转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004199; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010571-RA_Salv SmilChr01G004199 bHLH XP_057782208.1 MP00074 AGAAGGTCACGTGG

可能结合的靶基因

9969 个结合位点 7396 个候选靶基因 第 11 / 148 下载 TSV

上一页 11 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G000462 Chr01 NC_080387.1:9474411-9474424promoter 内 814-827 bp - 3174 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 9461883-9471237(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCGTGCCACGTGG
SmilChr06G002571 Chr06 NC_080392.1:36882005-36882018promoter 内 793-806 bp - 3195 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 36878702-36878810(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCGTGCCACGTGG
SmilChr04G001334 Chr04 NC_080390.1:21570859-21570872promoter 内 725-738 bp + 3263 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 21566754-21567596(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCACGCA
SmilChr03G002893 Chr03 NC_080389.1:45631992-45632005promoter 内 694-707 bp - 3294 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 45626127-45628698(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGAACGACACGTGG
SmilChr07G003715 Chr07 NC_080393.1:44940828-44940841promoter 内 656-669 bp - 3332 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 44944173-44945844(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCACGCA
SmilChr04G001315 Chr04 NC_080390.1:21060981-21060994promoter 内 647-660 bp + 3341 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 21056786-21057640(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCACGCA
SmilChr07G001990 Chr07 NC_080393.1:17548155-17548168promoter 内 625-638 bp + 3363 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 17551531-17553099(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGTAGGTCACGTGG
SmilChr02G003137 Chr02 NC_080388.1:52380208-52380221promoter 内 615-628 bp - 3373 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 52383594-52384469(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCACGCA
SmilChr03G001935 Chr03 NC_080389.1:27407160-27407173promoter 内 591-604 bp - 3397 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 27410570-27411523(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCACGCA
SmilChr06G002570 Chr06 NC_080392.1:36882005-36882018promoter 内 588-601 bp - 3400 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 36878506-36878605(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCGTGCCACGTGG
SmilChr06G001607 Chr06 NC_080392.1:17903726-17903739promoter 内 585-598 bp + 3403 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 17907142-17909770(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCGTGCCACGTGG
SmilChr05G002730 Chr05 NC_080391.1:31445641-31445654promoter 内 561-574 bp - 3427 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 31449081-31453089(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCACGCA
SmilChr03G001837 Chr03 NC_080389.1:25200983-25200996promoter 内 537-550 bp - 3451 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 25204447-25208084(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCACGCA
SmilChr03G003040 Chr03 NC_080389.1:47294053-47294066promoter 内 442-455 bp - 3546 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 47297612-47299289(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCACGCA
SmilChr06G002569 Chr06 NC_080392.1:36882005-36882018promoter 内 402-415 bp - 3586 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 36878324-36878419(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCGTGCCACGTGG
SmilChr06G001487 Chr06 NC_080392.1:15852580-15852593promoter 内 340-353 bp - 3648 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 15837745-15848932(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCGTGCCACGTGG
SmilChr05G002009 Chr05 NC_080391.1:20770843-20770856promoter 内 272-285 bp - 3716 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 20774572-20775817(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCACGCA
SmilChr07G004186 Chr07 NC_080393.1:53870477-53870490promoter 内 262-275 bp + 3726 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 53874216-53874340(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCGTGCCACGTGG
SmilChr05G002631 Chr05 NC_080391.1:29668480-29668493promoter 内 236-249 bp + 3752 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 29672245-29673624(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCGTGCCACGTGG
SmilChr03G003681 Chr03 NC_080389.1:55650847-55650860promoter 内 195-208 bp - 3793 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 55654653-55655777(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCACGCA
SmilChr06G001726 Chr06 NC_080392.1:19892897-19892910promoter 内 182-195 bp + 3806 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 19896716-19899644(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCGTGCCACGTGG
SmilChr05G003084 Chr05 NC_080391.1:39024577-39024590promoter 内 147-160 bp + 3841 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 39028431-39029726(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCGTGCCACGTGG
SmilChr02G002598 Chr02 NC_080388.1:45116242-45116255promoter 内 131-144 bp + 3857 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 45120112-45120184(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCGTGCCACGTGG
SmilChr01G000809 Chr01 NC_080387.1:17478744-17478757promoter 内 77-90 bp - 3911 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 17474079-17474833(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCGTGCCACGTGG
SmilChr04G001831 Chr04 NC_080390.1:29855958-29855971promoter 内 42-55 bp + 3946 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 29859917-29862172(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCGTGCCACGTGG
SmilChr02G003404 Chr02 NC_080388.1:55219247-55219260promoter 内 24-37 bp + 3964 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 55212150-55215283(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCACGCA
SmilChr02G000633 Chr02 NC_080388.1:9532334-9532347promoter 内 13-26 bp + 3975 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 9536322-9536798(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCGTGCCACGTGG
SmilChr03G000707 Chr03 NC_080389.1:7869156-7869169promoter 内 3932-3945 bp + 56 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 7864881-7869100(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCACCCA
SmilChr05G002515 Chr05 NC_080391.1:27915623-27915636promoter 内 3920-3933 bp + 68 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 27915704-27918856(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGTGCGACACGTGG
SmilChr07G003636 Chr07 NC_080393.1:43051631-43051644promoter 内 3877-3890 bp - 111 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 43051755-43056440(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCGTTCA
SmilChr03G002863 Chr03 NC_080389.1:45249280-45249293promoter 内 3581-3594 bp - 407 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 45249700-45250683(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCGTTCA
SmilChr07G001911 Chr07 NC_080393.1:16522982-16522995promoter 内 3521-3534 bp - 467 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 16523462-16524907(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGACGTCCC
SmilChr02G002932 Chr02 NC_080388.1:49806745-49806758promoter 内 3051-3064 bp + 937 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 49807695-49808444(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGGGTGTCACGTGA
SmilChr07G001758 Chr07 NC_080393.1:14888734-14888747promoter 内 2941-2954 bp + 1047 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 14889794-14892447(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGAAAGCCACGTGG
SmilChr04G003558 Chr04 NC_080390.1:51967292-51967305promoter 内 2893-2906 bp - 1095 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 51959817-51966197(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGCAGGTCACGTGC
SmilChr04G001011 Chr04 NC_080390.1:14102360-14102373promoter 内 2628-2641 bp - 1360 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 14099664-14101000(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAGGGGACACGTGG
SmilChr04G003559 Chr04 NC_080390.1:51967292-51967305promoter 内 2627-2640 bp - 1361 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 51968666-51970301(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGACCTGCG
SmilChr04G000996 Chr04 NC_080390.1:13790022-13790035promoter 内 2612-2625 bp - 1376 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 13787298-13788646(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAGGGGACACGTGG
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SmilChr07G000855 Chr07 NC_080393.1:6097692-6097705promoter 内 2312-2325 bp + 1676 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 6094459-6096016(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCCCCTT
SmilChr02G002931 Chr02 NC_080388.1:49806745-49806758promoter 内 2223-2236 bp + 1765 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 49802967-49804980(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGACACCCC
SmilChr04G000195 Chr04 NC_080390.1:1727006-1727019promoter 内 2125-2138 bp + 1863 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 1724233-1725143(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCCGTCC
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SmilChr07G004034 Chr07 NC_080393.1:51517994-51518007promoter 内 1711-1724 bp - 2277 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 51512828-51515717(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCGTGCCACGTGG
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SmilChr07G003531 Chr07 NC_080393.1:40613154-40613167promoter 内 1569-1582 bp - 2419 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 40603011-40610735(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGAACGACACGTGG
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SmilChr05G001645 Chr05 NC_080391.1:15415958-15415971promoter 内 1502-1515 bp + 2486 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 15418457-15421249(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGAACGACACGTGG