转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因,每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G004607; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00002089-RA_Salv SmilChr02G004607 C2H2 XP_057791470.1 MP00608 AAAAACAGAGCA

可能结合的靶基因

9817 个结合位点 6398 个候选靶基因 第 98 / 128 下载 TSV

上一页 98 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G003105 Chr02 NC_080388.1:51978377-51978388promoter 内 1378-1389 bp - 2612 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 51981000-51983045(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GGCTCTGTTCAT
SmilChr02G005071 Chr02 NC_080388.1:72372306-72372317promoter 内 1361-1372 bp + 2629 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 72374946-72376675(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAAAACA
SmilChr01G006009 Chr01 NC_080387.1:75652811-75652822promoter 内 1358-1369 bp + 2632 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 75647259-75650179(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGTTTTGTTTTT
SmilChr02G001397 Chr02 NC_080388.1:26492054-26492065promoter 内 1341-1352 bp + 2649 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 26494714-26497952(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAAAACA
SmilChr03G001748 Chr03 NC_080389.1:23725324-23725335promoter 内 1330-1341 bp - 2660 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 23719198-23722664(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAACAGAGAT
SmilChr02G003234 Chr02 NC_080388.1:53599217-53599228promoter 内 1318-1329 bp - 2672 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 53601900-53605883(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGTTTTGTTTTT
SmilChr02G004270 Chr02 NC_080388.1:64914670-64914681promoter 内 1292-1303 bp + 2698 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 64907854-64911972(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGTTTTGTTTTT
SmilChr01G000242 Chr01 NC_080387.1:4507975-4507986promoter 内 1284-1295 bp - 2706 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 4501786-4505269(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAACAGAGAT
SmilChr01G003952 Chr01 NC_080387.1:57894125-57894136promoter 内 1251-1262 bp + 2739 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 57896875-57898038(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAAAACA
SmilChr01G003099 Chr01 NC_080387.1:49794956-49794967promoter 内 1244-1255 bp - 2746 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 49797713-49799255(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGTTTTGTTTTT
SmilChr01G002828 Chr01 NC_080387.1:46879261-46879272promoter 内 1238-1249 bp + 2752 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 46873713-46876509(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGTTCTGTTTAT
SmilChr01G001721 Chr01 NC_080387.1:31682473-31682484promoter 内 1211-1222 bp + 2779 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 31685263-31686471(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAAAACA
SmilChr02G003761 Chr02 NC_080388.1:59287077-59287088promoter 内 1209-1220 bp + 2781 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 59289869-59293995(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAAAACA
SmilChr01G003067 Chr01 NC_080387.1:49523097-49523108promoter 内 1201-1212 bp + 2789 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 49515952-49520308(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGTTTTGTTTTT
SmilChr03G001573 Chr03 NC_080389.1:19868953-19868964promoter 内 1200-1211 bp + 2790 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 19863081-19866163(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGTTTTGTTTTT
SmilChr02G003198 Chr02 NC_080388.1:53144192-53144203promoter 内 1180-1191 bp + 2810 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 53138855-53141382(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGTTTTGTTTTT
SmilChr01G004002 Chr01 NC_080387.1:58409786-58409797promoter 内 1177-1188 bp + 2813 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 58412610-58415919(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAAAACA
SmilChr01G000040 Chr01 NC_080387.1:641141-641152promoter 内 1171-1182 bp + 2819 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 635623-638322(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGTTTTGTTTTT
SmilChr01G004277 Chr01 NC_080387.1:61001517-61001528promoter 内 1119-1130 bp + 2871 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 61004399-61005116(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAAAACA
SmilChr01G004325 Chr01 NC_080387.1:61410714-61410725promoter 内 1115-1126 bp + 2875 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 61404681-61407839(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGTTTTGTTTTT
SmilChr02G003424 Chr02 NC_080388.1:55442542-55442553promoter 内 1071-1082 bp + 2919 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 55445472-55451947(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 ATGAACAGAGCC
SmilChr02G003303 Chr02 NC_080388.1:54306555-54306566promoter 内 1056-1067 bp + 2934 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 54300201-54303621(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGTTTTGTTTTT
SmilChr02G003423 Chr02 NC_080388.1:55442542-55442553promoter 内 1054-1065 bp + 2936 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 55436345-55439606(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GGCTCTGTTCAT
SmilChr01G004385 Chr01 NC_080387.1:62016074-62016085promoter 内 1048-1059 bp + 2942 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 62019027-62019098(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAAAACA
SmilChr02G000676 Chr02 NC_080388.1:10559692-10559703promoter 内 1025-1036 bp + 2965 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 10554034-10556727(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 ATCTCTGTTCCC
SmilChr01G001278 Chr01 NC_080387.1:25580780-25580791promoter 内 1002-1013 bp + 2988 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 25577118-25577792(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGTTTTGTTTTT
SmilChr02G001893 Chr02 NC_080388.1:34232761-34232772promoter 内 967-978 bp - 3023 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 34235795-34239338(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGTTTTGTTTTT
SmilChr01G002981 Chr01 NC_080387.1:48739438-48739449promoter 内 949-960 bp + 3041 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 48742490-48744446(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAAAACA
SmilChr01G000045 Chr01 NC_080387.1:723939-723950promoter 内 943-954 bp + 3047 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 719914-720892(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGTTTTGTTTTT
SmilChr01G003200 Chr01 NC_080387.1:50791650-50791661promoter 内 943-954 bp - 3047 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 50786783-50788603(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 ATGAACAGAGTA
SmilChr01G003918 Chr01 NC_080387.1:57452074-57452085promoter 内 899-910 bp + 3091 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 57447110-57448983(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGTTTTGTTTTT
SmilChr01G003746 Chr01 NC_080387.1:55791976-55791987promoter 内 826-837 bp + 3164 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 55786538-55788812(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGTTTTGTTTTT
SmilChr02G005293 Chr02 NC_080388.1:73919153-73919164promoter 内 790-801 bp + 3200 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 73915211-73915953(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGTTTTGTTTTT
SmilChr02G002249 Chr02 NC_080388.1:39932911-39932922promoter 内 727-738 bp + 3263 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 39928253-39929648(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGTTTTGTTTTT
SmilChr01G004744 Chr01 NC_080387.1:65614682-65614693promoter 内 664-675 bp - 3326 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 65618019-65618738(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGTTTTGTTTTT
SmilChr02G005519 Chr02 NC_080388.1:75295469-75295480promoter 内 633-644 bp - 3357 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 75290995-75292112(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 ATGAACAGAGTA
SmilChr03G001835 Chr03 NC_080389.1:25184317-25184328promoter 内 612-623 bp - 3378 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 25179806-25180939(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CAGAACAGAGAT
SmilChr02G005307 Chr02 NC_080388.1:73991078-73991089promoter 内 592-603 bp + 3398 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 73985367-73987680(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGTTTTGTTTTT
SmilChr01G003303 Chr01 NC_080387.1:51722462-51722473promoter 内 591-602 bp + 3399 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 51711980-51719063(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGTTTTGTTTTT
SmilChr02G004441 Chr02 NC_080388.1:66780986-66780997promoter 内 588-599 bp + 3402 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 66784399-66786844(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAAAACA
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SmilChr01G002265 Chr01 NC_080387.1:39440756-39440767promoter 内 469-480 bp - 3521 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 39444288-39446912(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGTTTTGTTTTT
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SmilChr01G003362 Chr01 NC_080387.1:52363529-52363540promoter 内 281-292 bp - 3709 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 52367249-52373590(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGTTTTGTTTTT