转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 105 / 149 下载 TSV

上一页 105 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G003586 Chr05 NC_080391.1:47912702-47912712promoter 内 3141-3151 bp - 850 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 47913562-47919109(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGGA
SmilChr07G002948 Chr07 NC_080393.1:29875721-29875731promoter 内 3133-3143 bp - 858 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 29876589-29879014(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTCTT
SmilChr04G004010 Chr04 NC_080390.1:55416935-55416945promoter 内 3114-3124 bp - 877 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 55417822-55418714(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCAAC
SmilChr02G004449 Chr02 NC_080388.1:66849932-66849942promoter 内 3076-3086 bp - 915 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 66850857-66852409(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGGA
SmilChr01G000418 Chr01 NC_080387.1:8435666-8435676promoter 内 3064-3074 bp + 927 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 8436603-8437870(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCG
SmilChr03G003981 Chr03 NC_080389.1:58820077-58820087promoter 内 2973-2983 bp + 1018 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 58821105-58823702(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCT
SmilChr05G001066 Chr05 NC_080391.1:8806910-8806920promoter 内 2809-2819 bp - 1182 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 8803609-8805728(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTTGGCTGTCA
SmilChr01G001071 Chr01 NC_080387.1:22099898-22099908promoter 内 2759-2769 bp - 1232 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 22101140-22111815(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTATC
SmilChr02G001575 Chr02 NC_080388.1:29254685-29254695promoter 内 2567-2577 bp - 1424 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 29251984-29253261(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCG
SmilChr01G003737 Chr01 NC_080387.1:55697844-55697854promoter 内 2477-2487 bp + 1514 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 55699368-55701398(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGAGCTGTCC
SmilChr07G001556 Chr07 NC_080393.1:12684547-12684557promoter 内 2477-2487 bp - 1514 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 12681256-12683033(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGAGCTGTCC
SmilChr05G002191 Chr05 NC_080391.1:23401416-23401426promoter 内 2431-2441 bp + 1560 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 23402986-23409109(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTAG
SmilChr04G003523 Chr04 NC_080390.1:51603183-51603193promoter 内 2351-2361 bp - 1640 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 51604833-51607438(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTATC
SmilChr06G002055 Chr06 NC_080392.1:27077799-27077809promoter 内 2349-2359 bp + 1642 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 27079451-27082371(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGAGCTGTCC
SmilChr03G003980 Chr03 NC_080389.1:58820077-58820087promoter 内 2335-2345 bp + 1656 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 58815363-58818421(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCTG
SmilChr01G001895 Chr01 NC_080387.1:34059365-34059375promoter 内 2323-2333 bp - 1668 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 34061043-34062788(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCAAC
SmilChr03G001016 Chr03 NC_080389.1:11675161-11675171promoter 内 2279-2289 bp + 1712 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 11676883-11677709(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGAGCTGTCC
SmilChr01G004477 Chr01 NC_080387.1:62874359-62874369promoter 内 2275-2285 bp + 1716 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 62876085-62878174(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTAG
SmilChr03G000590 Chr03 NC_080389.1:6565512-6565522promoter 内 2269-2279 bp + 1722 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 6567244-6570284(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTAG
SmilChr01G004120 Chr01 NC_080387.1:59724969-59724979promoter 内 2239-2249 bp + 1752 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 59723147-59723217(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCAAC
SmilChr04G000123 Chr04 NC_080390.1:1055470-1055480promoter 内 2237-2247 bp + 1754 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 1057234-1061256(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCG
SmilChr03G000204 Chr03 NC_080389.1:2301434-2301444promoter 内 2189-2199 bp + 1802 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 2303246-2315523(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTAG
SmilChr01G000417 Chr01 NC_080387.1:8435666-8435676promoter 内 2154-2164 bp + 1837 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 8432765-8433829(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTATC
SmilChr06G000134 Chr06 NC_080392.1:946932-946942promoter 内 2120-2130 bp - 1871 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 936349-945061(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGAGCTGTCC
SmilChr07G000572 Chr07 NC_080393.1:3887040-3887050promoter 内 2105-2115 bp + 1886 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 3888936-3890019(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCG
SmilChr04G000139 Chr04 NC_080390.1:1191625-1191635promoter 内 2095-2105 bp - 1896 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 1188095-1189729(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTAG
SmilChr02G004431 Chr02 NC_080388.1:66667745-66667755promoter 内 2025-2035 bp - 1966 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 66663173-66665779(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGAGCTGTCC
SmilChr06G000129 Chr06 NC_080392.1:922230-922240promoter 内 1952-1962 bp - 2039 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 912905-920191(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTAG
SmilChr04G001168 Chr04 NC_080390.1:17400422-17400432promoter 内 1944-1954 bp + 2047 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 17402479-17402584(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGAGCTGTCC
SmilChr02G001034 Chr02 NC_080388.1:18380417-18380427promoter 内 1894-1904 bp + 2097 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 18382524-18385099(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCT
SmilChr06G000907 Chr06 NC_080392.1:8538769-8538779promoter 内 1767-1777 bp - 2224 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 8541003-8543813(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCAAC
SmilChr07G003123 Chr07 NC_080393.1:33146591-33146601promoter 内 1763-1773 bp + 2228 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 33143461-33144363(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCTG
SmilChr07G003143 Chr07 NC_080393.1:33326324-33326334promoter 内 1763-1773 bp + 2228 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 33323194-33324096(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCTG
SmilChr07G002526 Chr07 NC_080393.1:23933668-23933678promoter 内 1705-1715 bp + 2286 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 23930259-23931382(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCAAC
SmilChr04G002485 Chr04 NC_080390.1:39688765-39688775promoter 内 1653-1663 bp + 2338 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 39691113-39694754(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTTGGCTGTCA
SmilChr02G002704 Chr02 NC_080388.1:46890049-46890059promoter 内 1637-1647 bp - 2354 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 46882839-46887695(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTAG
SmilChr06G002353 Chr06 NC_080392.1:34228306-34228316promoter 内 1630-1640 bp - 2361 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 34230677-34230782(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCTG
SmilChr01G000626 Chr01 NC_080387.1:14045349-14045359promoter 内 1629-1639 bp + 2362 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 14042541-14042987(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTATC
SmilChr07G002206 Chr07 NC_080393.1:20309447-20309457promoter 内 1491-1501 bp - 2500 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 20305401-20306947(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGAGCTGTCC
SmilChr02G003688 Chr02 NC_080388.1:58283448-58283458promoter 内 1490-1500 bp - 2501 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 58274625-58280947(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTAG
SmilChr02G000841 Chr02 NC_080388.1:14256485-14256495promoter 内 1445-1455 bp - 2546 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 14259041-14261920(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCTG
SmilChr03G002259 Chr03 NC_080389.1:35585067-35585077promoter 内 1420-1430 bp - 2571 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 35581768-35582496(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCT
SmilChr01G000069 Chr01 NC_080387.1:1190471-1190481promoter 内 1397-1407 bp - 2594 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 1193075-1195895(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCTG
SmilChr03G002553 Chr03 NC_080389.1:40708689-40708699promoter 内 1392-1402 bp + 2599 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 40711298-40712479(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTAG
SmilChr05G003084 Chr05 NC_080391.1:39025669-39025679promoter 内 1239-1249 bp - 2752 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 39028431-39029726(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTATC
SmilChr01G005240 Chr01 NC_080387.1:69950932-69950942promoter 内 1219-1229 bp + 2772 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 69953714-69954297(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AAGAGCTGTCC
SmilChr05G002077 Chr05 NC_080391.1:21704873-21704883promoter 内 1212-1222 bp - 2779 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 21707662-21709732(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCTG
SmilChr04G003443 Chr04 NC_080390.1:50949702-50949712promoter 内 1206-1216 bp - 2785 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 50945181-50946917(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTTGGCTGTCA
SmilChr04G003939 Chr04 NC_080390.1:55014774-55014784promoter 内 1127-1137 bp - 2864 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 55010158-55011910(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTTGGCTGTCA
SmilChr05G002513 Chr05 NC_080391.1:27888513-27888523promoter 内 1081-1091 bp + 2910 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 27881707-27885603(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGGA