转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G005217; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00006334-RA_Salv SmilChr02G005217 G2-like XP_057792502.1 MP00022 GAGAATCTGT

可能结合的靶基因

9720 个结合位点 6959 个候选靶基因 第 92 / 140 下载 TSV

上一页 92 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G000921 Chr03 NC_080389.1:10530574-10530583promoter 内 2817-2826 bp + 1175 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 10531758-10532970(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTAT
SmilChr02G000781 Chr02 NC_080388.1:12838134-12838143promoter 内 2787-2796 bp - 1205 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 12835022-12836929(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTAT
SmilChr01G001981 Chr01 NC_080387.1:35202465-35202474promoter 内 2775-2784 bp + 1217 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 35203691-35205227(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTTC
SmilChr02G004575 Chr02 NC_080388.1:68249806-68249815promoter 内 2770-2779 bp - 1222 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 68251037-68253803(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAAGATTCTC
SmilChr03G003963 Chr03 NC_080389.1:58675484-58675493promoter 内 2768-2777 bp + 1224 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 58676717-58685649(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTTC
SmilChr01G002537 Chr01 NC_080387.1:43437390-43437399promoter 内 2715-2724 bp - 1277 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 43435817-43436113(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTTC
SmilChr03G001373 Chr03 NC_080389.1:16190618-16190627promoter 内 2698-2707 bp + 1294 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 16191921-16196205(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTAT
SmilChr02G002635 Chr02 NC_080388.1:45724304-45724313promoter 内 2696-2705 bp + 1296 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 45721229-45723008(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAAGATTCTC
SmilChr01G002442 Chr01 NC_080387.1:41998348-41998357promoter 内 2678-2687 bp + 1314 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 41999671-42000568(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTTC
SmilChr01G004063 Chr01 NC_080387.1:59052205-59052214promoter 内 2654-2663 bp - 1338 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 59048029-59050867(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTTC
SmilChr02G004536 Chr02 NC_080388.1:67940309-67940318promoter 内 2642-2651 bp + 1350 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 67930185-67938959(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAAGATTCTC
SmilChr02G001312 Chr02 NC_080388.1:24349050-24349059promoter 内 2608-2617 bp - 1384 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 24346163-24347666(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTAT
SmilChr02G000525 Chr02 NC_080388.1:7227978-7227987promoter 内 2599-2608 bp + 1393 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 7225756-7226585(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAAGATTCTC
SmilChr03G002340 Chr03 NC_080389.1:36890355-36890364promoter 内 2596-2605 bp - 1396 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 36885893-36888959(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTAT
SmilChr02G001033 Chr02 NC_080388.1:18274679-18274688promoter 内 2585-2594 bp - 1407 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 18276095-18279205(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 ATAGATTCTG
SmilChr02G001315 Chr02 NC_080388.1:24464282-24464291promoter 内 2585-2594 bp + 1407 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 24459765-24462875(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 ATAGATTCTG
SmilChr04G000281 Chr04 NC_080390.1:2584903-2584912promoter 内 2561-2570 bp + 1431 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 2586343-2586736(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTAT
SmilChr02G001721 Chr02 NC_080388.1:31660871-31660880promoter 内 2542-2551 bp - 1450 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 31662330-31665400(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 ATAGATTCTG
SmilChr04G000335 Chr04 NC_080390.1:3089719-3089728promoter 内 2520-2529 bp + 1472 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 3091200-3091923(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTAT
SmilChr01G000472 Chr01 NC_080387.1:9645047-9645056promoter 内 2514-2523 bp + 1478 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 9640587-9643569(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 ATAGATTCTG
SmilChr03G000496 Chr03 NC_080389.1:5313822-5313831promoter 内 2460-2469 bp - 1532 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 5308165-5312290(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTAT
SmilChr02G003432 Chr02 NC_080388.1:55549484-55549493promoter 内 2445-2454 bp + 1547 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 55551040-55555242(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTAT
SmilChr03G002311 Chr03 NC_080389.1:36376339-36376348promoter 内 2433-2442 bp + 1559 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 36372615-36374780(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAAGATTCTC
SmilChr02G001983 Chr02 NC_080388.1:35780546-35780555promoter 内 2411-2420 bp - 1581 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 35777989-35778965(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTTC
SmilChr01G000083 Chr01 NC_080387.1:1575582-1575591promoter 内 2364-2373 bp + 1628 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 1577219-1585906(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTAT
SmilChr01G004563 Chr01 NC_080387.1:63711302-63711311promoter 内 2358-2367 bp - 1634 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 63708057-63709668(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTAT
SmilChr02G004527 Chr02 NC_080388.1:67870139-67870148promoter 内 2351-2360 bp - 1641 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 67864466-67868498(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTAT
SmilChr01G004657 Chr01 NC_080387.1:64663538-64663547promoter 内 2335-2344 bp + 1657 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 64665204-64666374(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTTC
SmilChr03G002991 Chr03 NC_080389.1:46727114-46727123promoter 内 2325-2334 bp - 1667 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 46728790-46730217(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 ATAGATTCTG
SmilChr04G000886 Chr04 NC_080390.1:11333292-11333301promoter 内 2318-2327 bp - 1674 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 11334975-11335953(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAAGATTCTC
SmilChr01G002858 Chr01 NC_080387.1:47159260-47159269promoter 内 2303-2312 bp + 1689 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 47160958-47163601(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTTC
SmilChr02G000266 Chr02 NC_080388.1:3436173-3436182promoter 内 2288-2297 bp - 1704 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 3437886-3447368(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAAGATTCTC
SmilChr02G003667 Chr02 NC_080388.1:58057260-58057269promoter 内 2284-2293 bp - 1708 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 58058977-58066952(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 ATAGATTCTG
SmilChr01G005287 Chr01 NC_080387.1:70219341-70219350promoter 内 2255-2264 bp - 1737 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 70221087-70222094(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAAGATTCTC
SmilChr02G005005 Chr02 NC_080388.1:71853571-71853580promoter 内 2237-2246 bp - 1755 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 71842290-71851816(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTAT
SmilChr01G000415 Chr01 NC_080387.1:8383429-8383438promoter 内 2235-2244 bp - 1757 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 8385195-8388526(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAAGATTCTC
SmilChr01G001231 Chr01 NC_080387.1:24730555-24730564promoter 内 2224-2233 bp + 1768 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 24727627-24728787(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAAGATTCTC
SmilChr04G000747 Chr04 NC_080390.1:9170765-9170774promoter 内 2222-2231 bp - 1770 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 9163082-9168995(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTAT
SmilChr02G002518 Chr02 NC_080388.1:43702516-43702525promoter 内 2164-2173 bp - 1828 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 43700583-43700688(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTTC
SmilChr04G000206 Chr04 NC_080390.1:1828504-1828513promoter 内 2081-2090 bp - 1911 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 1830424-1833894(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAAGATTCTC
SmilChr01G002568 Chr01 NC_080387.1:43783643-43783652promoter 内 2062-2071 bp + 1930 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 43781518-43781713(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 ATAGATTCTG
SmilChr03G002789 Chr03 NC_080389.1:44397051-44397060promoter 内 2062-2071 bp + 1930 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 44398990-44400916(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTTC
SmilChr02G001926 Chr02 NC_080388.1:34681655-34681664promoter 内 2059-2068 bp + 1933 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 34678675-34679722(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 ATAGATTCTG
SmilChr04G000282 Chr04 NC_080390.1:2584903-2584912promoter 内 1983-1992 bp + 2009 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 2586921-2587785(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTAT
SmilChr03G000239 Chr03 NC_080389.1:2843273-2843282promoter 内 1888-1897 bp - 2104 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 2839891-2841169(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTAT
SmilChr03G001774 Chr03 NC_080389.1:24195004-24195013promoter 内 1882-1891 bp - 2110 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 24191082-24192894(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTTC
SmilChr03G000572 Chr03 NC_080389.1:6234148-6234157promoter 内 1864-1873 bp + 2128 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 6229919-6232020(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAAGATTCTC
SmilChr03G001095 Chr03 NC_080389.1:12639436-12639445promoter 内 1855-1864 bp + 2137 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 12641582-12642288(+) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 CAGAATCTAT
SmilChr03G001191 Chr03 NC_080389.1:13715269-13715278promoter 内 1825-1834 bp - 2167 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 13707541-13713102(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 GAGAATCTTC
SmilChr01G002440 Chr01 NC_080387.1:41972436-41972445promoter 内 1812-1821 bp + 2180 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 41968603-41970256(-) SMil_00006334-RA_Salv MP00022 ATAGATTCTG