转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 95 / 136 下载 TSV

上一页 95 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G002601 Chr01 NC_080387.1:44197280-44197290promoter 内 1840-1850 bp + 2151 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 44194342-44195129(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACGCTGAGTA
SmilChr06G003118 Chr06 NC_080392.1:44011568-44011578promoter 内 1785-1795 bp - 2206 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 44013784-44015887(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCA
SmilChr02G002970 Chr02 NC_080388.1:50218850-50218860promoter 内 1765-1775 bp - 2226 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 50212510-50216624(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGAGGC
SmilChr05G000360 Chr05 NC_080391.1:2690793-2690803promoter 内 1729-1739 bp - 2262 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 2686892-2688531(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCACC
SmilChr02G000009 Chr02 NC_080388.1:68061-68071promoter 内 1643-1653 bp - 2348 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 70419-73585(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCTCTGAGCC
SmilChr04G002624 Chr04 NC_080390.1:41637484-41637494promoter 内 1643-1653 bp - 2348 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 41639842-41642949(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGTGCTGAGCA
SmilChr04G002026 Chr04 NC_080390.1:32933352-32933362promoter 内 1610-1620 bp - 2381 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 32928238-32930971(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCGC
SmilChr03G001522 Chr03 NC_080389.1:18660963-18660973promoter 内 1607-1617 bp - 2384 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 18657009-18658579(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCTG
SmilChr02G005376 Chr02 NC_080388.1:74438635-74438645promoter 内 1590-1600 bp + 2401 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 74431320-74436234(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCTCTGAGCC
SmilChr02G004106 Chr02 NC_080388.1:63363340-63363350promoter 内 1532-1542 bp - 2459 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 63365809-63368238(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCA
SmilChr02G005378 Chr02 NC_080388.1:74449509-74449519promoter 内 1529-1539 bp + 2462 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 74451981-74457085(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGAGGC
SmilChr04G000635 Chr04 NC_080390.1:7217103-7217113promoter 内 1512-1522 bp + 2479 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 7211092-7214624(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGTGCTGAGCA
SmilChr04G002668 Chr04 NC_080390.1:42062621-42062631promoter 内 1501-1511 bp - 2490 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 42065121-42068251(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGTGCTGAGCA
SmilChr01G000335 Chr01 NC_080387.1:6827860-6827870promoter 内 1487-1497 bp + 2504 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 6830374-6831466(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGAGGC
SmilChr07G000039 Chr07 NC_080393.1:167417-167427promoter 内 1453-1463 bp + 2538 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 169965-173166(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCACC
SmilChr04G002585 Chr04 NC_080390.1:41262122-41262132promoter 内 1450-1460 bp + 2541 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 41264673-41276482(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCGAA
SmilChr05G000832 Chr05 NC_080391.1:6545073-6545083promoter 内 1446-1456 bp + 2545 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 6541576-6542528(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACGCTGAGTA
SmilChr04G000010 Chr04 NC_080390.1:167138-167148promoter 内 1410-1420 bp - 2581 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 154530-164557(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGAGGC
SmilChr06G002461 Chr06 NC_080392.1:35425632-35425642promoter 内 1393-1403 bp + 2598 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 35428240-35431177(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCGAA
SmilChr02G005000 Chr02 NC_080388.1:71811589-71811599promoter 内 1388-1398 bp - 2603 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 71814202-71816017(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACGCTGAGAC
SmilChr01G003483 Chr01 NC_080387.1:53376721-53376731promoter 内 1332-1342 bp + 2659 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 53379390-53379461(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCACC
SmilChr05G001058 Chr05 NC_080391.1:8753509-8753519promoter 内 1310-1320 bp + 2681 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 8750757-8750828(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGAG
SmilChr02G002721 Chr02 NC_080388.1:47056944-47056954promoter 内 1196-1206 bp - 2795 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 47051765-47054149(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TACTCAGCGGT
SmilChr01G003417 Chr01 NC_080387.1:52800596-52800606promoter 内 1177-1187 bp + 2814 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 52803420-52803491(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCACC
SmilChr02G002349 Chr02 NC_080388.1:41260643-41260653promoter 内 1176-1186 bp - 2815 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 41263468-41265907(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCA
SmilChr05G000455 Chr05 NC_080391.1:3449451-3449461promoter 内 1097-1107 bp + 2894 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 3445812-3446557(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CAGGCTGAGCT
SmilChr02G000008 Chr02 NC_080388.1:68061-68071promoter 内 1011-1021 bp - 2980 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 63884-65081(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGAGGC
SmilChr05G001057 Chr05 NC_080391.1:8753509-8753519promoter 内 1009-1019 bp + 2982 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 8749200-8750527(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGAG
SmilChr07G003959 Chr07 NC_080393.1:50231591-50231601promoter 内 987-997 bp + 3004 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 50234605-50241341(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TACTCAGCGGT
SmilChr08G003704 Chr08 NC_080394.1:41542261-41542271promoter 内 974-984 bp - 3017 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 41537865-41539244(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGAGGC
SmilChr01G000152 Chr01 NC_080387.1:2585954-2585964promoter 内 936-946 bp + 3055 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 2589019-2591200(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCGAA
SmilChr06G000269 Chr06 NC_080392.1:1821057-1821067promoter 内 894-904 bp - 3097 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 1824164-1824278(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CAGGCTGAGCT
SmilChr07G002579 Chr07 NC_080393.1:24688608-24688618promoter 内 892-902 bp + 3099 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 24691717-24692485(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCTCAGCGCA
SmilChr08G002563 Chr08 NC_080394.1:24969449-24969459promoter 内 872-882 bp - 3119 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 24972578-24979185(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGAG
SmilChr05G001059 Chr05 NC_080391.1:8753509-8753519promoter 内 866-876 bp + 3125 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 8756644-8762198(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCTCAGCGCA
SmilChr06G001314 Chr06 NC_080392.1:13637742-13637752promoter 内 838-848 bp + 3153 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 13633574-13634589(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGTGCTGAGCA
SmilChr04G002304 Chr04 NC_080390.1:37318768-37318778promoter 内 775-785 bp + 3216 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 37309996-37315552(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CAGGCTGAGCT
SmilChr01G002828 Chr01 NC_080387.1:46879768-46879778promoter 内 732-742 bp + 3259 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 46873713-46876509(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGAG
SmilChr05G003874 Chr05 NC_080391.1:52331848-52331858promoter 内 609-619 bp + 3382 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 52335240-52337644(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCTG
SmilChr04G001140 Chr04 NC_080390.1:16803065-16803075promoter 内 600-610 bp - 3391 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 16806466-16807584(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCA
SmilChr08G003796 Chr08 NC_080394.1:43856401-43856411promoter 内 554-564 bp - 3437 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 43859848-43860507(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCA
SmilChr05G000623 Chr05 NC_080391.1:4702811-4702821promoter 内 533-543 bp - 3458 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 4706279-4715947(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCA
SmilChr08G001381 Chr08 NC_080394.1:11018540-11018550promoter 内 522-532 bp + 3469 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 11005805-11015071(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CAGGCTGAGCT
SmilChr02G004329 Chr02 NC_080388.1:65564512-65564522promoter 内 477-487 bp + 3514 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 65568036-65572115(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCGC
SmilChr05G000381 Chr05 NC_080391.1:2867854-2867864promoter 内 395-405 bp - 3596 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 2871460-2875687(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGAG
SmilChr01G005097 Chr01 NC_080387.1:68796576-68796586promoter 内 305-315 bp - 3686 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 68800272-68802269(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCA
SmilChr06G001897 Chr06 NC_080392.1:22737692-22737702promoter 内 261-271 bp + 3730 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 22741432-22742247(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCACC
SmilChr05G001397 Chr05 NC_080391.1:12541928-12541938promoter 内 255-265 bp + 3736 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 12545674-12547515(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCGC
SmilChr02G005380 Chr02 NC_080388.1:74484300-74484310promoter 内 226-236 bp + 3765 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 74478315-74480535(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TTCGCTGAGCG
SmilChr02G005377 Chr02 NC_080388.1:74449509-74449519promoter 内 100-110 bp + 3891 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 74441904-74445618(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCTCTGAGCC