转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 9 / 149 下载 TSV

上一页 9 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G005569 Chr02 NC_080388.1:75591203-75591213promoter 内 2219-2229 bp + 1772 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 75584703-75589431(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGC
SmilChr02G003540 Chr02 NC_080388.1:56561993-56562003promoter 内 2212-2222 bp - 1779 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 56563782-56564552(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGC
SmilChr04G001169 Chr04 NC_080390.1:17482637-17482647promoter 内 2212-2222 bp + 1779 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 17484426-17485847(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGCC
SmilChr03G003511 Chr03 NC_080389.1:53723091-53723101promoter 内 2054-2064 bp - 1937 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 53716724-53721154(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCAAGCTGTCA
SmilChr02G000465 Chr02 NC_080388.1:6229841-6229851promoter 内 2041-2051 bp - 1950 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 6225120-6227891(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCAAGCTGTCA
SmilChr02G000782 Chr02 NC_080388.1:12837955-12837965promoter 内 2020-2030 bp - 1971 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 12839936-12842759(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGC
SmilChr03G004698 Chr03 NC_080389.1:64304042-64304052promoter 内 1779-1789 bp + 2212 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 64306264-64307003(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCAAGCTGTCA
SmilChr02G004808 Chr02 NC_080388.1:70261658-70261668promoter 内 1704-1714 bp + 2287 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 70256688-70259371(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTT
SmilChr05G000014 Chr05 NC_080391.1:58707-58717promoter 内 1693-1703 bp + 2298 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 61015-62006(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCAAGCTGTCA
SmilChr01G000903 Chr01 NC_080387.1:19088751-19088761promoter 内 1640-1650 bp + 2351 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 19085731-19086400(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGC
SmilChr06G000571 Chr06 NC_080392.1:4883387-4883397promoter 内 1110-1120 bp - 2881 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 4876436-4880506(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGCC
SmilChr04G003737 Chr04 NC_080390.1:53684114-53684124promoter 内 1090-1100 bp - 2901 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 53674703-53681213(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCAAGCTGTCA
SmilChr04G001535 Chr04 NC_080390.1:25277838-25277848promoter 内 1040-1050 bp + 2951 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 25280799-25282615(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGCC
SmilChr01G005803 Chr01 NC_080387.1:74094016-74094026promoter 内 921-931 bp + 3070 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 74097096-74099868(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCAAGCTGTCA
SmilChr04G000499 Chr04 NC_080390.1:5453446-5453456promoter 内 798-808 bp + 3193 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 5456649-5458870(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCAAGCTGTCA
SmilChr02G003887 Chr02 NC_080388.1:60960395-60960405promoter 内 658-668 bp - 3333 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 60953433-60957062(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AACAGCTGTCA
SmilChr02G002817 Chr02 NC_080388.1:48262910-48262920promoter 内 627-637 bp + 3364 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 48266284-48268490(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AACAGCTGTCA
SmilChr01G004513 Chr01 NC_080387.1:63254863-63254873promoter 内 607-617 bp - 3384 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 63258257-63262797(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGC
SmilChr06G001067 Chr06 NC_080392.1:10549999-10550009promoter 内 399-409 bp - 3592 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 10538855-10546407(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGCC
SmilChr03G000905 Chr03 NC_080389.1:10366458-10366468promoter 内 258-268 bp + 3733 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 10370201-10373104(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AACAGCTGTCA
SmilChr06G001501 Chr06 NC_080392.1:16083419-16083429promoter 内 225-235 bp - 3766 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 16066318-16079653(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AACAGCTGTCA
SmilChr01G003473 Chr01 NC_080387.1:53273570-53273580promoter 内 216-226 bp - 3775 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 53277355-53281155(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTGTT
SmilChr06G000237 Chr06 NC_080392.1:1588516-1588526promoter 内 183-193 bp + 3808 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 1592334-1593662(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCAAGCTGTCA
SmilChr02G003264 Chr02 NC_080388.1:53924537-53924547promoter 内 1894-1904 bp - 2097 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 4 53920424-53922440(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCA
SmilChr03G004202 Chr03 NC_080389.1:60643182-60643192promoter 内 3903-3913 bp - 88 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 3 60638345-60643094(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCA
SmilChr03G004203 Chr03 NC_080389.1:60643182-60643192promoter 内 3897-3907 bp - 94 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 3 60641507-60643088(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCA
SmilChr01G004503 Chr01 NC_080387.1:63134331-63134341promoter 内 3410-3420 bp + 581 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 3 63129544-63133750(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGG
SmilChr03G001731 Chr03 NC_080389.1:23264600-23264610promoter 内 3099-3109 bp + 892 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 3 23261323-23263708(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGG
SmilChr02G003313 Chr02 NC_080388.1:54389769-54389779promoter 内 3007-3017 bp - 984 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 3 54390763-54392598(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGG
SmilChr01G004088 Chr01 NC_080387.1:59286455-59286465promoter 内 2741-2751 bp - 1250 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 3 59287715-59289915(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGG
SmilChr02G001467 Chr02 NC_080388.1:27408877-27408887promoter 内 2134-2144 bp - 1857 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 3 27403928-27407020(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCGAGCTGTCA
SmilChr01G001094 Chr01 NC_080387.1:22387031-22387041promoter 内 3496-3506 bp + 495 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 22386464-22386536(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGG
SmilChr01G004931 Chr01 NC_080387.1:67366109-67366119promoter 内 3458-3468 bp + 533 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 67366652-67368209(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCA
SmilChr01G004459 Chr01 NC_080387.1:62708890-62708900promoter 内 3199-3209 bp - 792 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 62709692-62712192(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGG
SmilChr05G004197 Chr05 NC_080391.1:55837722-55837732promoter 内 3198-3208 bp + 793 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 55832925-55836929(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGG
SmilChr05G001882 Chr05 NC_080391.1:19091351-19091361promoter 内 3155-3165 bp - 836 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 19092197-19094948(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGG
SmilChr02G003847 Chr02 NC_080388.1:60219339-60219349promoter 内 3084-3094 bp - 907 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 60217041-60218432(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCA
SmilChr05G003057 Chr05 NC_080391.1:38386111-38386121promoter 内 3033-3043 bp - 958 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 38387079-38387184(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGG
SmilChr06G000206 Chr06 NC_080392.1:1404812-1404822promoter 内 2639-2649 bp + 1352 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 1401045-1403460(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCGC
SmilChr06G000103 Chr06 NC_080392.1:735542-735552promoter 内 2364-2374 bp - 1627 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 737179-739091(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGG
SmilChr01G005368 Chr01 NC_080387.1:70896944-70896954promoter 内 2041-2051 bp - 1950 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 70892558-70894994(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCA
SmilChr03G004262 Chr03 NC_080389.1:61113080-61113090promoter 内 2016-2026 bp + 1975 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 61109432-61111105(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGG
SmilChr02G003403 Chr02 NC_080388.1:55199285-55199295promoter 内 1459-1469 bp - 2532 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 55188001-55196753(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCA
SmilChr01G001726 Chr01 NC_080387.1:31799777-31799787promoter 内 1251-1261 bp + 2740 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 31794900-31797037(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGG
SmilChr05G002752 Chr05 NC_080391.1:31795536-31795546promoter 内 424-434 bp + 3567 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 31786027-31791969(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGG
SmilChr02G003846 Chr02 NC_080388.1:60219339-60219349promoter 内 121-131 bp - 3870 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 60211654-60215469(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCA
SmilChr02G003177 Chr02 NC_080388.1:52920719-52920729promoter 内 3919-3929 bp - 72 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 52920801-52925928(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGCCAGCTGGG
SmilChr05G000648 Chr05 NC_080391.1:4902738-4902748promoter 内 3637-3647 bp + 354 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 4903102-4904866(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCA
SmilChr01G001011 Chr01 NC_080387.1:21236319-21236329promoter 内 3524-3534 bp - 467 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 21236796-21236868(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTGG
SmilChr05G000744 Chr05 NC_080391.1:5727808-5727818promoter 内 3518-3528 bp + 473 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 5728291-5736450(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCAAGCTGTCA