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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G003955; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00019539-RA_Salv SmilChr04G003955 ERF XP_057805828.1 MP00120 GATATTGTCGGTGGT

可能结合的靶基因

7514 个结合位点 6144 个候选靶基因 第 105 / 123 下载 TSV

上一页 105 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G000259 Chr02 NC_080388.1:3312461-3312475promoter 内 45-59 bp - 3942 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 3316417-3319774(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TTCACCGACGTCTTG
SmilChr07G004437 Chr07 NC_080393.1:57043972-57043986promoter 内 3139-3153 bp + 848 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 2 57042444-57043124(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TCGACCGACAAAATC
SmilChr05G001531 Chr05 NC_080391.1:14027039-14027053promoter 内 2860-2874 bp + 1127 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 2 14020095-14025912(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGTCGGAGCG
SmilChr05G002486 Chr05 NC_080391.1:27528482-27528496promoter 内 2257-2271 bp + 1730 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 2 27530226-27535460(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 AATTTTGTCGGCGCA
SmilChr06G003089 Chr06 NC_080392.1:43738966-43738980promoter 内 951-965 bp + 3036 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 2 43742016-43747651(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TAATCCGTCGGTGAT
SmilChr05G001532 Chr05 NC_080391.1:14027039-14027053promoter 内 514-528 bp + 3473 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 2 14030526-14031701(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CGCTCCGACGGTGGT
SmilChr06G001565 Chr06 NC_080392.1:17093673-17093687promoter 内 3933-3947 bp + 54 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 17093071-17093619(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 AACACCGACAAATAA
SmilChr05G000537 Chr05 NC_080391.1:4126864-4126878promoter 内 3897-3911 bp - 90 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 4119603-4126774(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TGCTAAGTCGGTGGC
SmilChr02G000280 Chr02 NC_080388.1:3566979-3566993promoter 内 3875-3889 bp + 112 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 3565316-3566867(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CGCACCGACGATATA
SmilChr03G000390 Chr03 NC_080389.1:4306913-4306927promoter 内 3875-3889 bp - 112 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 4307039-4308805(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CGCACCGACGATATA
SmilChr07G004371 Chr07 NC_080393.1:56247503-56247517promoter 内 3875-3889 bp - 112 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 56247629-56250760(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CGCACCGACGATATA
SmilChr07G002705 Chr07 NC_080393.1:26416488-26416502promoter 内 3733-3747 bp + 254 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 26416756-26418358(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CTGTCCGTCGGTGCC
SmilChr03G001803 Chr03 NC_080389.1:24621153-24621167promoter 内 3690-3704 bp + 297 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 24618859-24620856(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CGCACCGACGATATA
SmilChr02G003191 Chr02 NC_080388.1:53069752-53069766promoter 内 3623-3637 bp - 364 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 53067817-53069388(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCGGACGGCGGTGGT
SmilChr01G002624 Chr01 NC_080387.1:44511540-44511554promoter 内 3592-3606 bp - 395 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 44508084-44511145(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GGAGGAGGCGGTGGT
SmilChr05G003160 Chr05 NC_080391.1:40380359-40380373promoter 内 3501-3515 bp + 486 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 40380859-40382242(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCGGACGGCGGTGGT
SmilChr02G003192 Chr02 NC_080388.1:53077663-53077677promoter 内 3481-3495 bp - 506 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 53075701-53077157(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCGGACGGCGGTGGT
SmilChr03G002302 Chr03 NC_080389.1:36240612-36240626promoter 内 3480-3494 bp - 507 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 36241133-36243860(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TTCACCGACGTTAGT
SmilChr08G003606 Chr08 NC_080394.1:39138468-39138482promoter 内 3441-3455 bp + 546 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 39134693-39137922(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCCACCGACTTGGGC
SmilChr08G001764 Chr08 NC_080394.1:14854213-14854227promoter 内 3427-3441 bp + 560 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 14852364-14853653(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 AACACCGACAGAGTA
SmilChr04G000846 Chr04 NC_080390.1:10694505-10694519promoter 内 3412-3426 bp - 575 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 10692251-10693930(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ATGGGCGGCGGTGGT
SmilChr08G000007 Chr08 NC_080394.1:95875-95889promoter 内 3404-3418 bp - 583 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 93019-95292(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TAGTCTGGCGGTGGT
SmilChr07G004137 Chr07 NC_080393.1:53148661-53148675promoter 内 3402-3416 bp - 585 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 53149260-53151823(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CACACCGACAAAAAG
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SmilChr07G002112 Chr07 NC_080393.1:19237947-19237961promoter 内 3361-3375 bp - 626 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 19238587-19244873(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CCCACCGACCAACAC
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SmilChr01G005192 Chr01 NC_080387.1:69615818-69615832promoter 内 3285-3299 bp - 702 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 69614113-69615116(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCGGACGGCGGTGGT
SmilChr07G003536 Chr07 NC_080393.1:40852444-40852458promoter 内 3272-3286 bp + 715 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 40848271-40851729(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGCCTCCACC
SmilChr05G001783 Chr05 NC_080391.1:17556311-17556325promoter 内 3237-3251 bp - 750 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 17554603-17555561(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCGGACGGCGGTGGT
SmilChr01G005193 Chr01 NC_080387.1:69625124-69625138promoter 内 3184-3198 bp - 803 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 69623420-69624321(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCGGACGGCGGTGGT
SmilChr05G002556 Chr05 NC_080391.1:28695251-28695265promoter 内 3170-3184 bp + 817 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 28690889-28694434(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGTCGCCCGT
SmilChr07G004477 Chr07 NC_080393.1:57309821-57309835promoter 内 3164-3178 bp - 823 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 57310658-57313639(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TCGACCGACAAAATC
SmilChr04G000471 Chr04 NC_080390.1:5021323-5021337promoter 内 3017-3031 bp - 970 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 5022307-5024556(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CTCACCGACGGCATA
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SmilChr08G003828 Chr08 NC_080394.1:44533866-44533880promoter 内 2935-2949 bp + 1052 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 44530947-44532814(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGCCGACGAG
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SmilChr04G002202 Chr04 NC_080390.1:35649319-35649333promoter 内 2900-2914 bp + 1087 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 35642919-35648232(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ATCACCGACGGAATA
SmilChr05G000538 Chr05 NC_080391.1:4126864-4126878promoter 内 2885-2899 bp - 1102 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 4127980-4130486(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCCACCGACTTAGCA
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