转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G004392; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00022653-RA_Salv SmilChr05G004392 WRKY XP_057811204.1 MP00506 AAAAGTCAACGAC

可能结合的靶基因

9818 个结合位点 7173 个候选靶基因 第 92 / 144 下载 TSV

上一页 92 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G005514 Chr02 NC_080388.1:75253736-75253748promoter 内 1124-1136 bp - 2865 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 75249826-75250871(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GAAAGTCAAACGG
SmilChr01G003271 Chr01 NC_080387.1:51420305-51420317promoter 内 1083-1095 bp + 2906 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 51423223-51427377(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 ATAAGTCAAAGAA
SmilChr04G001437 Chr04 NC_080390.1:23457451-23457463promoter 内 1035-1047 bp - 2954 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 23450394-23454497(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CTAAGTCAACTTC
SmilChr03G000187 Chr03 NC_080389.1:2022404-2022416promoter 内 959-971 bp - 3030 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 2025446-2028158(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GAAGTTGACTTAG
SmilChr01G005675 Chr01 NC_080387.1:73023069-73023081promoter 内 790-802 bp - 3199 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 73026280-73029333(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GGTATTGACTTTT
SmilChr03G003933 Chr03 NC_080389.1:58398029-58398041promoter 内 506-518 bp - 3483 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 58393342-58394546(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TGAAGTCAACCTT
SmilChr02G003228 Chr02 NC_080388.1:53556213-53556225promoter 内 223-235 bp + 3766 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 53549063-53552447(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GATTTTGACTTTC
SmilChr03G000101 Chr03 NC_080389.1:1128913-1128925promoter 内 162-174 bp - 3827 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 1122336-1125086(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AGAAGTCAACTTA
SmilChr03G001908 Chr03 NC_080389.1:26697713-26697725promoter 内 7-19 bp + 3982 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 26701707-26704144(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AGAAGTCAATGCG
SmilChr03G000892 Chr03 NC_080389.1:10198009-10198021promoter 内 3952-3964 bp + 37 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 10181406-10197972(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TGCCTTGACTTTC
SmilChr03G002630 Chr03 NC_080389.1:41755316-41755328promoter 内 3932-3944 bp + 57 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 41755385-41756770(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GAAAGTCAAATGC
SmilChr03G004218 Chr03 NC_080389.1:60762122-60762134promoter 内 3911-3923 bp - 78 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 60758887-60762044(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CCAAGTCAACTGG
SmilChr02G001553 Chr02 NC_080388.1:28834385-28834397promoter 内 3841-3853 bp - 148 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 28829532-28834237(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CAAAGTCAAAAGA
SmilChr03G002761 Chr03 NC_080389.1:43904200-43904212promoter 内 3839-3851 bp + 150 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 43902231-43904050(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AAGGTTGACTGTC
SmilChr03G000221 Chr03 NC_080389.1:2587915-2587927promoter 内 3831-3843 bp + 158 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 2585687-2587757(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TAAGTTGACTTCT
SmilChr02G002945 Chr02 NC_080388.1:49967217-49967229promoter 内 3822-3834 bp - 167 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 49966577-49967050(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CAACGTCAACGTA
SmilChr02G001490 Chr02 NC_080388.1:27868019-27868031promoter 内 3813-3825 bp + 176 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 27864450-27867843(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TGTGTTGACTTGA
SmilChr01G000491 Chr01 NC_080387.1:9971763-9971775promoter 内 3765-3777 bp + 224 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 9968021-9971539(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GAAGTTGACTTAG
SmilChr02G004337 Chr02 NC_080388.1:65618378-65618390promoter 内 3724-3736 bp + 265 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 65618655-65619728(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GAAAGTCAAATCC
SmilChr03G000931 Chr03 NC_080389.1:10626615-10626627promoter 内 3699-3711 bp + 290 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 10622838-10626325(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GAAGTTGACTTAG
SmilChr01G000751 Chr01 NC_080387.1:16598677-16598689promoter 内 3681-3693 bp + 308 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 16598997-16602119(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GTCGGTCAACGGT
SmilChr02G002938 Chr02 NC_080388.1:49890111-49890123promoter 内 3671-3683 bp - 318 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 49884668-49889793(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CAAAGTCAAAACA
SmilChr03G004268 Chr03 NC_080389.1:61156533-61156545promoter 内 3630-3642 bp + 359 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 61156904-61157998(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CCAAGTCAAAGAA
SmilChr01G005932 Chr01 NC_080387.1:75088817-75088829promoter 内 3621-3633 bp + 368 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 75089197-75093357(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GTCGGTCAACGGT
SmilChr01G004377 Chr01 NC_080387.1:61970677-61970689promoter 内 3521-3533 bp + 468 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 61971157-61977289(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GAAAGTCAAGGGA
SmilChr01G001578 Chr01 NC_080387.1:29807450-29807462promoter 内 3498-3510 bp - 491 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 29805559-29806959(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CATCGTCAACGCC
SmilChr03G000167 Chr03 NC_080389.1:1828159-1828171promoter 内 3462-3474 bp + 527 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 1828698-1834802(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TAGAGTCAACCGT
SmilChr03G000214 Chr03 NC_080389.1:2500591-2500603promoter 内 3424-3436 bp + 565 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 2496980-2500026(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GCAGTTGACTTAA
SmilChr01G002402 Chr01 NC_080387.1:41380717-41380729promoter 内 3389-3401 bp + 600 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 41381329-41382443(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CTAAGTCAACAAA
SmilChr01G005584 Chr01 NC_080387.1:72527925-72527937promoter 内 3381-3393 bp - 608 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 72528545-72529494(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GGCCTTGACTTCT
SmilChr02G000469 Chr02 NC_080388.1:6344187-6344199promoter 内 3339-3351 bp + 650 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 6341401-6343537(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TGTTTTGACTTTG
SmilChr04G000989 Chr04 NC_080390.1:13426433-13426445promoter 内 3335-3347 bp - 654 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 13425042-13425779(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TATAGTCAACACG
SmilChr02G000027 Chr02 NC_080388.1:289569-289581promoter 内 3325-3337 bp - 664 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 290245-293695(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GAAGTTGACTTAG
SmilChr02G000046 Chr02 NC_080388.1:634253-634265promoter 内 3311-3323 bp - 678 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 634943-638254(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TACGTTGACGTTG
SmilChr01G000503 Chr01 NC_080387.1:10205132-10205144promoter 内 3243-3255 bp + 746 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 10205890-10206875(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CTGAGTCAACGTG
SmilChr04G000380 Chr04 NC_080390.1:3837335-3837347promoter 内 3233-3245 bp + 756 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 3833598-3836579(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GAAGTTGACTTAG
SmilChr01G000059 Chr01 NC_080387.1:947576-947588promoter 内 3222-3234 bp + 767 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 945299-946809(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TGTTTTGACTTTG
SmilChr03G000932 Chr03 NC_080389.1:10631201-10631213promoter 内 3206-3218 bp + 783 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 10627442-10630418(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GAAGTTGACTTAG
SmilChr01G005729 Chr01 NC_080387.1:73431647-73431659promoter 内 3145-3157 bp - 844 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 73432503-73439654(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GGTATTGACTTTT
SmilChr01G006049 Chr01 NC_080387.1:76006896-76006908promoter 内 3137-3149 bp + 852 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 76005655-76006044(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GCCCTTGACTTCT
SmilChr04G001338 Chr04 NC_080390.1:21599849-21599861promoter 内 3135-3147 bp - 854 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 21600715-21605879(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 ACCGTTGACCGCA
SmilChr03G001030 Chr03 NC_080389.1:12014228-12014240promoter 内 3128-3140 bp + 861 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 12012932-12013367(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GTAGTTGACTCTG
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SmilChr02G000834 Chr02 NC_080388.1:14103763-14103775promoter 内 3066-3078 bp - 923 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 14104698-14107272(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GAAGTTGACTTAG
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SmilChr03G002357 Chr03 NC_080389.1:37186201-37186213promoter 内 2730-2742 bp + 1259 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 37183503-37184942(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GAAGTTGACTTAG
SmilChr03G000406 Chr03 NC_080389.1:4420374-4420386promoter 内 2713-2725 bp + 1276 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 4417581-4419098(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GCCCTTGACTTCT
SmilChr04G000742 Chr04 NC_080390.1:9120201-9120213promoter 内 2699-2711 bp - 1290 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 9116065-9118911(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GATAGTCAACTGG