转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G000949; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003681-RA_Salv SmilChr02G000949 bZIP XP_057795176.1 MP00318 TGCCACGTCAGCATT

可能结合的靶基因

9413 个结合位点 6849 个候选靶基因 第 106 / 137 下载 TSV

上一页 106 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G004470 Chr02 NC_080388.1:67102046-67102060promoter 内 3151-3165 bp + 836 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 67102896-67102977(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGACACGTCAGATAG
SmilChr01G003565 Chr01 NC_080387.1:54237915-54237929promoter 内 3131-3145 bp + 856 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 54238785-54239221(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTCGATTTC
SmilChr02G004471 Chr02 NC_080388.1:67102046-67102060promoter 内 3005-3019 bp + 982 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 67103042-67104077(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGACACGTCAGATAG
SmilChr07G002115 Chr07 NC_080393.1:19266737-19266751promoter 内 2877-2891 bp + 1110 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 19262595-19265627(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AATTCCTACGTGGCT
SmilChr08G001873 Chr08 NC_080394.1:16214875-16214889promoter 内 2797-2811 bp + 1190 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 16216079-16217182(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTAAGTTTG
SmilChr07G002116 Chr07 NC_080393.1:19266737-19266751promoter 内 2786-2800 bp + 1201 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 19267952-19273337(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTAGGAATT
SmilChr04G002746 Chr04 NC_080390.1:43133759-43133773promoter 内 2780-2794 bp + 1207 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 43134980-43135051(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTCTGGATC
SmilChr05G004111 Chr05 NC_080391.1:54959418-54959432promoter 内 2712-2726 bp - 1275 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 54956469-54958143(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTGTCGTCC
SmilChr07G001251 Chr07 NC_080393.1:9651640-9651654promoter 内 2630-2644 bp - 1357 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 9649143-9650283(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTCATTGAA
SmilChr02G001328 Chr02 NC_080388.1:24741352-24741366promoter 内 2528-2542 bp + 1459 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 24742825-24747007(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ATCCACGTCGTCCCC
SmilChr02G003449 Chr02 NC_080388.1:55728540-55728554promoter 内 2519-2533 bp - 1468 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 55730022-55732077(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GTATTTTACGTGGCA
SmilChr01G001052 Chr01 NC_080387.1:21857168-21857182promoter 内 2449-2463 bp - 1538 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 21854656-21855630(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGAGGCAC
SmilChr05G002222 Chr05 NC_080391.1:23737662-23737676promoter 内 2389-2403 bp - 1598 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 23739274-23747335(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GCGTGATACGTGGCA
SmilChr05G002371 Chr05 NC_080391.1:25968229-25968243promoter 内 2177-2191 bp - 1810 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 25970053-25977214(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AATGATAACGTGGCA
SmilChr02G005367 Chr02 NC_080388.1:74367433-74367447promoter 内 2169-2183 bp - 1818 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 74359181-74365615(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CTACACGTCATCAAC
SmilChr07G004121 Chr07 NC_080393.1:52886072-52886086promoter 内 2110-2124 bp + 1877 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 52881909-52884195(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGCACCTACGTGGCA
SmilChr07G000749 Chr07 NC_080393.1:5278263-5278277promoter 内 1976-1990 bp - 2011 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 5271788-5276252(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTAGGATCC
SmilChr07G000740 Chr07 NC_080393.1:5155591-5155605promoter 内 1950-1964 bp - 2037 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 5150526-5153554(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTAGGATCC
SmilChr05G000652 Chr05 NC_080391.1:4920159-4920173promoter 内 1829-1843 bp - 2158 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 4922331-4926878(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGATGCGACGTGGAG
SmilChr05G002715 Chr05 NC_080391.1:31269050-31269064promoter 内 1793-1807 bp + 2194 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 31271258-31272844(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGACACGTCAGTCTG
SmilChr04G003303 Chr04 NC_080390.1:49759405-49759419promoter 内 1761-1775 bp + 2226 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 49755086-49757179(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GAGTTTTACGTGGCA
SmilChr04G003618 Chr04 NC_080390.1:52691213-52691227promoter 内 1725-1739 bp - 2262 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 52685126-52688951(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTAAAAAAT
SmilChr06G002606 Chr06 NC_080392.1:37494305-37494319promoter 内 1684-1698 bp + 2303 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 37457053-37492002(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GAAATCGACGTGGCG
SmilChr08G002448 Chr08 NC_080394.1:23297427-23297441promoter 内 1477-1491 bp + 2510 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 23287348-23294917(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GTTGGAGACGTGGAT
SmilChr01G001846 Chr01 NC_080387.1:33412539-33412553promoter 内 1425-1439 bp + 2562 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 33415115-33415759(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTCTCTCAT
SmilChr05G003965 Chr05 NC_080391.1:53394987-53395001promoter 内 1205-1219 bp + 2782 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 53387892-53392205(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GATCCAGACGTGGCT
SmilChr06G000118 Chr06 NC_080392.1:829750-829764promoter 内 1169-1183 bp + 2818 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 824868-826932(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GCCGGAGACGTGGAG
SmilChr08G001874 Chr08 NC_080394.1:16214875-16214889promoter 内 1047-1061 bp + 2940 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 16217829-16218621(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTAAGTTTG
SmilChr07G001973 Chr07 NC_080393.1:17300175-17300189promoter 内 926-940 bp + 3061 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 17303250-17303770(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TCCCACGTCACCTTT
SmilChr02G003448 Chr02 NC_080388.1:55728540-55728554promoter 内 915-929 bp - 3072 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 55722680-55725468(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTAAAATAC
SmilChr07G001080 Chr07 NC_080393.1:7921107-7921121promoter 内 862-876 bp - 3125 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 7924246-7926985(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GCTGTTGACGTGGAC
SmilChr07G000227 Chr07 NC_080393.1:1468218-1468232promoter 内 714-728 bp - 3273 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 1457496-1464945(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTAAAAAAT
SmilChr04G002884 Chr04 NC_080390.1:45058674-45058688promoter 内 684-698 bp + 3303 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 45050548-45055371(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GACATCGACGTGGCA
SmilChr07G002180 Chr07 NC_080393.1:19968302-19968316promoter 内 630-644 bp - 3357 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 19971673-19982397(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ATATATTACGTGGCG
SmilChr04G004067 Chr04 NC_080390.1:55790481-55790495promoter 内 602-616 bp + 3385 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 55784229-55787096(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TATTCAGACGTGGAG
SmilChr01G001999 Chr01 NC_080387.1:35495483-35495497promoter 内 452-466 bp + 3535 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 35499032-35502377(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTAGGTGCC
SmilChr04G004069 Chr04 NC_080390.1:55790481-55790495promoter 内 450-464 bp + 3537 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 55794032-55796974(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CTCCACGTCTGAATA
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SmilChr04G003969 Chr04 NC_080390.1:55169323-55169337promoter 内 338-352 bp - 3649 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 55162182-55165674(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGTCTCTA
SmilChr05G004333 Chr05 NC_080391.1:57015912-57015926promoter 内 243-257 bp - 3744 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 57019670-57023424(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GTGCCTCACGTGGCT
SmilChr02G004893 Chr02 NC_080388.1:70957682-70957696promoter 内 143-157 bp + 3844 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 70961540-70963494(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGCCACGTCAAACGT
SmilChr04G003919 Chr04 NC_080390.1:54876962-54876976promoter 内 110-124 bp - 3877 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 54880853-54883102(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ATTTCTGACGTGGAT
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SmilChr06G002944 Chr06 NC_080392.1:42270002-42270016promoter 内 96-110 bp - 3891 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 42265081-42266111(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTCGAGCGC
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SmilChr01G004681 Chr01 NC_080387.1:64883195-64883209promoter 内 34-48 bp + 3953 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 64887162-64888454(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTAGACATG
SmilChr05G004243 Chr05 NC_080391.1:56246694-56246708promoter 内 3227-3241 bp - 760 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 2 56242322-56245934(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTCAAATTT