转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 102 / 143 下载 TSV

上一页 102 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G005057 Chr02 NC_080388.1:72274724-72274735promoter 内 913-924 bp - 3077 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 72277812-72279187(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTTAT
SmilChr07G002537 Chr07 NC_080393.1:24078479-24078490promoter 内 880-891 bp - 3110 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 24070564-24075369(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGAA
SmilChr03G001292 Chr03 NC_080389.1:15122957-15122968promoter 内 876-887 bp - 3114 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 15126082-15131174(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGAGCTGTCCA
SmilChr07G001995 Chr07 NC_080393.1:17640463-17640474promoter 内 866-877 bp + 3124 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 17643598-17645226(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAAAGCTGTA
SmilChr05G000032 Chr05 NC_080391.1:158134-158145promoter 内 862-873 bp - 3128 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 154081-155006(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTAGA
SmilChr05G003739 Chr05 NC_080391.1:50463828-50463839promoter 内 827-838 bp + 3163 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 50457361-50460665(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTAGCTGTCTG
SmilChr08G000336 Chr08 NC_080394.1:2347995-2348006promoter 内 813-824 bp - 3177 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 2351183-2354370(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTTCAT
SmilChr01G001515 Chr01 NC_080387.1:28995112-28995123promoter 内 809-820 bp + 3181 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 28998304-29000650(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTAGA
SmilChr08G000933 Chr08 NC_080394.1:6914961-6914972promoter 内 756-767 bp - 3234 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 6918206-6924295(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGCAGCTGTCAT
SmilChr08G000935 Chr08 NC_080394.1:6934536-6934547promoter 内 748-759 bp - 3242 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 6937789-6947025(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGCAGCTGTCAT
SmilChr01G005533 Chr01 NC_080387.1:72176848-72176859promoter 内 747-758 bp + 3243 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 72171487-72173605(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAACTGTCAA
SmilChr07G003823 Chr07 NC_080393.1:47284728-47284739promoter 内 716-727 bp + 3274 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 47272962-47281454(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGAGCTGTCCA
SmilChr03G002198 Chr03 NC_080389.1:34592457-34592468promoter 内 602-613 bp - 3388 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 34588198-34589069(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAAAGCTGTA
SmilChr04G003906 Chr04 NC_080390.1:54822272-54822283promoter 内 578-589 bp - 3412 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 54815526-54818860(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGCT
SmilChr01G000985 Chr01 NC_080387.1:20873005-20873016promoter 内 493-504 bp + 3497 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 20868374-20869508(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGAGCTGTCCA
SmilChr02G004182 Chr02 NC_080388.1:64137656-64137667promoter 内 441-452 bp - 3549 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 64130316-64134107(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTGCC
SmilChr06G000148 Chr06 NC_080392.1:1038018-1038029promoter 内 415-426 bp - 3575 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 1041604-1045964(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAACTGTCAA
SmilChr07G000193 Chr07 NC_080393.1:1219370-1219381promoter 内 414-425 bp + 3576 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 1222957-1223947(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGAA
SmilChr06G001534 Chr06 NC_080392.1:16568425-16568436promoter 内 379-390 bp + 3611 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 16561197-16564814(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAACTGTCAA
SmilChr03G003621 Chr03 NC_080389.1:54864664-54864675promoter 内 377-388 bp - 3613 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 54859913-54861051(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTAGA
SmilChr08G001646 Chr08 NC_080394.1:13662513-13662524promoter 内 377-388 bp - 3613 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 13658144-13658900(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGAA
SmilChr04G001897 Chr04 NC_080390.1:30998506-30998517promoter 内 347-358 bp - 3643 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 30991112-30994863(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTAAC
SmilChr07G004039 Chr07 NC_080393.1:51653423-51653434promoter 内 227-238 bp - 3763 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 51644271-51649660(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTAACAGCTGTT
SmilChr06G001637 Chr06 NC_080392.1:18428373-18428384promoter 内 172-183 bp + 3818 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 18432202-18434438(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTAGA
SmilChr08G000268 Chr08 NC_080394.1:1830401-1830412promoter 内 59-70 bp + 3931 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 1834343-1835203(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGAA
SmilChr02G001977 Chr02 NC_080388.1:35726422-35726433promoter 内 31-42 bp - 3959 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 35730392-35731091(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTTCAT
SmilChr02G000400 Chr02 NC_080388.1:4940916-4940927promoter 内 5-16 bp + 3985 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 4944912-4948191(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTCAG
SmilChr05G003526 Chr05 NC_080391.1:47138026-47138037promoter 内 3907-3918 bp + 83 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 47138120-47141715(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATACAGCTGAC
SmilChr02G003062 Chr02 NC_080388.1:51457376-51457387promoter 内 3673-3684 bp + 317 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 51457704-51459502(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTGCC
SmilChr03G004299 Chr03 NC_080389.1:61386565-61386576promoter 内 3612-3623 bp - 378 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 61386954-61388667(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTATT
SmilChr03G003664 Chr03 NC_080389.1:55484418-55484429promoter 内 3547-3558 bp - 443 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 55484872-55486992(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAGCTGTCCA
SmilChr02G003124 Chr02 NC_080388.1:52243310-52243321promoter 内 3372-3383 bp - 618 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 52241325-52242692(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTGCC
SmilChr06G000969 Chr06 NC_080392.1:9410775-9410786promoter 内 3368-3379 bp + 622 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 9408338-9410153(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTACA
SmilChr06G002854 Chr06 NC_080392.1:41305232-41305243promoter 内 3317-3328 bp + 673 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 41305916-41307699(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTCAT
SmilChr02G005177 Chr02 NC_080388.1:73065530-73065541promoter 内 2980-2991 bp + 1010 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 73062182-73064520(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGCAGCTGTCGC
SmilChr01G003059 Chr01 NC_080387.1:49482447-49482458promoter 内 2975-2986 bp - 1015 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 49483473-49487851(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TATAGCTGTCTG
SmilChr08G000178 Chr08 NC_080394.1:1207470-1207481promoter 内 2684-2695 bp - 1306 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 1208787-1209944(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAGCTGTCCA
SmilChr04G000742 Chr04 NC_080390.1:9120530-9120541promoter 内 2371-2382 bp + 1619 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 9116065-9118911(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAGCTGTCCA
SmilChr02G000742 Chr02 NC_080388.1:11996727-11996738promoter 内 2256-2267 bp + 1734 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 11998472-11998578(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTCAT
SmilChr02G002282 Chr02 NC_080388.1:40304241-40304252promoter 内 2075-2086 bp - 1915 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 40299572-40302326(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTAAC
SmilChr03G003663 Chr03 NC_080389.1:55484418-55484429promoter 内 1744-1755 bp - 2246 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 55479717-55482172(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTCAT
SmilChr05G002357 Chr05 NC_080391.1:25585630-25585641promoter 内 1522-1533 bp + 2468 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 25580259-25583162(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTAGCTGTCTT
SmilChr06G002998 Chr06 NC_080392.1:42858505-42858516promoter 内 1432-1443 bp - 2558 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 42861074-42869499(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTATT
SmilChr03G001907 Chr03 NC_080389.1:26688166-26688177promoter 内 1361-1372 bp + 2629 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 26690806-26691552(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTCAT
SmilChr04G003376 Chr04 NC_080390.1:50321082-50321093promoter 内 852-863 bp + 3138 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 50324231-50325449(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTAAC
SmilChr07G000274 Chr07 NC_080393.1:1775935-1775946promoter 内 734-745 bp - 3256 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 1779202-1782438(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTAGCTGTCTT
SmilChr05G002680 Chr05 NC_080391.1:30284468-30284479promoter 内 671-682 bp + 3319 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 30287798-30290452(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTAAC
SmilChr08G003382 Chr08 NC_080394.1:35499373-35499384promoter 内 570-581 bp + 3420 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 35502804-35504993(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTCAT
SmilChr08G003381 Chr08 NC_080394.1:35495840-35495851promoter 内 532-543 bp - 3458 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 35490242-35492382(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTCAT
SmilChr07G003443 Chr07 NC_080393.1:38225209-38225220promoter 内 524-535 bp - 3466 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 38219806-38221743(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTCAT