转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001365; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010780-RA_Salv SmilChr06G001365 SBP XP_057768799.1 MP00307 ATTGTACGGAT

可能结合的靶基因

9755 个结合位点 6893 个候选靶基因 第 90 / 138 下载 TSV

上一页 90 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G002808 Chr03 NC_080389.1:44539559-44539569promoter 内 1243-1253 bp + 2748 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 44529863-44536811(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 CAACGTACAAA
SmilChr01G001270 Chr01 NC_080387.1:25378184-25378194promoter 内 1163-1173 bp - 2828 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 25381022-25384673(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 CTAAGTACAAT
SmilChr03G003949 Chr03 NC_080389.1:58549595-58549605promoter 内 1154-1164 bp - 2837 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 58552442-58553992(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ACAAGTACAAT
SmilChr01G002249 Chr01 NC_080387.1:39102657-39102667promoter 内 1144-1154 bp - 2847 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 39105514-39107684(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 CTAAGTACAAT
SmilChr01G005462 Chr01 NC_080387.1:71639006-71639016promoter 内 1047-1057 bp + 2944 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 71632959-71636062(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 CTAAGTACAAT
SmilChr01G005464 Chr01 NC_080387.1:71639006-71639016promoter 内 1047-1057 bp + 2944 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 71641960-71651010(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATTGTACTTAG
SmilChr03G001462 Chr03 NC_080389.1:17459643-17459653promoter 内 1043-1053 bp - 2948 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 17462601-17463092(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 CAACGTACAAA
SmilChr03G002251 Chr03 NC_080389.1:35451210-35451220promoter 内 1029-1039 bp + 2962 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 35445037-35448248(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ACAAGTACAAT
SmilChr03G003547 Chr03 NC_080389.1:54101127-54101137promoter 内 1027-1037 bp + 2964 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 54104101-54106399(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATTGTACTTGT
SmilChr03G000561 Chr03 NC_080389.1:6098906-6098916promoter 内 1011-1021 bp - 2980 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 6101896-6104054(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 CTAAGTACAAT
SmilChr02G005277 Chr02 NC_080388.1:73839240-73839250promoter 内 959-969 bp + 3032 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 73834413-73836208(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ACAAGTACAAT
SmilChr01G005087 Chr01 NC_080387.1:68730555-68730565promoter 内 895-905 bp - 3096 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 68733661-68735754(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 CAACGTACAAA
SmilChr01G005051 Chr01 NC_080387.1:68458483-68458493promoter 内 867-877 bp + 3124 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 68451266-68455359(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 GGTCGTACAAA
SmilChr01G002143 Chr01 NC_080387.1:37417304-37417314promoter 内 809-819 bp - 3182 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 37405867-37414122(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TAGGTACGGAG
SmilChr03G000195 Chr03 NC_080389.1:2184296-2184306promoter 内 781-791 bp - 3210 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 2178065-2181086(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATTGTACTTAG
SmilChr02G004514 Chr02 NC_080388.1:67674405-67674415promoter 内 740-750 bp + 3251 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 67677666-67680939(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATTGTACTTGT
SmilChr01G000296 Chr01 NC_080387.1:5827585-5827595promoter 内 731-741 bp + 3260 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 5830855-5833154(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATTGTACTTGT
SmilChr01G003948 Chr01 NC_080387.1:57855814-57855824promoter 内 719-729 bp - 3272 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 57859096-57862319(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 CAACGTACAAA
SmilChr01G000724 Chr01 NC_080387.1:16175929-16175939promoter 内 680-690 bp - 3311 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 16169824-16172618(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATTGTACTTAG
SmilChr01G000366 Chr01 NC_080387.1:7569559-7569569promoter 内 652-662 bp + 3339 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 7572908-7575735(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TTTGTACGTCA
SmilChr02G005115 Chr02 NC_080388.1:72673255-72673265promoter 内 629-639 bp - 3362 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 72666026-72669893(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TAGGTACGGAG
SmilChr02G003235 Chr02 NC_080388.1:53629721-53629731promoter 内 628-638 bp + 3363 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 53633094-53636210(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATTGTACTTGT
SmilChr03G003467 Chr03 NC_080389.1:53127420-53127430promoter 内 612-622 bp + 3379 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 53123903-53124041(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ACAAGTACAAT
SmilChr03G001341 Chr03 NC_080389.1:15657436-15657446promoter 内 580-590 bp - 3411 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 15649684-15654025(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATTGTACTTGT
SmilChr02G001737 Chr02 NC_080388.1:31948947-31948957promoter 内 572-582 bp + 3419 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 31944839-31945528(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ACAAGTACAAT
SmilChr03G002085 Chr03 NC_080389.1:32087971-32087981promoter 内 557-567 bp + 3434 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 32080679-32084537(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ACTCGTACAAC
SmilChr03G002819 Chr03 NC_080389.1:44665978-44665988promoter 内 469-479 bp + 3522 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 44659604-44662456(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ACAAGTACAAT
SmilChr02G004968 Chr02 NC_080388.1:71581046-71581056promoter 内 459-469 bp - 3532 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 71584588-71591206(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ACAAGTACAAT
SmilChr01G003864 Chr01 NC_080387.1:56907608-56907618promoter 内 424-434 bp + 3567 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 56896474-56904041(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 CTTCGTACAAC
SmilChr02G001157 Chr02 NC_080388.1:21108789-21108799promoter 内 418-428 bp + 3573 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 21112372-21115555(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATTGTACTTGT
SmilChr01G001927 Chr01 NC_080387.1:34417126-34417136promoter 内 403-413 bp - 3588 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 34412044-34413538(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATTGTACTTGT
SmilChr02G000366 Chr02 NC_080388.1:4669403-4669413promoter 内 150-160 bp + 3841 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 4673254-4673950(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATTGTACTTGT
SmilChr01G001264 Chr01 NC_080387.1:25342935-25342945promoter 内 145-155 bp + 3846 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 25338009-25339089(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ACAAGTACAAT
SmilChr02G004327 Chr02 NC_080388.1:65551549-65551559promoter 内 135-145 bp + 3856 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 65555415-65558922(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TTTGTACGTCA
SmilChr01G005041 Chr01 NC_080387.1:68346964-68346974promoter 内 81-91 bp - 3910 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 68340382-68343054(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TTTGTACGACC
SmilChr03G003692 Chr03 NC_080389.1:55870289-55870299promoter 内 81-91 bp - 3910 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 55859600-55866379(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TTTGTACGACC
SmilChr01G003766 Chr01 NC_080387.1:56041555-56041565promoter 内 36-46 bp + 3955 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 56035765-56037600(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 CTAAGTACAAT
SmilChr01G000407 Chr01 NC_080387.1:8296203-8296213promoter 内 20-30 bp - 3971 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 8300184-8301169(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 CTAAGTACAAT
SmilChr01G002487 Chr01 NC_080387.1:42597241-42597251promoter 内 6-16 bp - 3985 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 42601236-42602303(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 CAACGTACAAA
SmilChr03G003682 Chr03 NC_080389.1:55665878-55665888promoter 内 5-15 bp + 3986 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 55655627-55661892(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 CTTCGTACAAC
SmilChr03G002264 Chr03 NC_080389.1:35645821-35645831promoter 内 3012-3022 bp - 979 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 35641720-35644842(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TTTGTACGAAT
SmilChr02G001681 Chr02 NC_080388.1:31049028-31049038promoter 内 2267-2277 bp - 1724 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 31050762-31051106(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 GTCCGTACTGG
SmilChr01G002980 Chr01 NC_080387.1:48739500-48739510promoter 内 3774-3784 bp - 217 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 48734833-48739283(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TTTGTACGAAT
SmilChr03G002070 Chr03 NC_080389.1:31603178-31603188promoter 内 3706-3716 bp - 285 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 31603473-31605806(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 GTCCGTACTGG
SmilChr02G005306 Chr02 NC_080388.1:73983254-73983264promoter 内 3667-3677 bp + 324 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 73980373-73982930(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 GAGCGTACAAG
SmilChr01G002519 Chr01 NC_080387.1:43152337-43152347promoter 内 3581-3591 bp - 410 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 43152757-43154134(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATTCGTACAAA
SmilChr01G005780 Chr01 NC_080387.1:73910954-73910964promoter 内 3264-3274 bp + 727 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 73906457-73910227(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATTCGTACAAA
SmilChr03G003124 Chr03 NC_080389.1:48428113-48428123promoter 内 3145-3155 bp - 846 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 48424143-48427267(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TTTGTACGTCG
SmilChr03G002349 Chr03 NC_080389.1:37124211-37124221promoter 内 3105-3115 bp - 886 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 37125107-37130887(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATTCGTACAAA
SmilChr03G001891 Chr03 NC_080389.1:26420608-26420618promoter 内 3024-3034 bp - 967 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 26421585-26424779(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 GAGCGTACAAG