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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000260; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00013647-RA_Salv SmilChr05G000260 bZIP XP_057763683.1 MP00040 TGCTGACGTGGC

可能结合的靶基因

9919 个结合位点 6920 个候选靶基因 第 98 / 139 下载 TSV

上一页 98 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G004798 Chr02 NC_080388.1:70178558-70178569promoter 内 2398-2409 bp - 1592 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 70173582-70176966(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTTCGACGTGGG
SmilChr04G000002 Chr04 NC_080390.1:64650-64661promoter 内 2360-2371 bp - 1630 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 61644-63020(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCACGACGTGGA
SmilChr03G003200 Chr03 NC_080389.1:49539349-49539360promoter 内 2275-2286 bp + 1715 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 49541075-49543951(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCTCGACGTGGT
SmilChr04G000960 Chr04 NC_080390.1:12761926-12761937promoter 内 2240-2251 bp - 1750 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 12757721-12760176(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCACGACGTGGT
SmilChr04G003139 Chr04 NC_080390.1:47982551-47982562promoter 内 2137-2148 bp + 1853 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 47979514-47980698(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCGATT
SmilChr03G003155 Chr03 NC_080389.1:49523803-49523814promoter 内 2079-2090 bp + 1911 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 48912586-49521892(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCGCAA
SmilChr02G001847 Chr02 NC_080388.1:33699352-33699363promoter 内 2024-2035 bp - 1966 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 33701329-33702519(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCGATT
SmilChr02G001937 Chr02 NC_080388.1:34777317-34777328promoter 内 2005-2016 bp + 1985 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 34774139-34775332(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCGATT
SmilChr01G002902 Chr01 NC_080387.1:47702012-47702023promoter 内 2000-2011 bp + 1990 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 47698916-47700022(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTCACGTCAACT
SmilChr01G003690 Chr01 NC_080387.1:55268586-55268597promoter 内 1997-2008 bp - 1993 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 55270590-55273486(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCGTTT
SmilChr03G002035 Chr03 NC_080389.1:30711262-30711273promoter 内 1976-1987 bp + 2014 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 30713287-30715139(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGGTGACGTGAT
SmilChr01G003708 Chr01 NC_080387.1:55432293-55432304promoter 内 1886-1897 bp - 2104 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 55434408-55435001(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCGATT
SmilChr01G005070 Chr01 NC_080387.1:68587584-68587595promoter 内 1775-1786 bp - 2215 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 68583423-68585369(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGGTGACGTGAT
SmilChr04G003140 Chr04 NC_080390.1:47982551-47982562promoter 内 1754-1765 bp + 2236 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 47984798-47985687(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AATCGACGTGGC
SmilChr01G000307 Chr01 NC_080387.1:6001992-6002003promoter 内 1753-1764 bp + 2237 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 5996885-5999755(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTCACGTCATCA
SmilChr02G002437 Chr02 NC_080388.1:42532947-42532958promoter 内 1743-1754 bp + 2247 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 42527911-42530700(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCCGTC
SmilChr03G002288 Chr03 NC_080389.1:36069034-36069045promoter 内 1662-1673 bp - 2328 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 36071373-36071968(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCGAAA
SmilChr01G000310 Chr01 NC_080387.1:6010901-6010912promoter 内 1426-1437 bp + 2564 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 6013476-6058274(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGAG
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SmilChr01G005527 Chr01 NC_080387.1:72144364-72144375promoter 内 1316-1327 bp - 2674 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 72138861-72141690(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGGTGACGTGAT
SmilChr01G005071 Chr01 NC_080387.1:68587584-68587595promoter 内 1276-1287 bp - 2714 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 68590309-68591133(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ATCACGTCACCA
SmilChr02G004827 Chr02 NC_080388.1:70372338-70372349promoter 内 1250-1261 bp - 2740 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 70375089-70379544(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTCACGTCATCA
SmilChr01G003407 Chr01 NC_080387.1:52730124-52730135promoter 内 1100-1111 bp - 2890 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 52733025-52736021(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCGAAT
SmilChr03G004057 Chr03 NC_080389.1:59519026-59519037promoter 内 1090-1101 bp - 2900 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 59521937-59522753(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCCGTC
SmilChr04G001661 Chr04 NC_080390.1:27585205-27585216promoter 内 799-810 bp + 3191 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 27588407-27589223(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCTCGACGTGGT
SmilChr03G002945 Chr03 NC_080389.1:46197537-46197548promoter 内 603-614 bp - 3387 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 46191717-46194150(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AATCGACGTGGC
SmilChr04G001816 Chr04 NC_080390.1:29647094-29647105promoter 内 537-548 bp + 3453 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 29650558-29652353(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGTTGACGTGAG
SmilChr03G004413 Chr03 NC_080389.1:62301548-62301559promoter 内 528-539 bp - 3462 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 62305021-62305953(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCCGTC
SmilChr01G004031 Chr01 NC_080387.1:58712855-58712866promoter 内 453-464 bp + 3537 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 58716403-58719699(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GACGGACGTGGG
SmilChr01G005557 Chr01 NC_080387.1:72396868-72396879promoter 内 218-229 bp - 3772 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 72390614-72393096(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGGTGACGTGAT
SmilChr01G000527 Chr01 NC_080387.1:10751821-10751832promoter 内 167-178 bp - 3823 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 10744899-10747998(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGATGACGTGAC
SmilChr02G002916 Chr02 NC_080388.1:49461746-49461757promoter 内 123-134 bp - 3867 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 49465624-49468255(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTCACGTCATCA
SmilChr01G004990 Chr01 NC_080387.1:67931215-67931226promoter 内 4-15 bp - 3986 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 67924853-67927229(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AAACGACGTGGC
SmilChr02G001868 Chr02 NC_080388.1:33961350-33961361promoter 内 2977-2988 bp + 1013 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 33959567-33960337(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCTACGTCAGGG
SmilChr02G004637 Chr02 NC_080388.1:68832131-68832142promoter 内 2911-2922 bp + 1079 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 68830047-68831052(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCCCGTCAGCA
SmilChr01G000822 Chr01 NC_080387.1:17749815-17749826promoter 内 2463-2474 bp + 1527 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 17751353-17758891(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGCGGACGTGGT
SmilChr02G001366 Chr02 NC_080388.1:25736636-25736647promoter 内 510-521 bp - 3480 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 25740127-25740813(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCCCGTCAGCA
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SmilChr01G006015 Chr01 NC_080387.1:75741824-75741835promoter 内 3412-3423 bp + 578 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 75742413-75743410(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCATGACGTGCC
SmilChr04G003119 Chr04 NC_080390.1:47756200-47756211promoter 内 3380-3391 bp + 610 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 47756821-47758790(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ATCAGACGTGGT
SmilChr03G004276 Chr03 NC_080389.1:61211091-61211102promoter 内 3373-3384 bp - 617 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 61207176-61210474(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCTGACGGGGA
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SmilChr01G005988 Chr01 NC_080387.1:75503469-75503480promoter 内 3078-3089 bp - 912 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 75499257-75502557(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTGTGACGTGCC
SmilChr03G002556 Chr03 NC_080389.1:40737435-40737446promoter 内 2936-2947 bp - 1054 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 40738500-40741310(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGCACGTCATGG
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SmilChr01G005997 Chr01 NC_080387.1:75557849-75557860promoter 内 2287-2298 bp - 1703 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 75552914-75556146(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTGTGACGTGCC