转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 109 / 149 下载 TSV

上一页 109 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G004121 Chr05 NC_080391.1:55117706-55117716promoter 内 501-511 bp - 3490 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 55112539-55114216(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TATGGCTGTCA
SmilChr04G001727 Chr04 NC_080390.1:28518065-28518075promoter 内 389-399 bp - 3602 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 28512736-28514463(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGTAT
SmilChr05G002033 Chr05 NC_080391.1:21161086-21161096promoter 内 382-392 bp - 3609 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 21152731-21157477(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACTAGCTGTCT
SmilChr06G000739 Chr06 NC_080392.1:6830630-6830640promoter 内 312-322 bp + 3679 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 6825335-6826951(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCATA
SmilChr03G001398 Chr03 NC_080389.1:16597640-16597650promoter 内 304-314 bp - 3687 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 16601337-16604106(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCAAG
SmilChr02G000606 Chr02 NC_080388.1:8816614-8816624promoter 内 258-268 bp - 3733 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 8820357-8821866(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTATG
SmilChr07G002135 Chr07 NC_080393.1:19498091-19498101promoter 内 256-266 bp + 3735 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 19501836-19506665(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGTAT
SmilChr05G002638 Chr05 NC_080391.1:29799337-29799347promoter 内 249-259 bp + 3742 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 29791790-29795595(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATACAGCTGGC
SmilChr02G002557 Chr02 NC_080388.1:44470092-44470102promoter 内 220-230 bp + 3771 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 44473873-44500678(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TATGGCTGTCA
SmilChr03G002603 Chr03 NC_080389.1:41394362-41394372promoter 内 218-228 bp - 3773 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 41398145-41401591(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTAT
SmilChr04G000301 Chr04 NC_080390.1:2791273-2791283promoter 内 218-228 bp + 3773 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 2785965-2787500(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCATA
SmilChr01G003014 Chr01 NC_080387.1:49168949-49168959promoter 内 186-196 bp - 3805 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 49172764-49176736(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCAAG
SmilChr01G001370 Chr01 NC_080387.1:27042393-27042403promoter 内 154-164 bp + 3837 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 27046240-27050291(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGTAT
SmilChr03G000402 Chr03 NC_080389.1:4390280-4390290promoter 内 142-152 bp + 3849 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 4385403-4386431(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCATA
SmilChr06G001403 Chr06 NC_080392.1:14729727-14729737promoter 内 99-109 bp - 3892 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 14721213-14725835(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTTGGCTGTCA
SmilChr06G001366 Chr06 NC_080392.1:14271905-14271915promoter 内 74-84 bp - 3917 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 14263395-14267988(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTTGGCTGTCA
SmilChr03G003191 Chr03 NC_080389.1:49365786-49365796promoter 内 50-60 bp + 3941 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 49369737-49373510(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGTAC
SmilChr07G002895 Chr07 NC_080393.1:29312338-29312348promoter 内 44-54 bp + 3947 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 29304258-29308391(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTACAGCTGGT
SmilChr01G003239 Chr01 NC_080387.1:51128437-51128447promoter 内 18-28 bp + 3973 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 51132420-51135151(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGTAT
SmilChr01G001484 Chr01 NC_080387.1:28624915-28624925promoter 内 14-24 bp + 3977 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 28628902-28631945(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TATGGCTGTCA
SmilChr02G003008 Chr02 NC_080388.1:50719252-50719262promoter 内 4-14 bp - 3987 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 50713772-50715265(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TATGGCTGTCA
SmilChr05G000741 Chr05 NC_080391.1:5671799-5671809promoter 内 3357-3367 bp - 634 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 5672443-5677747(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAA
SmilChr04G003766 Chr04 NC_080390.1:53894721-53894731promoter 内 3286-3296 bp + 705 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 53895436-53896342(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTAA
SmilChr05G003595 Chr05 NC_080391.1:48044454-48044464promoter 内 3212-3222 bp + 779 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 48039962-48043675(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTAGA
SmilChr06G000053 Chr06 NC_080392.1:432906-432916promoter 内 2372-2382 bp - 1619 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 428399-431287(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTTAGCTGTCA
SmilChr02G003372 Chr02 NC_080388.1:54850202-54850212promoter 内 2367-2377 bp - 1624 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 54851836-54853897(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTCAT
SmilChr07G002335 Chr07 NC_080393.1:21656270-21656280promoter 内 2245-2255 bp + 1746 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 21652070-21654524(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAA
SmilChr05G002180 Chr05 NC_080391.1:23236548-23236558promoter 内 2123-2133 bp + 1868 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 23238426-23241639(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTTAGCTGTCA
SmilChr06G000269 Chr06 NC_080392.1:1821301-1821311promoter 内 1138-1148 bp - 2853 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 1824164-1824278(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGAT
SmilChr03G002282 Chr03 NC_080389.1:36017313-36017323promoter 内 424-434 bp - 3567 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 36013189-36013746(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCTAGCTGTCC
SmilChr03G000522 Chr03 NC_080389.1:5607088-5607098promoter 内 99-109 bp - 3892 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 5610990-5611799(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATACAGCTGGG
SmilChr05G000650 Chr05 NC_080391.1:4917531-4917541promoter 内 3963-3973 bp - 28 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 4917569-4917979(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAA
SmilChr02G004246 Chr02 NC_080388.1:64655652-64655662promoter 内 3935-3945 bp + 56 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 64655718-64657732(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTTAGCTGTCA
SmilChr07G000753 Chr07 NC_080393.1:5309851-5309861promoter 内 3932-3942 bp - 59 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 5307067-5309792(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTAA
SmilChr05G001055 Chr05 NC_080391.1:8741932-8741942promoter 内 3917-3927 bp - 74 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 8739951-8741858(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTTAGCTGTCA
SmilChr01G003020 Chr01 NC_080387.1:49213564-49213574promoter 内 3877-3887 bp + 114 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 49212007-49213450(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTAC
SmilChr07G002423 Chr07 NC_080393.1:22565430-22565440promoter 内 3877-3887 bp - 114 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 22565554-22566997(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTAC
SmilChr01G005478 Chr01 NC_080387.1:71767013-71767023promoter 内 3868-3878 bp - 123 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 71767146-71770548(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAA
SmilChr02G004083 Chr02 NC_080388.1:63103353-63103363promoter 内 3829-3839 bp + 162 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 63102560-63103191(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGAT
SmilChr01G004660 Chr01 NC_080387.1:64704031-64704041promoter 内 3807-3817 bp - 184 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 64704225-64708380(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAA
SmilChr02G005299 Chr02 NC_080388.1:73949779-73949789promoter 内 3679-3689 bp + 312 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 73948425-73949467(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAA
SmilChr02G004897 Chr02 NC_080388.1:70986377-70986387promoter 内 3677-3687 bp + 314 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 70984733-70986063(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAA
SmilChr01G001400 Chr01 NC_080387.1:27499574-27499584promoter 内 3658-3668 bp - 333 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 27497994-27499241(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTTAGCTGTCA
SmilChr01G005411 Chr01 NC_080387.1:71347527-71347537promoter 内 3564-3574 bp - 427 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 71347964-71351252(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTCAT
SmilChr05G003814 Chr05 NC_080391.1:51437827-51437837promoter 内 3513-3523 bp - 478 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 51438315-51443308(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATACAGCTGGG
SmilChr01G005979 Chr01 NC_080387.1:75451534-75451544promoter 内 3503-3513 bp + 488 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 75445761-75451046(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAA
SmilChr02G004767 Chr02 NC_080388.1:69847219-69847229promoter 内 3441-3451 bp + 550 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 69847779-69848270(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTTAGCTGTCA
SmilChr01G004678 Chr01 NC_080387.1:64872429-64872439promoter 内 3431-3441 bp - 560 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 64867873-64871869(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTTAGCTGTCA
SmilChr02G002359 Chr02 NC_080388.1:41374414-41374424promoter 内 3326-3336 bp - 665 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 41375089-41377936(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGAT
SmilChr05G000145 Chr05 NC_080391.1:1187910-1187920promoter 内 3285-3295 bp - 706 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 1184607-1187204(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTTAGCTGTCA