转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 99 / 143 下载 TSV

上一页 99 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G003855 Chr02 NC_080388.1:60314960-60314971promoter 内 3506-3517 bp + 484 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 60305438-60314476(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTTAA
SmilChr05G001830 Chr05 NC_080391.1:18340145-18340156promoter 内 3441-3452 bp + 549 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 18340705-18341505(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTCAT
SmilChr02G004454 Chr02 NC_080388.1:66938741-66938752promoter 内 3306-3317 bp - 684 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 66937617-66938057(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTCAT
SmilChr02G004526 Chr02 NC_080388.1:67858363-67858374promoter 内 3273-3284 bp + 717 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 67842087-67857646(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTTAC
SmilChr01G001014 Chr01 NC_080387.1:21312708-21312719promoter 内 3262-3273 bp + 728 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 21313447-21314616(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTAACAGCTGGG
SmilChr04G001087 Chr04 NC_080390.1:15598293-15598304promoter 内 3245-3256 bp - 745 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 15599049-15601502(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTTCAA
SmilChr07G001585 Chr07 NC_080393.1:13096976-13096987promoter 内 3118-3129 bp - 872 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 13097859-13099826(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTTCAA
SmilChr06G001084 Chr06 NC_080392.1:10840773-10840784promoter 内 3070-3081 bp + 920 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 10841704-10842699(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGCT
SmilChr02G002107 Chr02 NC_080388.1:37773785-37773796promoter 内 2839-2850 bp - 1151 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 37774947-37777949(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTTCAA
SmilChr04G000948 Chr04 NC_080390.1:12542381-12542392promoter 内 2820-2831 bp + 1170 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 12539771-12541211(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTTCAA
SmilChr03G000902 Chr03 NC_080389.1:10326010-10326021promoter 内 2803-2814 bp - 1187 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 10327208-10331622(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGAGCTGTCTT
SmilChr01G005647 Chr01 NC_080387.1:72874126-72874137promoter 内 2795-2806 bp - 1195 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 72869032-72872931(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CGTCCAGCTGTG
SmilChr06G000690 Chr06 NC_080392.1:6116823-6116834promoter 内 2768-2779 bp - 1222 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 6118056-6123423(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTTCAA
SmilChr07G003462 Chr07 NC_080393.1:38647863-38647874promoter 内 2697-2708 bp + 1293 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 38649167-38652304(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CGTCCAGCTGTG
SmilChr02G001233 Chr02 NC_080388.1:22635308-22635319promoter 内 2606-2617 bp - 1384 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 22633016-22633924(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAAAGCTGTA
SmilChr02G000184 Chr02 NC_080388.1:2324401-2324412promoter 内 2605-2616 bp + 1385 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 2325797-2336714(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTAACAGCTGGG
SmilChr07G004034 Chr07 NC_080393.1:51517113-51517124promoter 内 2594-2605 bp + 1396 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 51512828-51515717(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTTCAA
SmilChr07G002332 Chr07 NC_080393.1:21624626-21624637promoter 内 2555-2566 bp + 1435 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 21626072-21627482(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTAACAGCTGGG
SmilChr05G003197 Chr05 NC_080391.1:40871205-40871216promoter 内 2541-2552 bp + 1449 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 40866089-40869756(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTTAA
SmilChr05G003199 Chr05 NC_080391.1:40906537-40906548promoter 内 2467-2478 bp + 1523 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 40897764-40905014(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTTAA
SmilChr03G003338 Chr03 NC_080389.1:51669330-51669341promoter 内 2466-2477 bp + 1524 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 51670865-51672168(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTCAT
SmilChr04G002244 Chr04 NC_080390.1:36225688-36225699promoter 内 2385-2396 bp - 1605 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 36227304-36228976(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTTCAA
SmilChr01G006165 Chr01 NC_080387.1:77074582-77074593promoter 内 2285-2296 bp + 1705 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 77071735-77072877(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTTAA
SmilChr02G000035 Chr02 NC_080388.1:422709-422720promoter 内 2161-2172 bp + 1829 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 424549-426529(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTAACAGCTGTG
SmilChr08G002937 Chr08 NC_080394.1:29385765-29385776promoter 内 2157-2168 bp - 1833 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 29383073-29383932(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTCAT
SmilChr05G000586 Chr05 NC_080391.1:4430025-4430036promoter 内 2153-2164 bp + 1837 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 4427178-4428188(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTTCAA
SmilChr03G001206 Chr03 NC_080389.1:13913806-13913817promoter 内 2084-2095 bp + 1906 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 13915723-13917553(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGCG
SmilChr05G002748 Chr05 NC_080391.1:31691664-31691675promoter 内 2055-2066 bp - 1935 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 31693610-31695595(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTTCAA
SmilChr02G002580 Chr02 NC_080388.1:44836529-44836540promoter 内 2042-2053 bp + 1948 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 44838488-44841085(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAAAGCTGTA
SmilChr01G000806 Chr01 NC_080387.1:17436837-17436848promoter 内 1922-1933 bp + 2068 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 17431542-17434769(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTTCAA
SmilChr01G005995 Chr01 NC_080387.1:75548795-75548806promoter 内 1836-1847 bp - 2154 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 75543753-75546641(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAAAGCTGTA
SmilChr02G003385 Chr02 NC_080388.1:54964554-54964565promoter 内 1821-1832 bp + 2169 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 54958479-54962385(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CGCAGCTGTCAT
SmilChr07G000009 Chr07 NC_080393.1:41557-41568promoter 内 1781-1792 bp + 2209 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 32209-39348(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGAGCTGTCTT
SmilChr06G000612 Chr06 NC_080392.1:5283344-5283355promoter 内 1686-1697 bp - 2304 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 5280207-5281040(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTCAT
SmilChr01G000723 Chr01 NC_080387.1:16171296-16171307promoter 内 1597-1608 bp + 2393 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 16168191-16168903(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTTAA
SmilChr08G000504 Chr08 NC_080394.1:3688435-3688446promoter 内 1499-1510 bp + 2491 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 3682367-3685944(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTTAA
SmilChr01G000407 Chr01 NC_080387.1:8297523-8297534promoter 内 1340-1351 bp + 2650 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 8300184-8301169(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTAACAGCTGGG
SmilChr08G000644 Chr08 NC_080394.1:4797199-4797210promoter 内 1298-1309 bp - 2692 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 4799902-4803971(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTTAA
SmilChr05G003231 Chr05 NC_080391.1:41464351-41464362promoter 内 1289-1300 bp - 2701 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 41467063-41471994(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTTAA
SmilChr03G002758 Chr03 NC_080389.1:43842940-43842951promoter 内 1241-1252 bp - 2749 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 43821928-43840191(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAAAGCTGTA
SmilChr02G000661 Chr02 NC_080388.1:10131229-10131240promoter 内 1148-1159 bp + 2842 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 10115954-10128387(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTTCAA
SmilChr01G001377 Chr01 NC_080387.1:27137467-27137478promoter 内 1086-1097 bp - 2904 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 27133255-27134563(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CGTCCAGCTGTG
SmilChr02G005111 Chr02 NC_080388.1:72628896-72628907promoter 内 1075-1086 bp - 2915 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 72631822-72632954(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CGCAGCTGTCAT
SmilChr04G002527 Chr04 NC_080390.1:40346675-40346686promoter 内 1062-1073 bp - 2928 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 40343244-40343747(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTAACAGCTGGG
SmilChr04G001550 Chr04 NC_080390.1:25641510-25641521promoter 内 988-999 bp - 3002 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 25644523-25644629(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTTCAA
SmilChr07G001836 Chr07 NC_080393.1:15834627-15834638promoter 内 899-910 bp - 3091 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 15824506-15831536(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTAACAGCTGGG
SmilChr02G000181 Chr02 NC_080388.1:2314123-2314134promoter 内 865-876 bp + 3125 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 2303750-2310998(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTTCAA
SmilChr04G002333 Chr04 NC_080390.1:37639280-37639291promoter 内 862-873 bp - 3128 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 37632740-37636152(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTCAT
SmilChr05G000585 Chr05 NC_080391.1:4430025-4430036promoter 内 727-738 bp + 3263 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 4425033-4426762(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTTCAA
SmilChr05G000773 Chr05 NC_080391.1:6025579-6025590promoter 内 725-736 bp + 3265 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 6028855-6032489(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAAAGCTGTA