 3285 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 49299723-49300823(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAAAGCTGTCC
SmilChr01G000117 Chr01 NC_080387.1:2035515-2035525promoter 内 542-552 bp - 3449 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 2031059-2032066(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAAAGCTGTCC
SmilChr01G001243 Chr01 NC_080387.1:24937902-24937912promoter 内 390-400 bp - 3601 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 24933517-24934301(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAAAGCTGTCC
SmilChr03G000902 Chr03 NC_080389.1:10323575-10323585promoter 内 368-378 bp + 3623 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 10327208-10331622(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCAAGCTGTCT
SmilChr05G000480 Chr05 NC_080391.1:3754911-3754921promoter 内 338-348 bp + 3653 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.8/ 100 2 3741736-3751258(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCCAT