转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G003119; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00008313-RA_Salv SmilChr04G003119 bZIP XP_057809542.1 MP00039 TGACGTGGCA

可能结合的靶基因

9936 个结合位点 6610 个候选靶基因 第 10 / 133 下载 TSV

上一页 10 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G002104 Chr03 NC_080389.1:32763886-32763895promoter 内 565-574 bp + 3427 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 2 32760324-32760459(-) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 TGCCACGTGG
SmilChr01G002598 Chr01 NC_080387.1:44157824-44157833promoter 内 532-541 bp - 3460 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 2 44146211-44154364(-) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 CCACGTGGCA
SmilChr01G000458 Chr01 NC_080387.1:9353407-9353416promoter 内 484-493 bp - 3508 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 2 9347293-9349899(-) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 CCACGTGGCA
SmilChr03G003040 Chr03 NC_080389.1:47294053-47294062promoter 内 442-451 bp + 3550 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 2 47297612-47299289(+) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 CCACGTGGCA
SmilChr02G003884 Chr02 NC_080388.1:60917632-60917641promoter 内 328-337 bp - 3664 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 2 60908928-60913968(-) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 CCACGTGGCA
SmilChr04G001084 Chr04 NC_080390.1:15555323-15555332promoter 内 283-292 bp + 3709 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 2 15544631-15551614(-) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 TGCCACGTGG
SmilChr01G000179 Chr01 NC_080387.1:2944730-2944739promoter 内 215-224 bp + 3777 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 2 2940477-2940953(-) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 TGCCACGTGG
SmilChr02G003404 Chr02 NC_080388.1:55219251-55219260promoter 内 24-33 bp - 3968 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 2 55212150-55215283(-) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 CCACGTGGCA
SmilChr01G004149 Chr01 NC_080387.1:60023444-60023453promoter 内 3944-3953 bp + 48 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 60016671-60023396(-) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 TGCCACGTGG
SmilChr01G001916 Chr01 NC_080387.1:34307207-34307216promoter 内 3922-3931 bp - 70 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 34307286-34312615(+) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 TGCCACGTGG
SmilChr01G004105 Chr01 NC_080387.1:59555971-59555980promoter 内 3913-3922 bp - 79 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 59556059-59559717(+) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 TGCCACGTGG
SmilChr02G005269 Chr02 NC_080388.1:73776892-73776901promoter 内 3886-3895 bp - 106 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 73772664-73776786(-) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 CCACGTGGCA
SmilChr03G002330 Chr03 NC_080389.1:36662050-36662059promoter 内 3883-3892 bp + 109 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 36662168-36662685(+) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 CCACGTGGCA
SmilChr01G005422 Chr01 NC_080387.1:71413956-71413965promoter 内 3836-3845 bp + 156 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 71407830-71413800(-) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 TGCCACGTGG
SmilChr02G003207 Chr02 NC_080388.1:53236157-53236166promoter 内 3728-3737 bp - 264 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 53233294-53235893(-) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 CCACGTGGCA
SmilChr02G002919 Chr02 NC_080388.1:49490298-49490307promoter 内 3652-3661 bp + 340 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 49490647-49497851(+) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 CCACGTGGCA
SmilChr02G001425 Chr02 NC_080388.1:26914648-26914657promoter 内 3358-3367 bp + 634 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 26915291-26916539(+) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 CCACGTGGCA
SmilChr02G001040 Chr02 NC_080388.1:18489171-18489180promoter 内 3336-3345 bp + 656 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 18489836-18489909(+) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 CCACGTGGCA
SmilChr01G006076 Chr01 NC_080387.1:76210905-76210914promoter 内 3243-3252 bp + 749 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 76211663-76212899(+) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 CCACGTGGCA
SmilChr02G004531 Chr02 NC_080388.1:67885998-67886007promoter 内 3200-3209 bp + 792 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 67880377-67885206(-) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 TGCCACGTGG
SmilChr02G003708 Chr02 NC_080388.1:58637798-58637807promoter 内 2904-2913 bp - 1088 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 58634544-58636710(-) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 CCACGTGGCA
SmilChr02G000252 Chr02 NC_080388.1:3249892-3249901promoter 内 2699-2708 bp - 1293 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 3246865-3248599(-) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 CCACGTGGCA
SmilChr01G000637 Chr01 NC_080387.1:14311359-14311368promoter 内 2618-2627 bp + 1374 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 14312742-14314457(+) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 CCACGTGGCA
SmilChr02G002597 Chr02 NC_080388.1:45116246-45116255promoter 内 2573-2582 bp - 1419 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 45112709-45114827(-) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 CCACGTGGCA
SmilChr01G002534 Chr01 NC_080387.1:43362149-43362158promoter 内 2396-2405 bp + 1596 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 43343102-43360553(-) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 TGCCACGTGG
SmilChr03G001872 Chr03 NC_080389.1:25932126-25932135promoter 内 2321-2330 bp - 1671 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 25933806-25940905(+) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 TGCCACGTGG
SmilChr03G001642 Chr03 NC_080389.1:21233267-21233276promoter 内 2118-2127 bp - 1874 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 21235150-21239301(+) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 TGCCACGTGG
SmilChr02G005558 Chr02 NC_080388.1:75538231-75538240promoter 内 2084-2093 bp - 1908 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 75534486-75536323(-) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 CCACGTGGCA
SmilChr02G001041 Chr02 NC_080388.1:18489171-18489180promoter 内 1952-1961 bp + 2040 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 18491220-18493750(+) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 CCACGTGGCA
SmilChr02G000198 Chr02 NC_080388.1:2536144-2536153promoter 内 1933-1942 bp - 2059 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 2517107-2534085(-) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 CCACGTGGCA
SmilChr03G002931 Chr03 NC_080389.1:46056748-46056757promoter 内 1884-1893 bp - 2108 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 46058865-46062019(+) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 TGCCACGTGG
SmilChr03G001716 Chr03 NC_080389.1:23010826-23010835promoter 内 1804-1813 bp + 2188 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 23006394-23008638(-) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 TGCCACGTGG
SmilChr02G000786 Chr02 NC_080388.1:12920507-12920516promoter 内 1794-1803 bp - 2198 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 12913989-12918309(-) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 CCACGTGGCA
SmilChr01G002196 Chr01 NC_080387.1:38114374-38114383promoter 内 1760-1769 bp + 2232 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 38110169-38112142(-) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 TGCCACGTGG
SmilChr04G001614 Chr04 NC_080390.1:26889191-26889200promoter 内 1701-1710 bp - 2291 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 26862887-26886900(-) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 CCACGTGGCA
SmilChr02G002795 Chr02 NC_080388.1:48034912-48034921promoter 内 1680-1689 bp - 2312 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 48037233-48039898(+) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 TGCCACGTGG
SmilChr02G005159 Chr02 NC_080388.1:72940959-72940968promoter 内 1670-1679 bp + 2322 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 72943290-72944833(+) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 CCACGTGGCA
SmilChr01G006077 Chr01 NC_080387.1:76210905-76210914promoter 内 1621-1630 bp + 2371 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 76213285-76214871(+) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 CCACGTGGCA
SmilChr03G001583 Chr03 NC_080389.1:20040467-20040476promoter 内 1607-1616 bp - 2385 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 20028623-20038082(-) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 CCACGTGGCA
SmilChr03G002527 Chr03 NC_080389.1:40308311-40308320promoter 内 1583-1592 bp + 2409 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 40310729-40315118(+) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 CCACGTGGCA
SmilChr03G001584 Chr03 NC_080389.1:20040467-20040476promoter 内 1518-1527 bp - 2474 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 20042950-20045827(+) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 TGCCACGTGG
SmilChr02G002484 Chr02 NC_080388.1:43222385-43222394promoter 内 1304-1313 bp - 2688 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 43225082-43227258(+) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 TGCCACGTGG
SmilChr03G004569 Chr03 NC_080389.1:63606756-63606765promoter 内 1116-1125 bp - 2876 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 63602340-63603880(-) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 CCACGTGGCA
SmilChr02G003136 Chr02 NC_080388.1:52380208-52380217promoter 内 1078-1087 bp + 2914 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 52375114-52377294(-) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 TGCCACGTGG
SmilChr02G001949 Chr02 NC_080388.1:35154544-35154553promoter 内 900-909 bp + 3092 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 35157645-35158717(+) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 CCACGTGGCA
SmilChr03G002033 Chr03 NC_080389.1:30518321-30518330promoter 内 799-808 bp - 3193 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 30521523-30522614(+) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 TGCCACGTGG
SmilChr04G001167 Chr04 NC_080390.1:17394108-17394117promoter 内 711-720 bp + 3281 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 17383563-17390827(-) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 TGCCACGTGG
SmilChr02G002016 Chr02 NC_080388.1:36317829-36317838promoter 内 703-712 bp - 3289 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 36313282-36314540(-) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 CCACGTGGCA
SmilChr01G001189 Chr01 NC_080387.1:24049304-24049313promoter 内 622-631 bp + 3370 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 24044763-24045934(-) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 TGCCACGTGG
SmilChr02G003137 Chr02 NC_080388.1:52380208-52380217promoter 内 615-624 bp + 3377 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.3/ 100 1 52383594-52384469(+) SMil_00008313-RA_Salv MP00039 CCACGTGGCA