转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G000836; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00008579-RA_Salv SmilChr07G000836 MYB_related XP_057772437.1 MP00568 TATGGATAAGGTTAT

可能结合的靶基因

9696 个结合位点 6611 个候选靶基因 第 10 / 133 下载 TSV

上一页 10 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G003792 Chr01 NC_080387.1:56321799-56321813promoter 内 1224-1238 bp + 2763 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 56324576-56332760(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTGGGATAAGATTTG
SmilChr02G002963 Chr02 NC_080388.1:50146182-50146196promoter 内 772-786 bp - 3215 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 50141901-50142967(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTTGGATAAGATAAT
SmilChr01G004318 Chr01 NC_080387.1:61366404-61366418promoter 内 691-705 bp + 3296 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 61362069-61363108(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CTATTCTTATCCTTT
SmilChr02G004152 Chr02 NC_080388.1:63823463-63823477promoter 内 542-556 bp - 3445 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 63826922-63832961(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATTTCCTTATCCTTA
SmilChr02G003267 Chr02 NC_080388.1:53936156-53936170promoter 内 3278-3292 bp - 709 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 4 53936879-53938637(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TAACCCTTATCCAAA
SmilChr01G003718 Chr01 NC_080387.1:55516625-55516639promoter 内 3096-3110 bp - 891 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 4 55517530-55519386(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AGCACCTTATCCATA
SmilChr01G002306 Chr01 NC_080387.1:39990788-39990802promoter 内 2772-2786 bp - 1215 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 4 39992017-39993315(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AAAGCCTTATCCAGT
SmilChr02G002222 Chr02 NC_080388.1:39490421-39490435promoter 内 2651-2665 bp + 1336 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 4 39491771-39498915(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TGTGGATAAGGAGGC
SmilChr01G001163 Chr01 NC_080387.1:23618703-23618717promoter 内 3547-3561 bp - 440 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 23617057-23618263(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TATAGATAAGGATTG
SmilChr02G005003 Chr02 NC_080388.1:71830630-71830644promoter 内 2962-2976 bp + 1025 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 71828703-71829605(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AAAACCTTATCCTCC
SmilChr03G000114 Chr03 NC_080389.1:1267017-1267031promoter 内 2174-2188 bp - 1813 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 3 1263204-1265204(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATAGGATAAGAATGG
SmilChr01G004800 Chr01 NC_080387.1:66208421-66208435promoter 内 3922-3936 bp - 65 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 66208500-66209420(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTTACCTTATCTTCT
SmilChr01G005551 Chr01 NC_080387.1:72349356-72349370promoter 内 3388-3402 bp - 599 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 72349969-72353145(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CCTATCTTATCCTAT
SmilChr03G000222 Chr03 NC_080389.1:2596172-2596186promoter 内 3339-3353 bp + 648 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 2596834-2607793(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATAGGATAAGAATGG
SmilChr03G000944 Chr03 NC_080389.1:10707131-10707145promoter 内 1747-1761 bp - 2240 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 10709385-10713375(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CCATCCTTATCTAAT
SmilChr03G000947 Chr03 NC_080389.1:10739042-10739056promoter 内 1740-1754 bp - 2247 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 10741303-10745284(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CCATCCTTATCTAAT
SmilChr01G000138 Chr01 NC_080387.1:2328361-2328375promoter 内 894-908 bp - 3093 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 2331468-2335218(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 GTGACCTTATCCTAA
SmilChr03G000509 Chr03 NC_080389.1:5485404-5485418promoter 内 195-209 bp - 3792 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 5489210-5490217(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTTTCCTTATCCTTA
SmilChr03G000983 Chr03 NC_080389.1:11143208-11143222promoter 内 167-181 bp - 3820 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 11147042-11148049(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTTTCCTTATCCTTA
SmilChr01G005717 Chr01 NC_080387.1:73369735-73369749promoter 内 3706-3720 bp + 281 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 73368484-73369454(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTATTCTTATCCATA
SmilChr01G001235 Chr01 NC_080387.1:24770459-24770473promoter 内 3435-3449 bp + 552 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 24771025-24771847(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AAAGGATAAGATAGG
SmilChr02G002306 Chr02 NC_080388.1:40683530-40683544promoter 内 3286-3300 bp + 701 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 40684245-40687671(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AGAGGATAAGGACAA
SmilChr02G002337 Chr02 NC_080388.1:41069253-41069267promoter 内 3057-3071 bp - 930 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 41070197-41071776(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CCATTCTTATCCTAT
SmilChr02G001878 Chr02 NC_080388.1:34086550-34086564promoter 内 2507-2521 bp + 1480 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 34088044-34090623(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AGAAGATAAGGATAA
SmilChr02G004071 Chr02 NC_080388.1:62992483-62992497promoter 内 2491-2505 bp - 1496 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 62988008-62990987(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATAGGATAAGATAGG
SmilChr02G002052 Chr02 NC_080388.1:36931209-36931223promoter 内 2271-2285 bp + 1716 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 36932939-36935810(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AGAGGATAAGGACAA
SmilChr02G002580 Chr02 NC_080388.1:44836672-44836686promoter 内 2185-2199 bp + 1802 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 44838488-44841085(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTTGGATAAGATTCT
SmilChr01G002375 Chr01 NC_080387.1:40961508-40961522promoter 内 2134-2148 bp + 1853 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 40963375-40970669(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TAAAGATAAGGTAGG
SmilChr01G001851 Chr01 NC_080387.1:33439045-33439059promoter 内 1729-1743 bp + 2258 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 33435244-33436787(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTAACCTTATCTGCA
SmilChr02G002338 Chr02 NC_080388.1:41069253-41069267promoter 内 1429-1443 bp - 2558 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 41071825-41072379(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CCATTCTTATCCTAT
SmilChr02G002623 Chr02 NC_080388.1:45525380-45525394promoter 内 1396-1410 bp + 2591 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 45527985-45529888(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTTGGATAAGATTCT
SmilChr02G000071 Chr02 NC_080388.1:902516-902530promoter 内 1349-1363 bp + 2638 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 897628-899878(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CAATTCTTATCCTAA
SmilChr01G001232 Chr01 NC_080387.1:24770459-24770473promoter 内 1107-1121 bp + 2880 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 24762242-24767579(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CCTATCTTATCCTTT
SmilChr01G003719 Chr01 NC_080387.1:55516625-55516639promoter 内 1098-1112 bp - 2889 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 55519528-55523997(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AGCACCTTATCCATA
SmilChr02G003659 Chr02 NC_080388.1:57961839-57961853promoter 内 800-814 bp - 3187 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 57965040-57967019(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTCTCCTTATCCAAA
SmilChr02G002252 Chr02 NC_080388.1:39958155-39958169promoter 内 472-486 bp - 3515 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 39961684-39964990(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CCTACCTTATCTTTA
SmilChr01G005709 Chr01 NC_080387.1:73319108-73319122promoter 内 397-411 bp - 3590 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 73322712-73323531(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AACATCTTATCCACT
SmilChr01G000042 Chr01 NC_080387.1:679747-679761promoter 内 1322-1336 bp - 2665 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 7 675412-677082(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TGAAGATAAGGATTT
SmilChr01G000047 Chr01 NC_080387.1:745849-745863promoter 内 1483-1497 bp - 2504 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 6 738650-743345(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TGAAGATAAGGATTT
SmilChr02G003782 Chr02 NC_080388.1:59496836-59496850promoter 内 144-158 bp + 3843 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 5 59490863-59492993(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CACACCTTATCCCAT
SmilChr02G003811 Chr02 NC_080388.1:59738771-59738785promoter 内 1292-1306 bp + 2695 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 4 59735596-59736076(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CACACCTTATCCCAT
SmilChr01G001402 Chr01 NC_080387.1:27591942-27591956promoter 内 3019-3033 bp - 968 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 3 27589426-27590974(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TGTAGATAAGGAAAG
SmilChr01G001710 Chr01 NC_080387.1:31574124-31574138promoter 内 2993-3007 bp - 994 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 3 31575132-31576792(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATCATCTTATCCATA
SmilChr01G005473 Chr01 NC_080387.1:71715637-71715651promoter 内 2977-2991 bp - 1010 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 3 71716661-71719500(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CCATTCTTATCCAGA
SmilChr01G000576 Chr01 NC_080387.1:11985779-11985793promoter 内 2482-2496 bp + 1505 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 3 11987298-11989109(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TGTAGATAAGGAAAG
SmilChr01G001795 Chr01 NC_080387.1:32818952-32818966promoter 内 1941-1955 bp - 2046 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 3 32821012-32823779(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 GAATCCTTATCCTTT
SmilChr01G004649 Chr01 NC_080387.1:64567177-64567191promoter 内 1766-1780 bp - 2221 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 3 64569412-64572379(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AAAGTCTTATCCACT
SmilChr02G003447 Chr02 NC_080388.1:55721460-55721474promoter 内 3903-3917 bp + 84 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 55721558-55722746(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TGTGGATAAGGCAGC
SmilChr02G002743 Chr02 NC_080388.1:47416359-47416373promoter 内 3625-3639 bp + 362 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 47416735-47417279(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTAGGATAAGGTACA
SmilChr02G000070 Chr02 NC_080388.1:890703-890717promoter 内 3157-3171 bp - 830 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 891547-894899(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AAAGTCTTATCCACT