转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 11 / 143 下载 TSV

上一页 11 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr07G003929 Chr07 NC_080393.1:49591378-49591389promoter 内 584-595 bp - 3406 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 2 49594795-49596969(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCAG
SmilChr06G002265 Chr06 NC_080392.1:32251083-32251094promoter 内 491-502 bp + 3499 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 2 32244588-32247584(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCAG
SmilChr01G000141 Chr01 NC_080387.1:2391553-2391564promoter 内 409-420 bp - 3581 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 2 2395145-2403224(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGCGA
SmilChr03G001871 Chr03 NC_080389.1:25916304-25916315promoter 内 369-380 bp - 3621 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 2 25919936-25922407(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCAG
SmilChr05G003014 Chr05 NC_080391.1:37552947-37552958promoter 内 319-330 bp - 3671 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 2 37531518-37549276(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTGTA
SmilChr01G001068 Chr01 NC_080387.1:22029825-22029836promoter 内 303-314 bp + 3687 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 2 22024948-22026138(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCAG
SmilChr07G003675 Chr07 NC_080393.1:44112078-44112089promoter 内 301-312 bp + 3689 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 2 44115778-44117626(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTGTA
SmilChr01G001328 Chr01 NC_080387.1:26440882-26440893promoter 内 270-281 bp + 3720 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 2 26434729-26437162(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCAG
SmilChr06G002138 Chr06 NC_080392.1:28965242-28965253promoter 内 210-221 bp + 3780 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 2 28969033-28973043(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTGTA
SmilChr02G000467 Chr02 NC_080388.1:6304062-6304073promoter 内 167-178 bp - 3823 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 2 6297501-6300239(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTGTA
SmilChr07G003613 Chr07 NC_080393.1:42421602-42421613promoter 内 167-178 bp - 3823 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 2 42425436-42426618(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCAG
SmilChr07G003446 Chr07 NC_080393.1:38327374-38327385promoter 内 165-176 bp - 3825 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 2 38321444-38323549(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTGTA
SmilChr03G002301 Chr03 NC_080389.1:36229859-36229870promoter 内 149-160 bp + 3841 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 2 36221533-36226018(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCAG
SmilChr01G000134 Chr01 NC_080387.1:2266789-2266800promoter 内 147-158 bp + 3843 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 2 2270643-2271913(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTGTA
SmilChr03G003310 Chr03 NC_080389.1:51324212-51324223promoter 内 135-146 bp + 3855 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 2 51311610-51320357(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGCGA
SmilChr01G000326 Chr01 NC_080387.1:6568370-6568381promoter 内 117-128 bp - 3873 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 2 6559594-6564497(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTGTA
SmilChr03G001481 Chr03 NC_080389.1:17866600-17866611promoter 内 111-122 bp + 3879 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 2 17859817-17862721(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCAG
SmilChr01G005134 Chr01 NC_080387.1:69145200-69145211promoter 内 96-107 bp - 3894 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 2 69141234-69141306(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTGGA
SmilChr04G000991 Chr04 NC_080390.1:13589487-13589498promoter 内 64-75 bp + 3926 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 2 13584890-13585561(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCAG
SmilChr03G002302 Chr03 NC_080389.1:36237170-36237181promoter 内 38-49 bp + 3952 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 2 36241133-36243860(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTGTA
SmilChr04G001353 Chr04 NC_080390.1:21988404-21988415promoter 内 32-43 bp - 3958 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 2 21992373-21995259(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCAG
SmilChr02G001015 Chr02 NC_080388.1:17894211-17894222promoter 内 29-40 bp - 3961 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 2 17888415-17890250(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTGTA
SmilChr02G000913 Chr02 NC_080388.1:15788207-15788218promoter 内 27-38 bp + 3963 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 2 15792181-15792287(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTGTA
SmilChr03G001999 Chr03 NC_080389.1:29713042-29713053promoter 内 16-27 bp + 3974 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 2 29717027-29718523(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTGTA
SmilChr08G003323 Chr08 NC_080394.1:34498712-34498723promoter 内 2708-2719 bp - 1282 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 1 34500005-34505128(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTCAT
SmilChr05G003754 Chr05 NC_080391.1:50721474-50721485promoter 内 1711-1722 bp + 2279 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 1 50716599-50719195(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGCGT
SmilChr05G004294 Chr05 NC_080391.1:56685207-56685218promoter 内 1666-1677 bp + 2324 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 1 56680717-56682883(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTCAT
SmilChr07G002068 Chr07 NC_080393.1:18807182-18807193promoter 内 3700-3711 bp - 290 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 4 18804770-18806892(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTGTA
SmilChr05G001375 Chr05 NC_080391.1:12266894-12266905promoter 内 3338-3349 bp - 652 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 2 12267557-12270283(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCGC
SmilChr07G002246 Chr07 NC_080393.1:20637927-20637938promoter 内 2860-2871 bp - 1130 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 2 20634440-20636797(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTGTA
SmilChr04G004040 Chr04 NC_080390.1:55635099-55635110promoter 内 670-681 bp - 3320 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 2 55638430-55642611(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCGC
SmilChr07G002247 Chr07 NC_080393.1:20637927-20637938promoter 内 448-459 bp - 3542 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 2 20641480-20646445(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGTCGC
SmilChr07G004246 Chr07 NC_080393.1:54901532-54901543promoter 内 3012-3023 bp - 978 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 54896553-54900554(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGCCAGCTGTT
SmilChr02G002439 Chr02 NC_080388.1:42595485-42595496promoter 内 2971-2982 bp - 1019 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 42596515-42599981(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGCGT
SmilChr06G001087 Chr06 NC_080392.1:10868865-10868876promoter 内 1712-1723 bp + 2278 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 10871154-10875393(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGCCAGCTGTT
SmilChr01G000728 Chr01 NC_080387.1:16193195-16193206promoter 内 1227-1238 bp + 2763 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 16188523-16190432(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGCGT
SmilChr07G001410 Chr07 NC_080393.1:10961200-10961211promoter 内 339-350 bp - 3651 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 5 10964862-10974237(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCAC
SmilChr03G000044 Chr03 NC_080389.1:493629-493640promoter 内 1941-1952 bp - 2049 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 4 487964-491580(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTGGA
SmilChr06G000685 Chr06 NC_080392.1:6058349-6058360promoter 内 3645-3656 bp + 345 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 2 6058705-6061755(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTGGA
SmilChr02G003500 Chr02 NC_080388.1:56211982-56211993promoter 内 2809-2820 bp - 1181 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 2 56206043-56210801(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTGGA
SmilChr08G001788 Chr08 NC_080394.1:15065900-15065911promoter 内 2714-2725 bp - 1276 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 2 15067187-15070674(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTCGA
SmilChr02G002308 Chr02 NC_080388.1:40693956-40693967promoter 内 2593-2604 bp - 1397 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 2 40695364-40701609(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCAC
SmilChr02G003554 Chr02 NC_080388.1:56724020-56724031promoter 内 2516-2527 bp - 1474 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 2 56717584-56722546(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTGGA
SmilChr01G001829 Chr01 NC_080387.1:33233348-33233359promoter 内 1931-1942 bp + 2059 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 2 33227865-33231289(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTCGA
SmilChr08G002940 Chr08 NC_080394.1:29419546-29419557promoter 内 1461-1472 bp - 2529 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 2 29412749-29417017(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTGAA
SmilChr08G001787 Chr08 NC_080394.1:15065900-15065911promoter 内 556-567 bp - 3434 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 2 15059742-15062466(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTGGA
SmilChr07G002988 Chr07 NC_080393.1:30460030-30460041promoter 内 3893-3904 bp + 97 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 30458226-30459933(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCAC
SmilChr08G002623 Chr08 NC_080394.1:25603478-25603489promoter 内 2721-2732 bp - 1269 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 25604758-25608437(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCAC
SmilChr01G005245 Chr01 NC_080387.1:69964242-69964253promoter 内 1107-1118 bp - 2883 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 69967136-69969848(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCAC
SmilChr01G001617 Chr01 NC_080387.1:30289956-30289967promoter 内 943-954 bp - 3047 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 1 30283607-30286909(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTGAA