转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004199; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010571-RA_Salv SmilChr01G004199 bHLH XP_057782208.1 MP00074 AGAAGGTCACGTGG

可能结合的靶基因

9969 个结合位点 7396 个候选靶基因 第 91 / 148 下载 TSV

上一页 91 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G002991 Chr05 NC_080391.1:36638410-36638423promoter 内 1055-1068 bp - 2933 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 36634650-36635477(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TAAAACACACGTGG
SmilChr07G000503 Chr07 NC_080393.1:3524848-3524861promoter 内 948-961 bp - 3040 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 3520150-3521808(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GACTAGTCACGTGT
SmilChr03G002015 Chr03 NC_080389.1:30098744-30098757promoter 内 924-937 bp + 3064 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 30094670-30095680(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAGAACAT
SmilChr08G000190 Chr08 NC_080394.1:1274110-1274123promoter 内 873-886 bp - 3115 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 1277238-1279650(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCAATGAT
SmilChr08G000188 Chr08 NC_080394.1:1274110-1274123promoter 内 806-819 bp - 3182 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 1270218-1270928(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATCATTGCACGTGG
SmilChr01G005625 Chr01 NC_080387.1:72728360-72728373promoter 内 729-742 bp + 3259 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 72723566-72725101(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAATAACC
SmilChr06G001065 Chr06 NC_080392.1:10514330-10514343promoter 内 679-692 bp + 3309 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 10517652-10518255(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGAGAATCACGTGT
SmilChr02G004753 Chr02 NC_080388.1:69724095-69724108promoter 内 658-671 bp + 3330 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 69727438-69727509(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TAAGCTGCACGTGG
SmilChr03G002538 Chr03 NC_080389.1:40530112-40530125promoter 内 658-671 bp + 3330 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 40533455-40533874(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TAGTTGTCACGTGC
SmilChr07G001892 Chr07 NC_080393.1:16339707-16339720promoter 内 573-586 bp + 3415 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 16343135-16345754(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGAGAATCACGTGT
SmilChr01G000436 Chr01 NC_080387.1:8758382-8758395promoter 内 534-547 bp + 3454 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 8753789-8754928(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAGAACAT
SmilChr01G000435 Chr01 NC_080387.1:8726616-8726629promoter 内 532-545 bp + 3456 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 8722021-8723160(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAGAACAT
SmilChr05G000272 Chr05 NC_080391.1:2094904-2094917promoter 内 526-539 bp - 3462 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 2098379-2109259(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGATTCTCC
SmilChr02G004754 Chr02 NC_080388.1:69724095-69724108promoter 内 468-481 bp + 3520 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 69727628-69728425(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TAAGCTGCACGTGG
SmilChr07G002728 Chr07 NC_080393.1:26748493-26748506promoter 内 457-470 bp + 3531 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 26742323-26744962(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTTCACAC
SmilChr03G004131 Chr03 NC_080389.1:60141238-60141251promoter 内 246-259 bp - 3742 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 60144993-60155269(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGAGATTCG
SmilChr02G003619 Chr02 NC_080388.1:57478671-57478684promoter 内 232-245 bp - 3756 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 57482440-57483765(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAAAAACC
SmilChr07G004676 Chr07 NC_080393.1:59716558-59716571promoter 内 133-146 bp - 3855 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 59710700-59712703(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATCCTCACACGTGG
SmilChr02G000152 Chr02 NC_080388.1:2004086-2004099promoter 内 118-131 bp - 3870 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 1996854-2000216(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATGTTCTCACGTGG
SmilChr02G000365 Chr02 NC_080388.1:4676457-4676470promoter 内 23-36 bp + 3965 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 4667837-4672492(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGGAGTCA
SmilChr03G002290 Chr03 NC_080389.1:36096493-36096506promoter 内 2176-2189 bp - 1812 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 5 36098318-36099253(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGACACATA
SmilChr07G001102 Chr07 NC_080393.1:8126148-8126161promoter 内 3714-3727 bp + 274 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 8123588-8125874(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGAGTCGAA
SmilChr01G006074 Chr01 NC_080387.1:76197087-76197100promoter 内 3439-3452 bp + 549 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 76191386-76196538(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTGGATAT
SmilChr01G001336 Chr01 NC_080387.1:26540499-26540512promoter 内 2619-2632 bp - 1369 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 26541881-26545457(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGTGTCAA
SmilChr02G002002 Chr02 NC_080388.1:36168066-36168079promoter 内 1469-1482 bp - 2519 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 36170598-36172024(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGATATGAC
SmilChr07G000086 Chr07 NC_080393.1:454781-454794promoter 内 1393-1406 bp - 2595 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 446555-452186(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATAGATCCACGTGG
SmilChr01G000469 Chr01 NC_080387.1:9583280-9583293promoter 内 1259-1272 bp + 2729 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 9586022-9587586(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TATGTGTCACGTGT
SmilChr06G002202 Chr06 NC_080392.1:30562224-30562237promoter 内 1197-1210 bp - 2791 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 30565028-30568746(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGATGCCT
SmilChr04G002562 Chr04 NC_080390.1:40942656-40942669promoter 内 1025-1038 bp - 2963 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 40945632-40947752(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGAAGCTTC
SmilChr01G004020 Chr01 NC_080387.1:58596800-58596813promoter 内 768-781 bp - 3220 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 58591649-58593580(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGTATTCCACGTGG
SmilChr08G000892 Chr08 NC_080394.1:6616988-6617001promoter 内 750-763 bp - 3238 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 6620239-6620726(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGAAGCTTC
SmilChr03G000768 Chr03 NC_080389.1:8790580-8790593promoter 内 243-256 bp + 3745 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 8780555-8786835(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGACACATA
SmilChr03G002023 Chr03 NC_080389.1:30316291-30316304promoter 内 148-161 bp + 3840 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 30310880-30312451(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTTTCAAC
SmilChr06G001808 Chr06 NC_080392.1:21259104-21259117promoter 内 132-145 bp - 3856 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 21262973-21266350(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTTTCAAC
SmilChr07G000118 Chr07 NC_080393.1:663148-663161promoter 内 3928-3941 bp + 60 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 663221-665376(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CACACTCCACGTGG
SmilChr02G000636 Chr02 NC_080388.1:9618959-9618972promoter 内 3922-3935 bp - 66 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 9619038-9620598(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGATCCATC
SmilChr01G000503 Chr01 NC_080387.1:10205706-10205719promoter 内 3817-3830 bp - 171 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 10205890-10206875(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTTTCAAC
SmilChr01G002879 Chr01 NC_080387.1:47396375-47396388promoter 内 3809-3822 bp + 179 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 47394962-47396196(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCTCGCCG
SmilChr05G002254 Chr05 NC_080391.1:24221644-24221657promoter 内 3790-3803 bp - 198 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 24221855-24222823(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGACTGCAT
SmilChr03G003690 Chr03 NC_080389.1:55840161-55840174promoter 内 3776-3789 bp + 212 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 55838321-55839949(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGAAGCCAT
SmilChr03G001203 Chr03 NC_080389.1:13872924-13872937promoter 内 3775-3788 bp - 213 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 13873150-13876332(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAAATATC
SmilChr04G000353 Chr04 NC_080390.1:3361995-3362008promoter 内 3757-3770 bp - 231 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 3358052-3361764(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGCGTTTCACGTGT
SmilChr01G006132 Chr01 NC_080387.1:76844388-76844401promoter 内 3676-3689 bp + 312 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 76837515-76844076(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTGGATAT
SmilChr07G003899 Chr07 NC_080393.1:49036235-49036248promoter 内 3650-3663 bp - 338 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 49036586-49042506(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGACAACTG
SmilChr03G002210 Chr03 NC_080389.1:34857237-34857250promoter 内 3624-3637 bp - 364 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 34857614-34858137(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAGAACCG
SmilChr03G002521 Chr03 NC_080389.1:40188107-40188120promoter 内 3525-3538 bp + 463 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 40188583-40191944(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGCGTTTCACGTGT
SmilChr03G002522 Chr03 NC_080389.1:40197778-40197791promoter 内 3522-3535 bp + 466 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 40198257-40201616(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGCGTTTCACGTGT
SmilChr08G000300 Chr08 NC_080394.1:2104950-2104963promoter 内 3484-3497 bp - 504 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 2105467-2108306(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGACACATA
SmilChr01G000298 Chr01 NC_080387.1:5868645-5868658promoter 内 3437-3450 bp + 551 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 5866970-5868094(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGATTTGCG
SmilChr04G001575 Chr04 NC_080390.1:26146256-26146269promoter 内 3418-3431 bp - 570 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 26142214-26145686(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGGTCAGCACGTGG