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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr03G003439; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00005108-RA_Salv SmilChr03G003439 bHLH XP_057798243.1 MP00195 TTAGCAACTTGCAT

可能结合的靶基因

9832 个结合位点 6878 个候选靶基因 第 9 / 138 下载 TSV

上一页 9 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G003381 Chr02 NC_080388.1:54924068-54924081promoter 内 382-395 bp + 3606 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 54927687-54930592(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 CTACCAACTTGCCT
SmilChr02G002426 Chr02 NC_080388.1:42237905-42237918promoter 内 325-338 bp + 3663 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 42241581-42241653(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 ACTCCCACTTGCAT
SmilChr02G002136 Chr02 NC_080388.1:38461570-38461583promoter 内 1422-1435 bp + 2566 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 4 38464149-38466625(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 TCAGCAACTTGGCT
SmilChr03G001031 Chr03 NC_080389.1:12016001-12016014promoter 内 3647-3660 bp + 341 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 3 12013561-12015660(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 GAGCAAGTTGGAGA
SmilChr02G002348 Chr02 NC_080388.1:41257509-41257522promoter 内 2804-2817 bp + 1184 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 3 41255458-41256325(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 GAGCAAGTTGGAGA
SmilChr02G004275 Chr02 NC_080388.1:64942822-64942835promoter 内 2793-2806 bp + 1195 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 3 64944030-64945789(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 GTTGCAACTTGCAA
SmilChr02G000984 Chr02 NC_080388.1:17324828-17324841promoter 内 1647-1660 bp - 2341 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 3 17319604-17322487(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 TTATCCACTTGCAT
SmilChr01G003315 Chr01 NC_080387.1:51874475-51874488promoter 内 761-774 bp - 3227 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 3 51877715-51880313(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 GAGCAAGTTGGAGA
SmilChr03G002752 Chr03 NC_080389.1:43749956-43749969promoter 内 704-717 bp + 3284 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 3 43741341-43746672(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 GAGCAAGTTGGAGA
SmilChr01G001296 Chr01 NC_080387.1:25830119-25830132promoter 内 189-202 bp - 3799 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 3 25825694-25826320(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 TCAGCAACTTGGCT
SmilChr01G003640 Chr01 NC_080387.1:54905217-54905230promoter 内 39-52 bp + 3949 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 3 54897961-54901268(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 GAGCAAGTTGGAGA
SmilChr02G000974 Chr02 NC_080388.1:17036514-17036527promoter 内 3985-3998 bp + 3 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 17034660-17036511(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 ATGCAAGTGGATCG
SmilChr02G000578 Chr02 NC_080388.1:8320813-8320826promoter 内 3877-3890 bp + 111 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 8318475-8320702(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 TTGCAAGTGGACGT
SmilChr01G003225 Chr01 NC_080387.1:51019955-51019968promoter 内 3428-3441 bp + 560 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 51018253-51019395(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 GAGCAAGTTGGAGA
SmilChr01G005516 Chr01 NC_080387.1:71984512-71984525promoter 内 2974-2987 bp + 1014 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 71982603-71983498(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 CAGCAAGTTGCTGC
SmilChr02G001196 Chr02 NC_080388.1:22005892-22005905promoter 内 2869-2882 bp + 1119 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 22007024-22012627(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 TTATCCACTTGCAT
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SmilChr02G000668 Chr02 NC_080388.1:10299127-10299140promoter 内 2449-2462 bp - 1539 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 10300679-10301591(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 ATGCAAGTGGATAA
SmilChr02G000667 Chr02 NC_080388.1:10288954-10288967promoter 内 2448-2461 bp - 1540 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 10290507-10291419(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 ATGCAAGTGGATAA
SmilChr03G001879 Chr03 NC_080389.1:26084079-26084092promoter 内 2440-2453 bp - 1548 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 26080846-26082531(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 TTATCCACTTGCAT
SmilChr02G004802 Chr02 NC_080388.1:70208496-70208509promoter 内 2276-2289 bp - 1712 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 70202246-70206784(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 TTATCCACTTGCAT
SmilChr03G002149 Chr03 NC_080389.1:33435930-33435943promoter 内 2263-2276 bp + 1725 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 33433170-33434205(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 ATGCAAGTGGATAA
SmilChr03G002332 Chr03 NC_080389.1:36783766-36783779promoter 内 2207-2220 bp + 1781 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 36781031-36781985(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 ATGCAAGTGGATAA
SmilChr02G000322 Chr02 NC_080388.1:4042311-4042324promoter 内 2193-2206 bp + 1795 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 4044119-4047447(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 TCTCCAACTTGCTC
SmilChr02G002124 Chr02 NC_080388.1:38011393-38011406promoter 内 2136-2149 bp - 1852 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 38013258-38015255(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 ATGCAAGTTGCTAT
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SmilChr03G001944 Chr03 NC_080389.1:27695569-27695582promoter 内 1746-1759 bp - 2242 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 27697824-27700724(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 ATGCAAGTGGATAA
SmilChr03G002020 Chr03 NC_080389.1:30228628-30228641promoter 内 1663-1676 bp - 2325 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 30224158-30226303(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 TTATCCACTTGCAT
SmilChr01G004184 Chr01 NC_080387.1:60279891-60279904promoter 内 1484-1497 bp - 2504 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 60282408-60283101(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 GCGCAAGTTGGCTA
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SmilChr03G002674 Chr03 NC_080389.1:42464500-42464513promoter 内 356-369 bp - 3632 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 42453681-42460868(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 TTGTCCACTTGCAG
SmilChr03G002793 Chr03 NC_080389.1:44420831-44420844promoter 内 295-308 bp - 3693 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 44413509-44417138(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 TTGTCCACTTGCAG
SmilChr03G003759 Chr03 NC_080389.1:56712884-56712897promoter 内 91-104 bp - 3897 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 56702958-56708987(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 TCTCCAACTTGCTC
SmilChr01G005515 Chr01 NC_080387.1:71984512-71984525promoter 内 58-71 bp + 3930 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 71975466-71980582(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 CAGCAAGTTGCTGC
SmilChr02G000975 Chr02 NC_080388.1:17045271-17045284promoter 内 3986-3999 bp + 2 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 17041698-17045269(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 ATGCAAGTGGATCG
SmilChr02G003129 Chr02 NC_080388.1:52320085-52320098promoter 内 3919-3932 bp + 69 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 52318231-52320016(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 ATGCAAGTGGATCG
SmilChr03G004116 Chr03 NC_080389.1:60055812-60055825promoter 内 3842-3855 bp + 146 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 60055971-60059573(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 GTTGCAACTTGCAA
SmilChr03G003667 Chr03 NC_080389.1:55513300-55513313promoter 内 3764-3777 bp - 224 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 55510157-55513076(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 CCGGCAACTTGCTG
SmilChr02G001552 Chr02 NC_080388.1:28806257-28806270promoter 内 3658-3671 bp + 330 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 28806600-28807767(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 TTACCAACTTGCAT
SmilChr02G004286 Chr02 NC_080388.1:65167205-65167218promoter 内 3623-3636 bp + 365 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 65167583-65167655(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 ATTGCCACTTGCAA
SmilChr01G002423 Chr01 NC_080387.1:41723004-41723017promoter 内 3601-3614 bp - 387 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 41723404-41725471(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 AGGCAAGTTGGGCA
SmilChr03G001549 Chr03 NC_080389.1:19539576-19539589promoter 内 3557-3570 bp - 431 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 19536479-19539145(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 GCAGCAACTTGCTG
SmilChr03G000024 Chr03 NC_080389.1:364930-364943promoter 内 3506-3519 bp - 482 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 363541-364448(-) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 GTTGCAACTTGCAA
SmilChr01G002686 Chr01 NC_080387.1:45068359-45068372promoter 内 3427-3440 bp - 561 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 45068933-45070075(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 GAGCAAGTTGGAGA
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SmilChr03G001638 Chr03 NC_080389.1:21128320-21128333promoter 内 3399-3412 bp - 589 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 21128922-21131369(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 ATGCAAGTGGATAA
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SmilChr03G001551 Chr03 NC_080389.1:19539576-19539589promoter 内 3049-3062 bp - 939 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 19540528-19540599(+) SMil_00005108-RA_Salv MP00195 CAGCAAGTTGCTGC