转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G005851; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00011948-RA_Salv SmilChr01G005851 MYB XP_057789306.1 MP00055 CAGATAAGGT

可能结合的靶基因

9685 个结合位点 6638 个候选靶基因 第 93 / 133 下载 TSV

上一页 93 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G000291 Chr01 NC_080387.1:5685027-5685036promoter 内 755-764 bp - 3237 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 5688273-5690755(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ATCTTATCTG
SmilChr01G003367 Chr01 NC_080387.1:52411008-52411017promoter 内 755-764 bp + 3237 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 52403207-52407771(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ATCTTATCTG
SmilChr02G002005 Chr02 NC_080388.1:36195102-36195111promoter 内 727-736 bp + 3265 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 36188049-36191837(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ATCTTATCTG
SmilChr01G003710 Chr01 NC_080387.1:55451779-55451788promoter 内 703-712 bp - 3289 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 55455077-55458590(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AACTTATCTG
SmilChr01G005160 Chr01 NC_080387.1:69371793-69371802promoter 内 674-683 bp + 3318 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 69375120-69376802(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGAT
SmilChr01G004904 Chr01 NC_080387.1:67106388-67106397promoter 内 667-676 bp - 3325 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 67101257-67103063(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAATGG
SmilChr02G002661 Chr02 NC_080388.1:46084859-46084868promoter 内 638-647 bp + 3354 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 46070906-46081505(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AGCTTATCTA
SmilChr02G001666 Chr02 NC_080388.1:30927793-30927802promoter 内 605-614 bp - 3387 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 30931189-30935233(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ACTTTATCTG
SmilChr01G000703 Chr01 NC_080387.1:15826092-15826101promoter 内 554-563 bp - 3438 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 15821262-15822654(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGTT
SmilChr01G003566 Chr01 NC_080387.1:54247170-54247179promoter 内 546-555 bp + 3446 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 54242166-54243724(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CCATTATCTG
SmilChr01G001181 Chr01 NC_080387.1:23863816-23863825promoter 内 535-544 bp + 3457 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 23859430-23860359(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ATCTTATCTG
SmilChr01G001225 Chr01 NC_080387.1:24541054-24541063promoter 内 532-541 bp + 3460 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 24531958-24537594(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ATCTTATCTG
SmilChr02G000347 Chr02 NC_080388.1:4511196-4511205promoter 内 529-538 bp - 3463 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 4514668-4515375(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ATCTTATCTG
SmilChr02G002294 Chr02 NC_080388.1:40461152-40461161promoter 内 520-529 bp - 3472 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 40464633-40465469(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ACTTTATCTG
SmilChr02G000216 Chr02 NC_080388.1:2829210-2829219promoter 内 505-514 bp + 3487 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 2822211-2825723(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ATCTTATCTG
SmilChr02G000981 Chr02 NC_080388.1:17260287-17260296promoter 内 494-503 bp + 3498 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 17263794-17268668(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGAT
SmilChr02G000342 Chr02 NC_080388.1:4452822-4452831promoter 内 491-500 bp + 3501 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 4447221-4449321(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ATCTTATCTG
SmilChr01G000122 Chr01 NC_080387.1:2047599-2047608promoter 内 486-495 bp + 3506 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 2051114-2052985(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGAT
SmilChr01G002651 Chr01 NC_080387.1:44827607-44827616promoter 内 479-488 bp - 3513 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 44831129-44832049(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AACTTATCTG
SmilChr01G005586 Chr01 NC_080387.1:72547879-72547888promoter 内 468-477 bp + 3524 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 72551412-72553133(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGAT
SmilChr02G000290 Chr02 NC_080388.1:3683579-3683588promoter 内 450-459 bp + 3542 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 3679397-3680037(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ATCTTATCTG
SmilChr02G005532 Chr02 NC_080388.1:75373491-75373500promoter 内 438-447 bp + 3554 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 75367749-75369937(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ATCTTATCTG
SmilChr01G004906 Chr01 NC_080387.1:67106388-67106397promoter 内 413-422 bp - 3579 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 67109976-67110610(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CCATTATCTG
SmilChr02G001528 Chr02 NC_080388.1:28473332-28473341promoter 内 413-422 bp + 3579 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 28476920-28477391(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGTT
SmilChr01G004224 Chr01 NC_080387.1:60608274-60608283promoter 内 387-396 bp - 3605 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 60602872-60604669(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAAGT
SmilChr01G005812 Chr01 NC_080387.1:74132901-74132910promoter 内 387-396 bp - 3605 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 74128540-74129296(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGTT
SmilChr01G003112 Chr01 NC_080387.1:49923175-49923184promoter 内 378-387 bp + 3614 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 49926798-49930025(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGAT
SmilChr01G003091 Chr01 NC_080387.1:49721030-49721039promoter 内 359-368 bp + 3633 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 49724672-49735047(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGAT
SmilChr02G001093 Chr02 NC_080388.1:19694838-19694847promoter 内 341-350 bp + 3651 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 19698498-19699654(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGTT
SmilChr02G002553 Chr02 NC_080388.1:44421895-44421904promoter 内 325-334 bp + 3667 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 44425571-44436481(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGTT
SmilChr02G005574 Chr02 NC_080388.1:75614483-75614492promoter 内 315-324 bp - 3677 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 75608762-75610806(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGTT
SmilChr01G000710 Chr01 NC_080387.1:15855539-15855548promoter 内 310-319 bp + 3682 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 15859230-15860324(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGTT
SmilChr02G004339 Chr02 NC_080388.1:65634576-65634585promoter 内 297-306 bp - 3695 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 65638280-65639667(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ATCTTATCTG
SmilChr01G001259 Chr01 NC_080387.1:25277913-25277922promoter 内 279-288 bp + 3713 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 25281635-25284723(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGAT
SmilChr02G001640 Chr02 NC_080388.1:30460321-30460330promoter 内 248-257 bp + 3744 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 30464074-30464180(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGTT
SmilChr01G005235 Chr01 NC_080387.1:69932640-69932649promoter 内 216-225 bp - 3776 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 69928344-69928864(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGTT
SmilChr01G005880 Chr01 NC_080387.1:74735062-74735071promoter 内 190-199 bp + 3802 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 74738873-74740800(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGTT
SmilChr02G004461 Chr02 NC_080388.1:67038453-67038462promoter 内 190-199 bp - 3802 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 67033231-67034651(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGTT
SmilChr01G002801 Chr01 NC_080387.1:46502038-46502047promoter 内 152-161 bp + 3840 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 46496287-46498198(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ATCTTATCTG
SmilChr01G004412 Chr01 NC_080387.1:62239943-62239952promoter 内 137-146 bp - 3855 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 62243807-62244992(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ATCTTATCTG
SmilChr01G002883 Chr01 NC_080387.1:47448054-47448063promoter 内 129-138 bp - 3863 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 47443400-47444191(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGAT
SmilChr01G005840 Chr01 NC_080387.1:74413969-74413978promoter 内 115-124 bp - 3877 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 74405949-74410092(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAATGG
SmilChr02G004229 Chr02 NC_080388.1:64500809-64500818promoter 内 113-122 bp - 3879 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 64491924-64496930(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGAT
SmilChr01G004863 Chr01 NC_080387.1:66761685-66761694promoter 内 53-62 bp - 3939 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 66765633-66772172(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 AACTTATCTG
SmilChr02G001250 Chr02 NC_080388.1:22990874-22990883promoter 内 20-29 bp + 3972 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 22985814-22986902(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 ACTTTATCTG
SmilChr02G004658 Chr02 NC_080388.1:68993773-68993782promoter 内 411-420 bp - 3581 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 4 68989181-68990192(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGTG
SmilChr01G001621 Chr01 NC_080387.1:30308166-30308175promoter 内 2106-2115 bp + 1886 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 3 30304066-30306280(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CCTTTATCTG
SmilChr02G002843 Chr02 NC_080388.1:48574533-48574542promoter 内 3931-3940 bp + 61 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 48574603-48577977(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAAGG
SmilChr02G001151 Chr02 NC_080388.1:20970229-20970238promoter 内 3725-3734 bp + 267 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 20970505-20972712(+) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAAGCA
SmilChr01G005033 Chr01 NC_080387.1:68286433-68286442promoter 内 3659-3668 bp - 333 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 68283988-68286100(-) SMil_00011948-RA_Salv MP00055 CAGATAACGA